Les candidatures en M1 se font sur MonMaster du 26 février au 24 mars (https://www.monmaster.gouv.fr/) sauf pour le public concerné par la procédure dérogatoire et qui doit candidater sur INCEPTION aux dates indiquées sur cette page.
L’objectif de la formation est de former aux sciences animales appliquées, par une approche intégrative de la biologie, incluant principalement la génétique, la physiologie et le comportement. Il s’agit également de former les étudiants aux enjeux des questions animales depuis les espèces sauvages jusqu’aux espèces domestiquées (animaux d’élevage et de compagnie).
Lieu(x) d'enseignement
PALAISEAU
Pré-requis, profil d’entrée permettant d'intégrer la formation
Licence en Sciences du vivant
Motivation pour les sciences animales et les enjeux associés
Compétences
Identifier les enjeux scientifiques et techniques du secteur des sciences animales.
Piloter le fonctionnement de l’animal pour améliorer son efficacité biologique (nutrition, reproduction, ressources génétiques et amélioration génétique).
Expliquer l'organisation spatio-temporelle des animaux et les spécificités physiologiques des différentes espèces animales ; modéliser ces processus à différentes échelles.
Élaborer de façon semi autonome un protocole expérimental afin d’expérimentation; analyser de façon autonome les données pour élaborer des propositions de conclusions.
Compiler la diversité des informations scientifiques pour en faire une synthèse écrite ou orale.
Débouchés de la formation
Le M1 BIP animal ne procure pas de débouché en soi, il est associé au M2 PRIAM pour constituer un parcours de formation dans les sciences animales.
Programme
Le S1 est constitué du TC du M1 et des UC spécifiques obligatires de la plateforme Animale.
8 créneaux de 3h, dont 2 TD dédoublés en demi-groupes (1 en salle informatique).
- Cours introductif (3h) : principales notions de génétique des populations.
- TD (3h) : influence des régimes de reproduction sur la diversité génétique.
- TD info (3h) : effet de la sélection et de la dérive sur l’évolution des populations.
- TD (3h) : balance entre mutation et sélection, cryptopolymorphisme.
- TD (3h) : le polymorphisme en populations naturelles. Examen blanc.
- Cours (3h) : diversité des animaux d’élevage.
- Cours (3h) : diversité des plantes cultivées.
- Cours (3h) : origine de la biodiversité spécifique, processus de spéciation.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Objectifs:
Ce module a pour but de présenter la notion de biodiversité dans son ensemble avec une emphase particulière sur son aspect génétique. Elle sera dans un premier temps introduite d'un point de vue historique et conceptuel puis étudiée d'un point de vue appliqué en distinguant ses composantes (diversité des populations naturelles, cultivées, d’élevage), et enfin seront abordés les processus à l’origine de la diversification biologique (spéciation). La première partie du module portera sur la révision et la consolidation des bases de la génétique des populations, au cours de laquelle les étudiants réfléchiront sur les mécanismes évolutifs générant de la diversité génétique au travers d’exemples concrets sous forme de problèmes et de simulations informatiques (séquence comprenant une séance de cours et 4 séances de TD dont une sur ordinateur, avec un examen blanc en fin de séquence). La deuxième partie portera sur des aspects appliqués des notions étudiées dans la première séquence, concernant la diversité des plantes cultivées et des animaux d’élevage, ainsi que le processus de divergence spécifique à l’origine de la diversité d’espèces dans les populations naturelles (séquence de 3 cours/conférences).
Prérequis :
Aucun.
Bibliographie :
- Henry JP & Gouyon PH, Précis de génétique des populations, Ed Dunod
- Rossignol JL et al, Génétique. Gènes et génomes, Ed Dunod.
Loïc Rajjou, Pr AgroParisTech (coordinateur)
Alia Dellagi, Pr AgroParisTech
Karine Alix, Pr AgroParisTech
Lelandais Christine, MCU, Université de Paris
Majeran Wojciek, MCU, Université de Paris
Annick Méjean, PR, Université de Paris
Nicolas Meunier, MCU, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
Olivier Sandra, Chercheur, INRA
Eric Pailhoux, Chercheur, INRA.
