M1 Biologie Agrosciences Animales

Stage en laboratoire ou en entreprise, en France ou à l’étranger.

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Internship in a laboratory or in a private company, in France or abroad.

Contribuer à un projet de recherche en s'intégrant dans une équipe tout en faisant preuve d'autonomie et d'initiative ; mettre en œuvre une démarche scientifique pour répondre à une problématique donnée ; recueillir, analyser et synthétiser les informations de la bibliographie ; analyser et présenter à l'oral et à l'écrit des résultats expérimentaux.

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Contribute to a research project by working as part of a team while demonstrating autonomy and initiative; implement a scientific approach to address a given issue; collect, analyze, and synthesize information from the bibliography; analyze and present experimental results both in oral and written form.

Stage en laboratoire ou en entreprise, en France ou à l’étranger.
1 tuteur par étudiant (suivi recherche de stage et pendant le stage).

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Internship in a laboratory or in a private company, in France or abroad.
One tutor per student (support during the internship search and during the internship).

- Génétique des populations (15h) : principales notions de génétique des populations ; influence des régimes de reproduction sur la diversité génétique ; effet de la sélection et de la dérive sur l’évolution des populations ; balance entre mutation et sélection et cryptopolymorphisme ; origine de la biodiversité spécifique, processus de spéciation.

- Structure et évolution du génome eucaryote (4h30) : composants majeurs du génome, éléments transposables et diversité structurale et fonctionnelle, duplication de génome et innovation pour l’adaptation des espèces.

- Epigénétique (5h) : organisation chromatinienne (euchromatine, hétérochromatine) ; expression des gènes (modification des histones, méthylation de l’ADN) ; épissage alternatif.

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- Population genetics (15 hrs): main concepts of population genetics; influence of reproductive regimes on genetic diversity; effect of selection and drift on population evolution; balance between mutation and selection and cryptopolymorphism; origin of specific biodiversity, speciation processes.

- Structure and evolution of the eukaryotic genome (4.5 hrs): major components of the genome, transposable elements and structural and functional diversity, genome duplication and innovation for species adaptation.

- Epigenetics (5 hrs): chromatin organization (euchromatin, heterochromatin); gene expression (histone modification, DNA methylation); alternative splicing.

Ce module a pour but de présenter la notion de biodiversité dans son ensemble avec une emphase particulière sur son aspect génétique et génomique, en donnant une place importante aux bases de la génétique des populations et la compréhension de la dynamique d'évolution génétique d'une population. Il insiste aussi sur les principaux mécanismes impliqués dans l’évolution structurale des génomes et dans la dynamique de régulation de leur expression, en intégrant les mécanismes épigénétiques à l’origine de la diversité fonctionnelle.

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This module aims to present the concept of biodiversity, with a particular focus on genetic and genomic aspects, giving significant attention to the fundamentals of population genetics and understanding the dynamics of genetic evolution in a population. It also highlights the main mechanisms involved in the structural evolution of genomes and in the dynamics of their expression regulation, and includes the epigenetic mechanisms that generate functional diversity.

- Cours magistraux pour définir les concepts nouveaux.

- Exercices de mobilisation des connaissances pendant les cours ; TD de réflexion, associés aux CM, sur les concepts vus en cours.

- Atelier bibliographique avec présentation et discussion en classe, pour illustrer par des exemples les notions et concepts vus en CM.

- Projet tutoré (2h30) autour de l’analyse d’un article scientifique, intégrant les connaissances acquises durant le module, en utilisant le mind mapping pour structurer sa pensée et son discours en vue d’une présentation orale évaluée.

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- Lectures to define new concepts.

- Exercises to mobilize knowledge during lectures; tutorials, associated with lectures, on the concepts covered during lectures.

- Bibliographic study with presentation and discussion, to illustrate the notions and concepts covered in lectures with examples.

- Tutored project (2.5 hrs) based on the analysis of a scientific article, integrating the knowledge acquired during the course, using mind mapping to structure thoughts and discourse (evaluated during an oral presentation).

