Graduate Program Bioinformatics
Le Graduate Program Bioinformatics fédère et anime les mentions de Masters, les écoles doctorales et les équipes de Recherche de l’Université Paris-Saclay en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques pour l’analyse des données et la modélisation en Sciences de la Vie, Biotechnologies et Agronomie. Les thématiques abordées vont de la description et de la prédiction du comportement des systèmes biologiques, à la dynamique structurale, en passant par l’intégration multi-échelle des données (Big Data et Intelligence Artificielle) et par le développement de méthodes et d’algorithmes originaux pour l’analyse et la modélisation de données biologiques.
Mots-clés : Algorithmes ; Base de données ; Big Data ; Bioinformatique ; Biologie computationnelle ; Biologie des systèmes ; Biologie structurale ; Biostatistique ; Biotechnologies ; Génomique ; Intelligence artificielle ; Modélisation ; Programmation ; Sciences des données
Parcours de Master
Les parcours de Master du Graduate Program Bioinformatics sont portés par la Mention de Bioinformatique de l’Université Paris-Saclay. Cette mention est axée sur les besoins en recherche et développement de haut niveau des entreprises et des organismes de Recherche en Bioinformatique et Biomathématiques en Sciences du Vivant, Biotechnologies et Agronomie.
Par nature interdisciplinaire, à l’interface entre Informatique et Biologie, la Mention de Bioinformatique est rattachée à la fois à la Graduate School Life Sciences & Health et à la Graduate School Computer Sciences.
- M1 Bio-informatique et Biostatistiques
- M1 Genomics, Informatics & Mathematics for Health & Environment (dont une partie des enseignements sont en anglais )
Chacun de ces parcours de M1 permet un accès aux deux parcours de M2
Ecoles doctorales de la Graduate School Life Sciences & Health rattachées au Graduate Program Bioinformatics
- ED « Structure et Dynamique des Systèmes Vivants » (SDSV, ED 577)
- ED « Signalisations et réseaux intégratifs en Biologie » (BIOSIGNE, ED 568)
- ED « Cancérologie, Biologie, Médecine, Santé » (CBMS, ED 582)
- ED « Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement » (ABIES, ED 581)
- ED « Sciences du végétal : du gène à l’écosystème » (SEVE, ED 567)
Forces de Recherche du Graduate Program Bioinformatics :
- Plus de 35 Laboratoires de Recherche
- Plus de 80 équipes de Recherche ou plateformes
- Consortium Psay CompBio (Paris-Saclay Computational Biology), rassemblant plus d’une centaine de scientifiques actifs dans le domaine de la Biologie computationnelle (Instituts: I2BC, Neurospin, NeuroPSI, Moulon, SPS, UNIC, IBISC, MaIAGE, IJPB, LRI, LMME, LIMSI, Gustave Roussy, Paul Brousse, LERMIT, IPS2)
Liste des équipes de Recherche
Contacts : Daniel Gautheret, Marie-Laure Martin-Magniette (IPS2), Sarah Cohen-Boulakia (LRI), Vincent Frouin (CEA Neurospin)
Paris-Saclay Center for Data Sciences
Les forces Enseignement-Recherche-Innovation de ce Graduate Program sont particulièrement impliquées dans les actions transverses :
- LivingMachines@Work (Comprendre les mécanismes moléculaires fondamentaux du Vivant pour innover dans les domaines de la Santé et des Biotechnologies)
- MICROBES (Center for Interdisciplinary Microbial Sciences @Paris-Saclay)
- ISIT (Institut de Recherche en Santé et en Innovation Thérapeutique)
- METAHEALTH (Fédération pluridisciplinaire autour d’une vision intégrée de la santé incluant l’homme, l’animal, les écosystèmes et les enjeux sociétaux)
- Paris-Saclay Center for Data Sciences