Déroulement et organisation pratique :
Les cours abordent les grandes fonctions physiologiques chez les végétaux, les animaux et les microorganismes, mettant en évidence la diversité et l’évolution des organismes vivants, les adaptations ou spéciations : Métabolisme carboné chez les microorganismes et chez les plantes, reproduction animale et végétale, respiration animale, interactions hôte-pathogène.
Les trois séances de TD sont dédiées à la réalisation d’une affiche à partir d’un article scientifique présentant des approches pluridisciplinaires en physiologie. Une journée est consacrée à la présentation orale (au choix en anglais ou en français) des affiches écrites en anglais. A l’issue de cette journée, le prix de la meilleure affiche est décerné par le jury constitué de l’ensemble des étudiants.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Cette UE a pour objectif d’illustrer la diversité des processus physiologiques mis en oeuvre par les organismes vivants. Des exemples de fonctions physiologiques associées à des adaptations ou des spéciations seront illustrés aussi bien chez les procaryotes que chez les eucaryotes. L’accent sera mis sur les approches pluridisciplinaires qui permettent d’étudier ces mécanismes physiologiques à diverses échelles (organe, organisme, population). A travers la réalisation d’une affiche, les étudiants seront aussi formés à la recherche bibliographique et la communication scientifique.
Contenu
Cours/conférences : 16,5h
Cours (13,5h) : Diversité et évolution des organismes vivants, grandes fonctions associées à des adaptations ou spéciations, approches pluridisciplinaires en physiologie (3h), Métabolisme carboné chez les microorganismes (3h) et chez les plantes (1,5h), reproduction végétale (1,5h), respiration animale (3h) et interactions hôte-pathogène (1,5h)
Conférences (3h) : Reproduction animale
TD : réalisation d’une affiche scientifique (7,5h)
Au terme de cette UE, l’étudiant pourra reconnaître et comparer les grandes fonctions physiologiques au sein des différents règnes et les illustrer par quelques exemples d’adaptations ou de spéciations; pourra décrire et analyser les résultats obtenus avec différentes méthodologies s’appliquant à diverses échelles (organe, organisme, population) et traduisant une approche interdisciplinaire de la physiologie.
Prérequis :
Bases de physiologie et de métabolisme niveau licence sciences de la vie ou sciences de la vie et de la terre.
HEAMS, Thomas, MC AgroParisTech
intervenants ponctuels.
Déroulement et organisation pratique :
Contenu:
Sont abordées les questions suivantes :
• Le concept de méthode scientifique à travers les âges.
• Créer de la vie : defi technique ou défi théorique ?
• Qu'y a-t-il derrière un concept : histoire de la notion de programme génétique.
• Histoire des réceptions critiques du darwinisme.
• Doute nécessaire, doute instrumentalisé : le scientifique face à l'inconnu.
• Qu'est-ce qu'une imposture scientifique ?
Évaluation: Présentation orale ou écrite - Assiduité et participation
• Science et société : nouvelles formes d'expertise, panels citoyens, débats public.
• Regards de philosophe sur l'Animal.
Conférences par des enseignants d'AgroParisTech ou invités-
Etudes de textes et documents audiovisuels – Débats – Présentations Orales.
Développement de la démarche critique et de l'esprit de curiosité scientifique.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Objectifs:
L'histoire et la philosophie des sciences sont un complément nécessaire à la formation de l'esprit scientifique.
L'objectif de cet enseignement est de proposer une introduction à ces domaines, par le biais d'études de cas choisis dans les sciences du vivant. Il s'agit de développer une réflexion critique et autonome sur les méthodes et les objets de la science en général et de la biologie en particulier.