- Savoir résoudre un exercice de génétique des populations

- Expliquer les bases épigénétiques de la régulation de l’expression des gènes

- Décrire les processus de création de diversité des génomes eucaryotes

- Présenter de manière synthétique une étude scientifique et identifier les principaux résultats et conclusions à retenir en utilisant une carte heuristique

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- Solve a population genetics exercise

- Explain the epigenetic basis of gene expression regulation

- Describe the processes involved in the creation of diversity in eukaryotic genomes

- Present a scientific study in summary form and identify the main results and conclusions to be retained using a mind map

• Henry JP & Gouyon PH, Précis de génétique des populations, Ed Dunod - Rossignol JL et al, Génétique. Gènes et génomes, Ed Dunod.

Techniques de la présentation orale en sciences, rédaction d'abstracts, décrire des graphiques, des expériences, simulation d’une conférence scientifique avec interaction, introduction à la certification en anglais
Un groupe (15-20 étudiants de bon niveau peuvent participer à un programme de communication interculturel. Il s’agit de 8 semaines de visioconférences avec des étudiants étrangers (voir www. soliya.net), suivi par un rapport écrit et une présentation orale.

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Oral presentation techniques in science, techniques to write scientific abstracts and to describe graphs and experiments, simulation of an interactive scientific conference, introduction to certification in English
A group of 15-20 high-level students can participate in an intercultural communication program. This consists of eight weeks of videoconferences with foreign students (see www.soliya.net), followed by a written report and an oral presentation.

Début septembre :Test de niveau 

Septembre-Octobre-novembre : plusieurs séances de TD

Janvier : certification.

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Early September: test to check the level
September-October-November: several tutorial sessions
January: certification.

• Savoir présenter et participer à une conférence scientifique, appliquer les règles d’une communication écrite, obtenir le niveau B2 minimum lors de la certification en anglais
• Production orale et écrite, interaction à l'orale, compréhension de l'orale et de l'écrit
  Compétences complémentaires :
• savoir préparer et parler avec une prononciation adéquate (notamment des termes scientifiques)
  Savoir interagir avec le public de manière formelle lors de la séance de questions/réponses d’une conférence scientifique

-Savoir présenter avec un langage corporel approprié.

Sont abordées les questions suivantes :

• Le concept de méthode scientifique à travers les âges.
• Créer de la vie : défi technique ou défi théorique ?
• Qu'y a-t-il derrière un concept : histoire de la notion de programme génétique.
• Histoire des réceptions critiques du darwinisme.
• Doute nécessaire, doute instrumentalisé : le scientifique face à l'inconnu.
• Qu'est-ce qu'une imposture scientifique ?
• Science et société : nouvelles formes d'expertise, panels citoyens, débats public.
• Regards de philosophes sur l'Animal.

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The following questions are addressed:

• The concept of scientific method through the ages.
• Creating life: a technical challenge or a theoretical challenge?
• What lies behind a concept: history of the notion of genetic programs.
• History of critical reactions to Darwinism.
• Necessary doubt, instrumentalized doubt: scientists faced with the unknown.
• What is scientific fraud?
• Science and society: new forms of expertise, citizen panels, public debates.
• Philosophers' thoughts on animals.

Objectifs: L'histoire et la philosophie des sciences sont un complément nécessaire à la formation de l'esprit scientifique.

L'objectif de cet enseignement est de proposer une introduction à ces domaines, par le biais d'études de cas choisis dans les sciences du vivant.

Il s'agit de développer une réflexion critique et autonome sur les méthodes et les objets de la science en général et de la biologie en particulier.

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Objectives: The history and philosophy of science are a necessary complement to the development of scientific skills.

The aim of this course is to provide an introduction to these fields through case studies selected from the life sciences.

The goal is to develop critical and independent thinking about the methods and subjects of science in general and biology in particular.

Conférences, études de textes et documents audiovisuels,  débats, présentations orales.

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Lectures, text and audiovisual document studies,  debates, oral presentations.

