La Recherche de la GS LSH

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Exploring the brain - 6th scientific day of GS LSH

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Environment and Host Microbiomes - Functional Interactions

La Graduate School « Life Sciences and Health » (LSH) porte une vision intégrative des sciences de la vie, allant de la compréhension des mécanismes moléculaires de fonctionnement des systèmes biologiques et de leurs interactions, jusqu’à leur intégration à toutes les échelles, en incluant les dimensions évolutives, physiopathologiques et biotechnologiques. Elle s’intéresse à l’étude des mécanismes fondamentaux dans des modèles représentatifs de la biodiversité du vivant, avec des axes forts autour des micro-organismes, des plantes, des animaux et de l’Homme.

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La GS LSH regroupe plus de 2000 personnels permanents (chercheurs et enseignants-chercheurs et ITA) appartenant à 330 équipes de Recherche rattachées à plus de 70 Instituts ou Unités. Ces équipes couvrent un champ de Recherche très large allant de la biologie moléculaire et cellulaire la plus fondamentale jusqu’à la recherche médicale en passant par des recherches plus appliquées dans le domaine des biotechnologies et de la santé.

Le caractère multidisciplinaire ainsi que la taille de la GS LSH offrent l’opportunité, peut-être unique en France, de développer plusieurs champs de recherche transversale d’excellence allant du fondamental au biomédical avec une forte composante innovation. La diversité de mots-clés, des approches techniques et des concepts développés par les équipes de la GS LSH est un atout permettant la création de synergies par des partages de compétences et d’expertise.

La GS LSH fédère la plus large communauté scientifique concernée par les sciences du Vivant de l’Université Paris Saclay, par son positionnement généraliste, multidisciplinaire sur l’ensemble des sciences du vivant et de la santé, ainsi que par le nombre d'équipes rattachées/impliquées.

Les thématiques de recherche

Stratégie Recherche GS LSH 2022 - ( 620.08 Ko)

Au sein de la GS LSH, on recense 12 thématiques majeures de recherche portées par les graduate programs liant formation et recherche. L’ensemble contribue à une vision multi-échelle des Sciences de la Vie allant de la compréhension des mécanismes intimes du fonctionnement des systèmes biologiques et de leurs interactions, jusqu’à leur intégration au sein de l’organisme et des populations. Cette recherche inclut les dimensions évolutives, physiopathologiques et biotechnologiques.

Chaque équipe rattachée à la GS LSH s’identifie avec au moins un graduate program et plus de la moitié des équipes s’identifient avec au moins trois graduate programs. La taille (nombre d'équipes impliquées) et la relation entre les différentes graduate programs représente un réseau de thématiques de recherche transversale très bien consolidé.

Parmi ces 12 thématiques de Recherche la GS LSH a reconnu 5 axes de force structurés à savoir :

La biologie moléculaire, structurale et cellulaire

La recherche fondamentale en biologie moléculaire et cellulaire est bien implantée sur le campus de Paris-Saclay depuis de nombreuses années et engage près de la moitié des équipes de la GS LSH. L’originalité de cette biologie repose sur la diversité de ses modèles : microorganismes (incluant champignons, levures, bactéries, archées, virus), mammifères, insectes, nématodes et plantes. Cette biologie qui vise à décrypter les mécanismes intimes du vivant peut s’appuyer sur des plateformes technologiques de grande qualité en imagerie optique, spectrométrie de masse, séquençage haut débit, biophysique, etc.

La microbiologie et les maladies infectieuses

La microbiologie un thème transverse au sein de la GS porté par plus de 100 équipes. Dans la GS LSH, la microbiologie couvre un champ très vaste allant de l’étude des machineries des microorganismes et de leur métabolisme, jusqu’à la caractérisation des communautés microbiennes et des microbiotes, en passant par la caractérisation des interactions entre les microbes et leurs hôtes (qu’elles soient pathogènes ou symbiotiques). La recherche médicale et clinique sur les maladies infectieuses est aussi très présentes dans la GS LSH et se décline autour de quatre grands thèmes : i) Les infections virales ; ii) Les microbiotes de l’homme ; iii) Les bactéries multirésistantes ; iv) Compréhension et traitement du sepsis.

Les neurosciences

Les neurosciences constituent un axe très fort de l’Université Paris-Saclay. Les deux Instituts NeuroPSI (neurosciences fondamentales) et NeuroSpin (neurosciences cognitives et imagerie) ainsi que le Laboratoire des Maladies Neurodégénératives font pleinement partie de la GS LSH. Ses équipes qui ont souvent une forte réputation internationale développent une recherche intégrative qui caractérise le fonctionnement cérébral depuis l’échelle des molécules jusqu’à celle des réseaux neuronaux avec des axes forts et bien identifiés dans les domaines du développement, de l’évolution, et de la variabilité individuelle du système nerveux.