Moussa Benhamed Pr Université de Paris (coordinateur)
Jean-Luc Ferat MC Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (coordinateur)
Bénédicte Sturbois Pr Université d’Evry Val d’Essonne (coordinateur)
Equipe pédagogique :
Karine Alix, Pr AgroParisTech
Moussa Benhamed, Pr Université de Paris
Jean-Luc Ferat, MC Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
Sophie Filleur, MC Université de Paris
Florence Garnier, MC Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
Marc Nadal, Pr Université de Paris
Bénédicte Sturbois Pr Université d’Evry Val d’Essonne.
Déroulement et organisation pratique :
En TD (9h) seront abordées les notions de gène et combinaison modulaire, duplication des génomes chez les eucaryotes, modification des histones et expression des gènes.
Cours magistraux pour définir les concepts nouveaux. TD de réflexion sur les concepts vus en cours ou exercices de mobilisation des connaissances pendant les cours.
Objectifs :
Acquérir les connaissances fondamentales de l’organisation des génomes de bactéries, d’archées et d’eucaryotes. Connaître les principaux mécanismes impliqués dans l’évolution structurale des génomes et dans la dynamique de régulation de leur expression.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Contenu :
1. Organisation des génomes de bactéries, d’archées et d’eucaryotes (6h). On insistera sur les spécificités des génomes de chaque domaine du vivant en cherchant à mettre en évidence leurs similarités et leurs différences. Les compartiments codants et non-codants du génome seront décrits en détail, et présentés comme jouant un rôle majeur dans la création de diversité génomique. Les méthodes de séquençage nouvelle génération sont abordées ainsi que leurs applications. Les dernières connaissances acquises sur les génomes des virus et mégavirus seront exposées.
2. Introduction à la dynamique des génomes (4,5h) : caractérisation des processus impliqués dans la dynamique structurale des génomes (recombinaison, duplication, transposition dans l’évolution des structures chromosomiques).
3. Relations entre structure des génomes et expression des gènes (4,5h). Organisation des gènes (domaines protéiques) ; organisation chromatinienne (euchromatine, hétérochromatine) ; expression des gènes (modification d’histones) ; épissage alternatif.
Elodie Marchadier, MC Université Paris Sud
Sébastien Ollier, MC Université Paris Sud.
Déroulement et organisation pratique :
Tout l’enseignement, cours et travaux pratiques (en salles informatique) est obligatoire et présentiel.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
L’objectif est d’apporter aux étudiants quelques notions de statistiques non développées en L, tout en restant dans les limites de ce qui peut être raisonnablement acquis dans le temps d’un module court. L’accent est mis sur les tests statistiques paramétriques.
Contenu :
Cours + exercices sur Excel et R (Rcmdr).
T. Heams (MC, AgroParisTech) et P. Calvel (MC, AgroParisTech) responsables
Véronique Duranthon (INRA BDR)
Catherine Patrat (APHP)
Nelly Frydman (APHP)
Charles Durand (UPMC).
Déroulement et organisation pratique :
Les étudiants devront être capable d’expliquer les étapes essentielles de la reproduction et du développement animal grâce:
-Les visites sur le terrain ainsi que les entretiens et cours permettront aux étudiants d’observer les techniques et outils associés à la manipulation de l’embryon humain et animal, et de contextualiser leurs applications dans le domaine médical, vétérinaire ou de la recherche.
-Grâce aux discussions avec les intervenants, les étudiants devront parvenir à analyser les cadres règlementaires et éthiques dans lesquels les acteurs du domaine évoluent en France et dans le monde, afin d’identifier les menaces et opportunités auxquelles ils font face.
-A l’issue du module, les étudiants seront capable d’exposer et défendre auprès de leurs pairs une réflexion personnelle sur une question de leur choix, en lien avec l’embryon.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
L'UC apportera des connaissances biologiques tout autant qu'un regard critique sur ces connaissances. Parmi les apports techniques : FIV, ICSI, cryoconservation, diagnostic pré-implantatoire, génomique fonctionnelle appliquée à l'embryon, cellules souches, transplantation. Pour l'analyse critique : table ronde autour de philosophes, juristes et acteurs de la recherche et de la réflexion bioéthique sur l'embryon.