• Développer un recul critique sur les questions scientifiques
• Maîtriser l'originalité de la démarche scientifique
• Acquérir une vision large des questions éthiques 
• Mettre en perspective les débats scientifiques contemporains au regard de l'histoire des sciences. 
• Préparer un exposé oral par de la bibliographie pertinente

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• Develop a critical perspective on scientific issues.
• Master the originality of the scientific approach.
• Develop a broad view of ethical issues.
• Put contemporary scientific debates into perspective in relation to the history of science.
• Prepare an oral presentation using relevant bibliography.

Bases de biologie moléculaire

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Fundamentals in molecular biology

Etude d'une accession (recherche dans les bases de données bibliographique et biologiques, analyses bioinformatiques) 

TP sur ordinateur et techniques de base en biologie moléculaire

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Study of an accession (searching bibliographic and biological databases, bioinformatic analyses)

Practical work on computers and basic techniques in molecular biology

Illustrer les principales méthodes permettant l'étude d'un gène ou une protéine (méthodes expérimental et outils in silico). Définir une question biologique pertinente à partir des données existantes sur un sujet scientifique.  Proposer un plan d'expérience. Etre en capacité de construire une requête sur des outils IA pour produire un résumé et d'être en capacité d'identifier les erreurs et les corriger. Être capable de produire une figure scientifique légendée et expliquée et de la présenter à l'oral.

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Illustrate the main methods used to study a gene or protein (experimental methods and in silico tools). Define a relevant biological question based on existing data on a scientific topic. Propose an experimental plan. Be able to construct a query on AI tools to produce a summary and be able to identify and correct errors. Be able to produce a scientific figure with captions and explanations and present it orally.

Projet tuteuré (chaque étudiant.e a pour mission d'étudier un gène ou une protéine, proposé par un.e chercheur.e). Il.elle réalise un état de l'art, effectue des analyses complémentaires (in silico) puis identifie une question biologique pertinente.

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Supervised project (each student studies a gene or protein suggested by a researcher). They review the current state of the art, perform additional analyses (in silico), and then identify a relevant biological question.

Effectuer une synthèse de données scientifiques; rechercher des sources fiables; présenter des résultats scientifiques, communiquer à l'oral; maîtriser les techniques de base de laboratoire de biologie et connaître les règles de sécurité

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Perform a synthesis of scientific data; search for reliable sources; present scientific results, communicate orally; master basic biology laboratory techniques and know safety rules

Fundamentals of physiology and metabolism at the bachelor's degree level

This unit begins with an introduction to metabolic diversity across prokaryotes and eukaryotes, establishing a foundation for understanding both universal features and key divergences. The central theme of the module is the study of metabolic responses and adaptations to environmental stress, providing a framework for a comparative approach across different biological kingdoms. The programme continues with an exploration of core metabolism, including carbon fixation, respiration, and energy production. These fundamental processes are examined within the context of their role in maintaining homeostasis and physiological performance under changing conditions. A dedicated strand focuses on specialised metabolic pathways, with particular emphasis on responses to oxidative, water, and nutrient stress. Illustrative case studies of metabolic adaptations in extremophilic bacteria, plants, and animals are used to highlight the diversity of evolutionary strategies and to explore the principle of inter-kingdom complementarity. Finally, the module concludes with an overview of modern approaches in metabolomics and integrative biology, which enable the analysis of metabolic and physiological responses to stress across multiple scales, from the cell to the whole organism.

The intended learning outcomes of this module are to achieve a comprehensive understanding of the major pathways of core metabolism (including carbon and nitrogen assimilation, respiration, energy, ...) and to develop the ability to identify and compare specialised metabolic processes that underpin physiological responses to environmental stresses. Students will also learn to relate these metabolic mechanisms to evolutionary adaptations across biological kingdoms such as prokaryotes, plants, and animals, and to evaluate evidence of metabolic complementarity between them. Additionally, the module aims to cultivate advanced competencies in the critical analysis of scientific literature and in the effective communication of research findings through the preparation and presentation of a scientific poster.

