Metagenopolis

Présentation du laboratoire

Le centre MetaGenoPolis (MGP) étudie l'impact de l'alimentation sur le microbiote intestinal (humain et animal), et l'impact de ce dernier sur la santé et la maladie. Il met à disposition de la communauté médicale, de la recherche et de l'industrie les dernières avancées sur la connaissance de ce microbiote grâce à sa grande expertise en métagénomique quantitative et fonctionnelle. MGP a développé de nombreuses autres expertises notamment dans la standardisation des procedures certifiée par un label ISO9001. Cette approche intégrée est construite sur les connaissances établies par le projet Européen MetaHIT, publiées notamment dans le journal Nature (establishment of a broad gene catalogue of the human intestinal metagenome et discovery of the three human enterotypes), ainsi que la caractérisation du microbiote intestinal pour deux maladies chroniques (obésité et maladie inflammatoire des intestins) et les premiers criblages haut-débit de banques métagénomiques en vue d'une analyse fonctionnelle. Les principaux domaines de recherche de MetaGenoPolis sont la nutrition et le domaine médical. Actuellement, MGP travaille sur 16 projets : 12 projets industriels et 4 projets européens.

Les 20 dernières publications

Titre Auteurs Date de publication Source
Identification of the novel role of butyrate as AhR ligand in human intestinal epithelial cells Hervé M. Blottière 01/12/2019 Scientific reports
A Guide for Ex Vivo Handling and Storage of Stool Samples Intended for Fecal Microbiota Transplantation Joel Dore, Florence Levenez, Hervé M. Blottière, ... 01/12/2019 Scientific Reports
Microbiota-gut brain axis involvement in neuropsychiatric disorders Hervé M. Blottière 03/10/2019 Expert Review of Neurotherapeutics
MSPminer: abundance-based reconstitution of microbial pan-genomes from shotgun metagenomic data Emmanuelle Le Chatelier, S. Dusko Ehrlich, Mathieu Almeida, ... 01/05/2019 Bioinformatics (Oxford, England)
Prediction of the intestinal resistome by a three-dimensional structure-based method Joel Dore, Sean Kennedy, S. Dusko Ehrlich, ... 01/01/2019 Nature Microbiology
Identification of rumen microbial biomarkers linked to methane emission in Holstein dairy cows Nicolas Pons, Hugo Roume, Dusko Ehrlich 01/01/2020 Journal of Animal Breeding and Genetics
SCFAs strongly stimulate PYY production in human enteroendocrine cells Joel Dore, Hervé M. Blottière 01/12/2018 Scientific Reports
Butyrate produced by gut commensal bacteria activates TGF-beta1 expression through the transcription factor SP1 in human intestinal epithelial cells Hervé M. Blottière 01/12/2018 Scientific Reports
Nitrogen cycle microorganisms can be reactivated after Space exposure Hugo Roume 01/12/2018 Scientific Reports
Mucin degradation niche as a driver of microbiome composition and Akkermansia muciniphila abundance in a dynamic gut model is donor independent Hugo Roume 01/12/2018 FEMS Microbiology Ecology
Fecal chromogranins and secretogranins are linked to the fecal and mucosal intestinal bacterial composition of IBS patients and healthy subjects Joel Dore 01/12/2018 Scientific Reports
New medical devices and manufacturing process for a safe, standardized, and ready-to-use fecal microbiota transfer via enema Joel Dore, Florence Levenez, Hervé M. Blottière 01/06/2018 Journal de Pharmacie Clinique
Microbial ecology perturbation in human IgA deficiency Emmanuelle Le Chatelier, Joel Dore, Sean Kennedy, ... 02/05/2018 Science Translational Medicine
Humans as holobionts: implications for prevention and therapy Joel Dore, Hervé M. Blottière 01/05/2018 Microbiome
Indole, a signaling molecule produced by the gut microbiota, negatively impacts emotional behaviors in rats Nicolas Pons 09/04/2018 Frontiers in Neuroscience
Identification of new factors modulating adhesion abilities of the pioneer commensal bacterium Streptococcus salivarius Nicolas Pons, Benoît Quinquis 20/02/2018 Frontiers in Microbiology
Protection of the human gut microbiome from antibiotics Emmanuelle Le Chatelier, Sean Kennedy, Nicolas Pons, ... 15/02/2018 Journal of Infectious Diseases
Localized high abundance of Marine Group II archaea in the subtropical Pearl River Estuary: implications for their niche adaptation Senthil K. Murugapiran 01/02/2018 Environmental Microbiology
In-depth resistome analysis by targeted metagenomics Sean Kennedy, S. Dusko Ehrlich, E. Ruppé 01/01/2018 Microbiome
Health relevance of the modification of low grade inflammation in ageing (inflammageing) and the role of nutrition Joel Dore 01/11/2017 Ageing Research Reviews