Objectifs pédagogiques
Grâce à l'intervention de chercheurs, médecins, juristes et philosophes, on dressera sous plusieurs angles un état des lieux des biotechnologies appliquées à l'embryon humain et animal: procréation médicalement assistée, cryoconservation, génotypage, cellules souches embryonnaires, voire clonage et transgenèse. On s'interrogera sur les multiples enjeux de ces nouvelles biotechnologies.
C. Domange (MC, AgroParisTech), H. Erhard (MC, AgroParisTech), responsables
V. Berthelot (MC, AgroParisTech).
Déroulement et organisation pratique :
Tutorials / Visits / Lectures / Personal work /Debate/discussion/evaluation.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
The objectives of this EU are:
- to illustrate the different roles of animals today (breeding, company, biomedical research, ...) and the
new challenges in animal production (nutritional and health qualities of products, animal welfare,
protection of biodiversity, use of new biotechnology tools),
- to provide basic information on the different aspects of animal production and
- to acquire the basic English vocabulary of zootechnics.
Enseignants responsables : C. Gaudichon (Pr, AgroParisTech), V. Berthelot (MC, AgroParisTech).
Déroulement et organisation pratique :
Cours.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
L'objectif de cette UC est de comparer chez l'homme et chez l'animal les différents processus d'homéostasie permettant à l'organisme de s'adapter à des situations particulières ou critiques, telles que les situations d'effort, de synthèse intense ou de la sous alimentation et du jeûne. Dans ces situations la disponibilité des substrats devient limitante par rapport aux besoins et leur valorisation ainsi que leur distribution doit être optimisée. Certaines stratégies nutritionnelles sont alors susceptibles de favoriser cette optimisation.
Les thèmes suivants seront abordés : 1 Dynamique digestive et mise à disposition des nutriments (monogastriques, polygastriques) 2 Nutrition et efforts (chiens de traîneau, sportifs de haut niveau, treck....) 3. Epargne et déposition musculaire : statégies alimentaires. Adaptation à une production intense (production laitière). 4 Adaptation à la sous alimentation (sous alimentation dans les zones desertiques, jeûnes spirituels, jeûnes protestataires…).
P. Calvel (MC, APT), T. Heams (MC, APT), X Rognon (Pr, APT),.
Déroulement et organisation pratique :
Cours - Conférences - Visite de Centre de Recherche - Visite de Laboratoires d'Entreprises.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Les objectifs de cette UC sont : 1) de sensibiliser les étudiants à l'évolution rapide des biotechnologies animales et d'en mesurer les conséquences économiques, juridiques, mais également éthiques ; 2) de dresser un panorama des applications actuelles et potentielles des biotechnologies pour l'élevage et la recherche biomédicale ; 3) de dégager les voies d'avenir ou celles dont l'application potentielle permettra la plus grande marge de progrès sans compromettre les équilibres acquis (productions animales, qualité des produits, santé humaine, impact sur l'environnement).
C Loncke , Pierre Calvel et Ph Schmidely Coordinateurs
Ph. Schmidely (Pr) , V Berthelot (MC), K. SEMENOVSKAYA (MC), H Erhard (MC).
Déroulement et organisation pratique :
Les enseignements se déroulent à Paris (AgroParisTech) sur une période de 21 jours.
Les enseignements sont dispensés au travers de cours sur les bases de physiologie digestive et metabolique et leur déterminant génétique associés à des TD d'application. Des travaux personnels (projets) sous forme d'études bibliographiques associés à un controle de connaissances constituent les bases d'évaluation.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Maitriser les connaissances physiologiques concernant la digestion et le métabolisme des espèces animales de production afin d’optimiser leur fonctionnement en élevage. Maitriser les connaissances concernant le determinisme génétique des différences inter-espèces concernant le métabolisme. Ces connaissances seront envisagées au travers de 2 grandes fonctions de production que sont la croissance et la lactation.
Prérequis :
Aucun pré requis n'est demandé.
Bibliographie :
Une bibliographie spécifique en appui des travaux personnels étudiants est fournie.