6 Lectures (CM): 9 hours
1 Tools session: 1.5 hours
3 Poster Tutorials (TD): 4.5 hours
The unit employs interactive lectures emphasising cross-kingdom comparisons. Teaching is informed by a multidisciplinary approach, integrating biochemistry, physiology, and evolutionary biology and metabolisms. A significant component involves collaborative work in small groups centred on the research and design of scientific posters.

- Demonstrate knowledge and understanding of key definitions and fundamental concepts.
- Articulate coherent reasoning concerning core metabolic pathways and metabolic adaptations to environmental stress across different biological kingdoms.
- Conduct a critical analysis of a grade-A scientific article.
- Structure and communicate scientific findings effectively, both graphically (poster) and orally (presentation).
- Demonstrate scientific rigour, relevance, and critical thinking in the interpretation and presentation of the research.

Les conférenciers sont des professionnels du monde académique ou privé bénéficiant d’une reconnaissance dans leur discipline. Les conférences se rapporteront aux thématiques suivantes : Biodiversité, Alimentation et agriculture, Société, Environnement

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The speakers are professionals from both academic and private sectors with a recognized expertise in their respective fields. The lectures will cover the following topics: Biodiversity, Food and agriculture, Society, Environment

Cette UE vise à améliorer la culture générale scientifique des étudiants dans le domaine des sciences du vivant et de ses interactions avec la biosphère et les sociétés. Elle permet aux étudiants de s'initier à des problématiques sociétales en lien avec les thématiques de la graduate school BIOSPHERA: Biodiversité, Alimentation et agriculture, Société, Environnement.

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This course aims to improve students' general scientific knowledge in the field of life sciences and its interactions with the biosphere and societies. It introduces students to societal issues related to the themes of the BIOSPHERA graduate school (Biodiversity, Food and Agriculture, Society, Environment).

Conférences en présentiel ou en visioconférence

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On-site or videoconference lectures

• Être capable d’interagir avec tous types de professionnels dans le domaine de l’environnement, du climat, de la biodiversité, de l’alimentation et de leurs interactions avec les sociétés.
• Posséder une vision large des questions environnementales, s’appuyant sur des connaissances diversifiées (scientifiques, juridiques, économiques, etc) et avoir, de ce fait, un recul par rapport à sa discipline d’origine.
• Compétences complémentaires: Capacité à synthétiser les principaux éléments d’un discours

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• Be able to interact with all types of professionals in the fields of the environment, climate, biodiversity, food, and their interactions with societies.
• Possess a broad view of environmental issues, drawing on diverse knowledge (scientific, legal, economic, etc.) 
• Additional skills: Ability to summarize the main points of a speech.

L’accent est mis sur les tests statistiques paramétriques.
Contenu : Cours + exercices sur Excel et R (Rcmdr).

L’objectif est d’apporter aux étudiants quelques notions de statistiques non développées en licence, tout en restant dans les limites de ce qui peut être raisonnablement acquis dans le temps d’un module court. L’accent est mis sur les tests statistiques paramétriques.

Tout l’enseignement, cours et travaux pratiques (en salles informatique) est obligatoire et présentiel.

Manipulation de jeux de données, définition de questions statistiques et identification de la méthode statistique à mettre en œuvre pour y répondre, autonomie en analyse de données courante (description de données, comparaison de distributions, de moyennes, corrélation et régression) grâce à un logiciel simple (Excel, R via l’interface Rcmdr).

During this course, students will be given a data set to analyse in depth. The teaching is based on active pedagogy, accompanied by a scientific tutor who will have his or her own dataset to be analysed.

During this course, students will learn to :
• Exhaustively search and synthesise the information available in public databases
(bibliographic, genomic, transcriptomic, proteomic data, etc.)
• The use of certain software to analyse these data
• Identify a relevant biological question from their synthesis
• Design and present a mini research project to answer this biological question and to deepen
the knowledge about it.

