Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement

Présentation du laboratoire

L'unité de recherche MaIAGE regroupe des mathématiciens, des informaticiens, des bioinformaticiens et des biologistes autour de questions de biologie et agro-écologie, allant de l'échelle moléculaire à l'échelle du paysage en passant par l'étude de l'individu, de populations ou d'écosystèmes. L'unité développe des méthodes mathématiques et informatiques motivées par des problèmes biologiques précis. Elle s'implique aussi dans la mise à disposition de bases de données et de logiciels permettant aux biologistes d'utiliser les outils dans de bonnes conditions ou d'exploiter automatiquement la littérature scientifique.
L'inférence statistique et la modélisation dynamique sont des compétences fortes de l'unité, auxquelles s'ajoutent la bioinformatique, l'automatique et l'algorithmique. Les activités de recherche et d'ingénierie s'appuient également sur une forte implication dans les disciplines destinatrices : écologie, environnement, biologie moléculaire et biologie des systèmes.

Les 20 dernières publications

Titre Auteurs Date de publication Source
Altered spinogenesis in iPSC-derived cortical neurons from patients with autism carrying de novo SHANK3 mutations Gwenaëlle André-Leroux 01/12/2019 Scientific Reports
Metabolic therapies inhibit tumor growth in vivo and in silico Sabine Peres 01/12/2019 Scientific Reports
A Guide for Ex Vivo Handling and Storage of Stool Samples Intended for Fecal Microbiota Transplantation Anne Laure Abraham, Olivier David 01/12/2019 Scientific Reports
The polyphagous plant pathogenic fungus Botrytis cinerea encompasses host-specialized and generalist populations Florence Carpentier 01/12/2019 Environmental Microbiology
Length and Mean Value Theorem in Norm are the flip sides of the same coin Vincent Fromion 01/12/2019 Proceedings of the IEEE Conference on Decision and Control
On Ⅎ2, the set of Lipschitz continuous operators is a set of first category in the set of uniformly continuous operators Vincent Fromion 01/12/2019 Proceedings of the IEEE Conference on Decision and Control
A RBA model for the chemostat modeling Vincent Fromion, Marc Dinh 01/12/2019 Proceedings of the IEEE Conference on Decision and Control
Biofilm Formation of Listeria monocytogenes Strains Under Food Processing Environments and Pan-Genome-Wide Association Study Ibrahim Sultan 21/11/2019 Frontiers in Microbiology
Genetic and metabolic signatures of Salmonella enterica subsp. enterica associated with animal sources at the pangenomic scale Mahendra Mariadassou, Philippe Bessières, Meryl Vila Nova 06/11/2019 BMC Genomics
Steatosis and gut microbiota dysbiosis induced by high-fat diet are reversed by 1-week chow diet administration Mahendra Mariadassou 01/11/2019 Nutrition Research
Exploring Listeria monocytogenes transcriptomes in correlation with divergence of lineages and virulence as measured in Galleria mellonella Cyprien Guérin, Pierre Nicolas 01/11/2019 Applied and Environmental Microbiology
Bioinformatics Tools and Workflow to Select Blood Biomarkers for Early Cancer Diagnosis: An Application to Pancreatic Cancer Valentin Loux, David Christiany 01/11/2019 Proteomics
Constraining kernel estimators in semiparametric copula mixture models Gildas Mazo 01/10/2019 Computational Statistics and Data Analysis
Estimation of individual starch granule swelling under hydro-thermal treatment François Deslandes 01/10/2019 Food Structure
Parameter balancing: Consistent parameter sets for kinetic metabolic models Wolfram Liebermeister 01/10/2019 Bioinformatics
Automated generation of bacterial resource allocation models Anne Goelzer, Vincent Fromion, Laurent Tournier, ... 01/09/2019 Metabolic Engineering
Unraveling the effects of the gut microbiota composition and function on horse endurance physiology Sandra Plancade 01/12/2019 Scientific reports
Asymptotic distribution of likelihood ratio test statistics for variance components in nonlinear mixed effects models Estelle Kuhn 01/07/2019 Computational Statistics and Data Analysis
Spatiotemporal dynamics of fungicide resistance in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici in France Olivier David, Florence Carpentier, Maxime Garnault 01/07/2019 Pest Management Science
Influence of experimental design on decentralized, on-farm evaluation of populations: a simulation study Olivier David 01/07/2019 Euphytica