Début septembre :Test de niveau
Septembre-Octobre-novembre : 8 semaines de TD de 3h et 3 semaines de TD de 2H suivi par une certification
Janvier : certification.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Techniques de la présentation orale en sciences, rédaction d'abstract, décrire des graphiques, des expériences, simulation d’une conférence scientifique avec interaction, introduction à la certification en anglais
Un groupe (15-20 étudiants de bon niveau peuvent participer à un program de communication interculturel.Il s’agit de 8 semaines de visioconférences avec des étudiants étrangers (voir www. soliya.net), suivi par un rapport écrit et une présentation orale.
Période(s) et lieu(x) d’enseignement :
Période(s) :
Septembre - Octobre - Novembre - Décembre - Janvier.
L. Fonbaustier, Pr, (U. Paris-Sud) ,
V. Daux, MC, Université Versailles Saint Quentin en Yvelines,
Benoît Gabrielle, MC, (AgroParisTech).
Déroulement et organisation pratique :
Contenu:
Les conférenciers sont des professionnels du monde académique ou privé bénéficiant d’une reconnaissance dans leur discipline. Les conférences se rapporteront aux thématiques suivantes :
Sociétés et environnement
Economie de l’environnement
Droit et politique de l’environnement
Aménagement du Territoire, géographie
Energies/Déchets
Ecologie et biodiversité
Biologie intégrative
Sécurité alimentaire
Santé et alimentation
Évaluation:
Rapports écrits sur les conférences, après tirage au sort du sujet à traiter. Pas de seconde session.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Objectifs:
Acquérir des bases sur les interactions entre « Biodiversité, Alimentation et agriculture, Société, Environnement » dans des disciplines connexes au domaine d’étude
Rencontrer des étudiants de formations différentes pour acquérir un vocabulaire et des références communes, échanger, s’enrichir mutuellement.
Compétences:
Etre capable d’interagir avec tous types de professionnels dans le domaine de l’environnement, du climat, de la biodiversité, de l’alimentation et de leurs interactions avec les sociétés. Posséder une vision large des questions environnementales, s’appuyant sur des connaissances diversifiées (scientifiques, juridiques, économiques, etc) et avoir, de ce fait, un recul par rapport à sa discipline d’origine.
Compétences complémentaires:
Compétences complémentaires acquises par l'étudiant durant cette UE :
- Capacité à synthétiser les principaux éléments d’un discours
- Capacité à présenter de manière concise sans excès de simplification des problématiques complexes dans ou en dehors du champ disciplinaire principal
- Expression orale (au travers des questions à énoncer en public ?)
Cette UE forme un ensemble qui vise à améliorer les capacités d’expression des étudiants tout en améliorant leur culture générale dans le domaine de l’Environnement.
Prérequis :
Pas de prérequis spécifiques. Les conférences seront de niveau « grand public » à « public avisé » de façon à ce que les étudiants de toutes les disciplines puissent tirer profit de leur participation aux séminaires.
Bibliographie :
La lecture des ouvrages auxquels il sera fait référence pendant les conférences est recommandée.
Lelandais-Brière Christine, Université de Paris (coordinateur)
Anita Boisramé, AgroParisTech ; Nathalie Boudet, Université Evry Val d'Essonne ; Véronique Brunaud (INRA) ; Jean-Luc Caccas, AgroParisTech ; Pierre Calvel, AgroParisTech ; Stéphane Chaillou, INRA ; Natalia Conde e Silva, U Paris-Sud/Paris-Saclay ; Marie Dufresne, U Paris Sud/Paris-Saclay ; Sophie Filleur, U . Paris ; Florence Garnier, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ; Sandrine Middendorp, U. Paris ; Sylvie Soues, U. Paris ; Bénédicte Sturbois, Université Evry Val d'Essonne ; Colin Tinsley, AgroParisTech ; Vincent Sauveplane, AgroParisTech.