Pas de pré-requis

L'UC apportera des connaissances biologiques tout autant qu'un regard critique sur ces connaissances. Parmi les apports techniques : FIV, ICSI, cryoconservation, diagnostic pré-implantatoire, génomique fonctionnelle appliquée à l'embryon, cellules souches, transplantation. Pour l'analyse critique : table ronde autour de philosophes, juristes et acteurs de la recherche et de la réflexion bioéthique sur l'embryon.

Grâce à l'intervention de chercheurs, médecins, juristes et philosophes, on dressera sous plusieurs angles un état des lieux des biotechnologies appliquées à l'embryon humain et animal: procréation médicalement assistée, cryoconservation, génotypage, cellules souches embryonnaires, voire clonage et transgenèse. On s'interrogera sur les multiples enjeux de ces nouvelles biotechnologies.

Les étudiants devront être capable d’expliquer les étapes essentielles de la reproduction et du développement animal grâce: -Les visites sur le terrain ainsi que les entretiens et cours permettront aux étudiants d’observer les techniques et outils associés à la manipulation de l’embryon humain et animal, et de contextualiser leurs applications dans le domaine médical, vétérinaire ou de la recherche. -Grâce aux discussions avec les intervenants, les étudiants devront parvenir à analyser les cadres règlementaires et éthiques dans lesquels les acteurs du domaine évoluent en France et dans le monde, afin d’identifier les menaces et opportunités auxquelles ils font face. -A l’issue du module, les étudiants seront capable d’exposer et défendre auprès de leurs pairs une réflexion personnelle sur une question de leur choix, en lien avec l’embryon.

Aucun pre-requis

The objectives of this EU are:
- to illustrate the different roles of animals today (breeding, company, biomedical research, ...) and the
new challenges in animal production (nutritional and health qualities of products, animal welfare,
protection of biodiversity, use of new biotechnology tools),
- to provide basic information on the different aspects of animal production and
- to acquire the basic English vocabulary of zootechnics.

Tutorials / Visits / Lectures / Personal work /Debate/discussion/evaluation.

aucun pré-resquis

L'objectif de cette UC est de comparer chez l'homme et chez l'animal les différents processus d'homéostasie permettant à l'organisme de s'adapter à des situations particulières ou critiques, telles que les situations d'effort, de synthèse intense ou de la sous alimentation et du jeûne. Dans ces situations la disponibilité des substrats devient limitante par rapport aux besoins et leur valorisation ainsi que leur distribution doit être optimisée. Certaines stratégies nutritionnelles sont alors susceptibles de favoriser cette optimisation.

Les thèmes suivants seront abordés : 1 Dynamique digestive et mise à disposition des nutriments (monogastriques, polygastriques) 2 Nutrition et efforts (chiens de traîneau, sportifs de haut niveau, treck....) 3. Epargne et déposition musculaire : statégies alimentaires. Adaptation à une production intense (production laitière). 4 Adaptation à la sous alimentation (sous alimentation dans les zones desertiques, jeûnes spirituels, jeûnes protestataires…).

Aucun prérequis

Les objectifs de cette UC sont : 1) de sensibiliser les étudiants à l'évolution rapide des biotechnologies animales et d'en mesurer les conséquences économiques, juridiques, mais également éthiques ; 2) de dresser un panorama des applications actuelles et potentielles des biotechnologies pour l'élevage et la recherche biomédicale ; 3) de dégager les voies d'avenir ou celles dont l'application potentielle permettra la plus grande marge de progrès sans compromettre les équilibres acquis (productions animales, qualité des produits, santé humaine, impact sur l'environnement).

Cours - Conférences - Visite de Centre de Recherche - Visite de Laboratoires d'Entreprises.

Aucun pré requis n'est demandé

Maitriser les connaissances physiologiques concernant la digestion et le métabolisme des espèces animales de production afin d’optimiser leur fonctionnement en élevage. Maitriser les connaissances concernant le determinisme génétique des différences inter-espèces concernant le métabolisme. Ces connaissances seront envisagées au travers de 2 grandes fonctions de production que sont la croissance et la lactation.