Le cancer

L’oncologie est un axe de force majeur grâce en particulier aux équipes de Gustave Roussy, premier centre anticancéreux Européen et aux liens avec des équipes de Curie dont certaines équipes de recherche sont installées sur Orsay. Plusieurs équipes font ainsi partie des leaders mondiaux dans les domaines des immunothérapies, de l’approche personnalisée du cancer ou de la radiothérapie. Les domaines de forces cités sont valorisés par des essais thérapeutiques, des publications de haut niveau et des collaborations croissantes et riches avec des composantes de Paris Saclay présentes dans la GS LSH.

Les maladies hépatiques

L’exploration des maladies hépatiques est l’un des axes de force dans la recherche médicale de la GS LSH. Le Centre Hépato-Biliaire basé à Paul Brousse a une visibilité internationale dans ce domaine et explore les différentes pathologies du foie. Cette recherche va d’études fondamentales jusqu’à la recherche clinique portant sur le traitement des hépatites virales, la greffe hépatique, le traitement de maladies rares du foie et la chirurgie hépatique.

D’autre part, la GS LSH a identifié 2 axes scientifiques en pleine expansion dont elle souhaite accompagner le développement:

La Santé globale (One Health)

Le concept One Health repose sur le principe que la santé de l’homme dépend de celle de l’animal, du végétal, de l’environnement et de leurs interconnections à différentes échelles. Au sein de la GS LSH, la santé globale est identifiée comme un enjeu transverse reliant les recherches fondamentales sur les maladies et les recherches translationnelles et cliniques en santé humaine. L’approche santé globale requiert la collaboration de multiples disciplines scientifiques (biologie bien sûr, mais aussi écologie, chimie, sciences de la terre, sciences humaines). Donc, pour mieux s’approprier le thème « santé globale », des liens sont à construire à plusieurs échelles : (i) avec les GS GS du domaine sciences de la vie, mais aussi Santé Publique, (ii) une implication dans l’alliance EUGLOH au niveau recherche et formation.

Biologie synthétique et bio-ingénierie

La biologie de synthèse est une science émergente qui allie la biologie, les mathématiques, l’informatique, la physique et la chimie afin de concevoir des applications nouvelles dans les secteurs des biotechnologies, de la santé, de la chimie, de l’alimentation, de l’agronomie et de l’environnement. Au sein de la GS LSH, les équipes travaillant dans la conception d’outils de design et d’apprentissage machine actif, de molécules bioactives innovantes, de châssis microbiens et de plantes pour la bio-production sont reconnues internationalement. Malgré des succès substantiels, une communauté scientifique de biologie de synthèse bien structurée, visible nationalement et ayant des liens forts avec les communautés biomédicales et de recherche de la GS LSH doit être consolide.

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Les communautés du périmètre GS LSH

La richesse de ses thématiques et les nombreuses collaborations déjà établies avec des équipes (de Paris-Saclay ou d’ailleurs) travaillant dans les domaines de la chimie, de la physique ou de l’informatique positionnent la GS LSH à l’interface avec d’autres disciplines portées par d’autres GS. De nombreuses équipes de la GS LSH contribuent au projet de plusieurs objets interdisciplinaires (OIs) soutenant une recherche qui se développe au plus près d’enjeux scientifiques et sociétaux majeurs.

La GS LSH soutient de façon privilégiée les OIs HubPASREL, LivingMachines@Work, MICROBES et New Frontiers in Cancer tient des fortes interactions avec 10 OIs :

Bioprobe : Combining physics and chemistry to explore life
BrainViews : Towards an integrated view of normal and pathological brain function - from cell to brain
C-BASC : Center for interdisciplinary studies on Biodiversity, Agroecology, Society and Climate
INanoTheRad : Ionizing radiation against cancer
H-Code : Human-Computer Interfaces
HEALTHI : Health and Therapeutic Innovation
Hub PASREL : PAris Saclay formation REsearch & hospitaL
LivingMachines@Work : Understanding the fundamental mechanisms in Life Sciences and innovating in Health and Biotechnology
Metabiodivex : Chemistry of natural substances
MICROBES : Center for Interdisciplinary Microbial Sciences @Paris-Saclay
New Frontiers in Cancer : Promouvoir des approches originales et novatrices en cancérologie à tous les stades, depuis la prévention aux soins médicaux et paramédicaux, jusqu’au suivi post-cancer.

La GS LSH regroupe environ 1360 chercheurs et enseignants-chercheurs et 680 ITA appartenant à plus de 330 équipes de recherche travaillant au sein de 75 Unités et/ou Instituts.

Ces équipes de recherche s’identifie avec au moins un graduate program et plus de la moitié des équipes s’identifient avec au moins trois graduate programs.

Liste d’équipes associées à chaque par graduate program

Ci-dessous la liste (par ordre alphabétique) des laboratoires rattachés à la GS LSH :

Approches génétiques intégrées et nouvelles thérapies pour les maladies rares (UMR-S 951)