Déroulement et organisation pratique :
L’UE s’organise de la façon suivante :
- Etude de l’accession (TP, salles informatiques, 21 h)
- Bases de bio-informatique (TP, salles informatiques, 12h)
- Comment étudier un gène ou une protéine ? méthodologies de biologie moléculaire (6h)
- Formalisme scientifique (6h TD).
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Au cours de cet enseignement, les étudiants apprendront à
1) rechercher de façon exhaustive puis synthétiser les informations accessibles dans les bases de données publiques concernant la structure et la fonction d'un gène d’intérêt (données bibliographiques et bases de données génomiques)
2) utiliser de façon raisonnée certains logiciels permettant l’analyse de séquences nucléotidiques et protéiques
3) identifier une question biologique pertinente à partir de leur synthèse
4) concevoir un mini-projet de recherche, destiné à répondre à cette question biologique et à approfondir les connaissances autour du gène et de sa fonction.
Prérequis :
Bon niveau de Licence générale en Sciences du vivant en biologie moléculaire, génétique et génomique,
anglais écrit, lu et parlé (niveau B1 ou B2?)
Bases de bioinformatique (analyse de séquence).
C. LELANDAIS, Université de Paris (coordinatrice)
K. ALIX, AgroParisTech
B. ALUNNI, Université Paris Sud
M. CREN-REISDORF, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
A. DELLAGI, AgroParisTech
Y. DEVEAUX, Université Paris Sud
JD FAURE, AgroParisTech
J. FIEVET, AgroParisTech
S. FILLEUR, Université de Paris
B. GAKIERE, Université Paris Sud (coordinateur)
M. GARMIER, Université Paris Sud
P. GERARD, AgroParisTech
A. GRATIAS-WEILL, Université Paris Sud
S. PFLIEGER, Université de Paris
L. RAJJOU, AgroParisTech
B. STURBOIS, Université Evry Val-d'Essonne
Jean-Luc Ferat (UVSQ) (coordinateur)
Florence Garnier (UVSQ)
Stéphane Chaillou (INRA Jouy)
Pierre Brézellec (UVSQ)
Pierre Calvel, AgroParisTech (coordinateur)
Philippe Schmidely, AgroParisTech
Christelle Loncke, AgroParisTech
Thomas Heams, AgroParisTech.
Déroulement et organisation pratique :
Evaluation : 50% écrit et 50% oral.
Stage en laboratoire ou en entreprise
(2 mois, de mi-avril à mi-juin).
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Contribuer à un projet de recherche en s'intégrant dans une équipe tout en faisant preuve d'autonomie et d'initiative ; mettre en œuvre une démarche scientifique pour répondre à une problématique donnée ; recueillir, analyser et synthétiser les informations de la bibliographie ; analyser et présenter à l'oral et à l'écrit des résultats expérimentaux.
Du sauvage au domestique : évolution, places et rôles de l'animal dans nos sociétés
Langues d’enseignement :
FR
ECTS :
3
Détail du volume horaire :
Cours :39
Travaux dirigés :5
Travaux pratiques :3
Modalités d'organisation et de suivi :
Coordinateur :
Equipe pédagogique :
C. Duvaux-Ponter (Pr, AgroParisTech), C. Domange (MC, AgroParisTech), H. Erhard (MC, AgroParisTech), X Rognon (Pr, AgroParisTech).
Déroulement et organisation pratique :
L’enseignement est dispensé sous forme de conférences (25h) et de visites (4 demi-journées - par exemple : élevage de cerfs, élevage de faisans, zoo, parc naturel, MNHN...).
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Montrer comment l'action de l'Homme sur l'animal à travers la domestication a pu modifier les populations animales (réduction du nombre et de la diversité des espèces et des races exploitées).
- Montrer comment l'Homme peut gérer ces évolutions (gestion et préservation de la faune sauvage et des ressources génétiques, apparition de nouvelles espèces en élevage).
- Aider les étudiants à réfléchir à leur perception de l'animal sauvage et domestique et à la place de l'animal dans les sociétés humaines.
Association de cours theoriques (metaanalyses, modélisation mecaniste des organismes vivants) et de travaux pratiques (cas concrets).
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Initier à la compréhension des systèmes complexes régulés que constituent les organismes animaux. Initier à l’approche de modélisation pour appréhender les articulations entre les différents niveaux d'organisation des systèmes vivants et leur contrôle.
Cette U.E. inclut une dimension quantitative aux connaissances de physiologie animale, en privilégiant l’animal d’élevage. La nutrition animale sera notamment abordée dans l’optique de l'approche dynamique des lois de réponse multiples de l'animal aux variations du régime alimentaire. Le volet modélisation, au sens statistique comme au sens prédictif du comportement d’un système sera abordé sous un aspect pratique et utilitaire dans le cadre de son application à la physiologie de la nutrition.
Mathieu Jules, Pr AgroParisTech
Agnès Ricroch, MC AgroParisTech
Vincent Sauveplane, MC AgroParisTech.
Déroulement et organisation pratique :
Cours – Conférences – TD – Travaux personnels.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Modifier, corriger, ré-écrire le génome et l'épigénome avec les nouveaux outils (épi)génétiques ouvrent ainsi la voie à des innovations des organismes vivants pour effectuer des nouvelles fonctions ou répondre à des stress de l’environnement. La combinaison d'approches de la génétique, de la biochimie, la biologie des systèmes et des analyses structurales permet aujourd'hui de mieux comprendre les phénomènes mendéliens et non mendéliens, l'expression génique et les dynamiques épigénomiques. La biologie de synthèse développe une approche de type ingénierie pour industrialiser le procédé de design de fragments d’ADN. Les recherches relatives à l'utilisation des nanotechnologies dans le monde du végétal seront commentées. Outre les techniques et les applications, l’aspect de la protection industrielle de ces innovations - open access, brevetabilité du vivant (y compris synthétique) - sera discuté. Des séances porteront sur la situation actuelle du secteur, des contextes techniques et concurrentiels, à travers des études de cas : défense des végétaux, production de médicaments… Des conférenciers du secteur public et industriel seront invités à venir témoigner ainsi que des entrepreneurs.
Bibliographie :
Plant Biotechnology - Experience and Future Prospects (2014). Ricroch, Fleischer & Chopra (Editors). Springer Publisher International
Au-delà des OGM (2018). Regnault-Roger, Houdebine & Ricroch (Editeurs). Les Presses des Mines – Académie d’agriculture de France.
Fabrice Lequeux (MC Université Paris Sud); Jean-Marc Seng (MC Université Paris Sud) ; Alain Berger (HCC ext); Martine Guillaud (HDD ext.).
Déroulement et organisation pratique :
Les enseignements se déroulent à Paris Sud (Orsay) sur une période de 15 jours (UE massée).
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
L'UE a été créée afin de permettre à tout étudiant en Sciences d'appréhender le monde économique et le monde de l'entreprise: après une série de conférences d'Economie générale, le monde de l'entreprise est présenté à travers les grandes fonctions de l'entreprise, de la multinationale à la start up.
Ces enseignements s'appuient sur des enseignants ayant une expérience de création et des professionnels.
Plantes et Insectes comme sources d'innovation pour une alimentation alternative
Langues d’enseignement :
FR
ECTS :
2
Détail du volume horaire :
Cours :10
Travaux dirigés :10
Modalités d'organisation et de suivi :
Coordinateur :Marion-Poll Frédéric
Equipe pédagogique :
Loïc Rajjou (PR, AgroParisTech) (coordinateur)
Equipe pédagogique :
Frédéric Marion-Poll (PR, AgroParisTech)
Loïc Rajjou (PR, AgroParisTech)
François Mariotti (PR, AgroParisTech)
Samir Mezdour (IR, AgroParisTech)
Philippe Le Gall (IRD-EGCE)
Denis Chereau (IMPROVE)
Thomas Lefebvre (Ynsect).
Déroulement et organisation pratique :
L’UE sera réalisée sous la forme d’une série de conférences, de travaux dirigés et un projet personnel réalisés par les étudiants.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
Dans un contexte de demande alimentaire croissante au niveau mondiale, un accent très fort est porté sur l’amélioration des rendements et de la productivité agricole. La production et la consommation de viande ne cessent d'augmenter sur la planète provoquant ainsi des effets indésirables sur l’environnement et sur la santé publique. Il est nécessaire d’envisager de nouvelles sources de protéines tant pour l’alimentation animale que pour la nutrition humaine. A partir d’une analyse des besoins nutritionnels, des aliments sur le marché et des projections disponibles concernant l’évolution à moyen terme de la consommation de protéines au niveau mondial, nous examinerons les solutions alternatives en utilisant de nouvelles sources protéiques provenant de plantes et d’insectes. Aussi, l’objectif sera de donner un panorama des déterminants génétiques, physiologiques, environnementaux afférents à la qualité de ces sources de protéines alternatives au travers de leurs modes de production. Cet enseignement illustrera la diversité génétique, les propriétés chimiques et les qualités technologiques et biotechnologiques des protéines de plantes et d’insectes. Cette analyse sera complétée par un examen de l’impact sur la santé et sur les opportunités de développements industriels et gastronomiques que représentent ces nouvelles sources de protéines.
Bibliographie :
Sabaté, J., &Soret, S. (2014). Sustainability of plant-based diets: back to the future. The American journal of clinical nutrition, 100(Supplement 1), 476S-482S.
van Huis, A. (2013). Potential of insects as food and feed in assuring food security. Annual Review of Entomology, 58, 563-583.
Outre quelques cours, cette UC est largement bâtie autour de la rencontre avec de nombreux professionnels : acteurs économiques (producteurs, transformateurs, représentants professionnels) et chercheurs, venant faire des présentations en salle ou lors de visites.
NB: les rencontres avec des experts du monde professionnel représentent les 3/4h de l'UC.
Objectifs pédagogiques visés :
Contenu :
* Donner les éléments-clés de compréhension du fonctionnement de la filière des produits aquatiques et les caractéristiques de sa dynamique à l'échelle mondiale, avec un focus particulier sur la situation française.
* Cerner l'état général des pêches mondiales, et des pêches françaises.
* Au travers d'exemples choisis traités par des experts du sujet, comprendre le fonctionnement de secteurs aquacoles, de la production aux marchés.
* Découvrir la transformation des produits aquatiques au travers d'exemples.
Tous les relevés de notes des années/semestres validés depuis le BAC à la date de la candidature.
Curriculum Vitae.
Descriptif détaillé et volume horaire des enseignements suivis depuis le début du cursus universitaire.
Pièces justificatives complémentaires
Coordonnées référents (obligatoire pour les candidats non internationaux).
Attestation de niveau d'anglais (obligatoire pour les non anglophones).
(Equivalent B1 (IELTS : entre 4 et 5 ; TOEIC : entre 550 et 760 ; TOEFL IBT : entre 42 et 71 ). A défaut de justificatif officiel, attestation de niveau B1 délivrée par le professeur d’Anglais ou relevé de notes précisant le niveau B1.)
Attestation de français (obligatoire pour les non francophones).
(Niveau B2 : étudiants non-francophones, attestation délivrée par les services de l'Ambassade de France ou par un organisme de formation linguistique français; les étudiants ayant validé un diplôme en langue française sont dispensés de cette attestation.)
Document justificatif des candidats exilés ayant un statut de réfugié, protection subsidiaire ou protection temporaire en France ou à l’étranger (facultatif mais recommandé, un seul document à fournir) :
- Carte de séjour mention réfugié du pays du premier asile
- OU récépissé mention réfugié du pays du premier asile
- OU document du Haut Commissariat des Nations unies pour les réfugiés reconnaissant le statut de réfugié
- OU récépissé mention réfugié délivré en France
- OU carte de séjour avec mention réfugié délivré en France
- OU document faisant état du statut de bénéficiaire de la protection subsidiaire en France ou à l’étranger.