Les enseignements se déroulent à Paris (AgroParisTech) sur une période de 21 jours. Les enseignements sont dispensés au travers de cours sur les bases de physiologie digestive et metabolique et leur déterminant génétique associés à des TD d'application. Des travaux personnels (projets) sous forme d'études bibliographiques associés à un controle de connaissances constituent les bases d'évaluation

Une bibliographie spécifique en appui des travaux personnels étudiants est fournie

Aucun

The programme first introduces the major families of alternative proteins (plant-based, insect-derived, microbial), their functional properties, and their prospects for use in food systems. It then addresses the biotechnological approaches involved, ranging from conventional techniques such as mutagenesis, transgenesis and cisgenesis, to new genome-editing technologies, as well as the contributions of protein engineering, synthetic biology, and systems biology. Cross-cutting themes, including protein separation, industrial transformation processes, and metabolic pathway engineering, are also explored. Ethical, societal, and regulatory aspects of applying biotechnology to food production are considered throughout. The course is complemented by a research and development centre visit, allowing students to directly link theoretical knowledge with industrial applications.

The unit is structured around 14h of lectures, 16h of tutorials, and 6h dedicated to a supervised project, in addition to the R&D centre visit. Lectures provide the conceptual foundations and highlight recent advances in the field, while tutorials encourage active learning through case studies, critical discussions, and problem-solving exercises. The supervised project allows students to work independently on an applied problem, thereby integrating theoretical knowledge with creativity and analytical skills. Assessment in the first session consists of coursework (written dossier, 30%) and an oral examination (70%), while the second session consists of a final written examination (100%). This structure supports progressive, interactive learning and fosters analytical, critical, and applied competences required to address the challenges of protein biotechnology.

Assessment in this unit is designed to evaluate a combination of scientific knowledge, analytical ability, and applied problem-solving skills. The written report assesses students’ capacity to synthesise scientific literature, critically appraise biotechnological approaches, and contextualise them within ethical and regulatory frameworks. The oral examination evaluates students’ ability to communicate complex scientific concepts clearly, defend arguments, and demonstrate integrative understanding across molecular, physiological, and technological dimensions. The written examination in the second session tests comprehensive knowledge of alternative protein sources, mastery of genetic and protein engineering techniques, and the ability to apply theoretical concepts to novel or emerging biotechnological challenges.

Mackelprang, R., & Lemaux, P. G. (2020). Genetic engineering and editing of plants: an analysis of new and persisting questions. Annual Review of Plant Biology, 71, 659-687.
Małecki, J., Muszyński, S., & Sołowiej, B. G. (2021). Proteins in food systems—Bionanomaterials, conventional and unconventional sources, functional properties, and development opportunities. Polymers, 13(15), 2506.
Hadi, J., & Brightwell, G. (2021). Safety of alternative proteins: Technological, environmental and regulatory aspects of cultured meat, plant-based meat, insect protein and single-cell protein. Foods, 10(6), 1226.

Aucun pré requis n'est demandé

L'UE a été créée afin de permettre à tout étudiant en Sciences d'appréhender le monde économique et le monde de l'entreprise: après une série de conférences d'Economie générale, le monde de l'entreprise est présenté à travers les grandes fonctions de l'entreprise, de la multinationale à la start up.
Ces enseignements s'appuient sur des enseignants ayant une expérience de création d’entreprise et des professionnels.

Les enseignements se déroulent à l'Université Paris-Saclay (Orsay) sur une période de 15 jours (UE massée).

Bases du fonctionnement de la macroéconomie ; innovation incrémentale et innovation de rupture, facteurs objectifs et subjectifs liés à la création d'entreprise.

Connaissances solides en biologie moléculaire et cellulaire.

Travaux pratiques sur des cellules animales, végétales et microbiennes. Travaux bibliographiques, synthèse des travaux pratiques au regard de la littérature. Rédaction de rapport de TP. Analyse intégrée des résultats à l'échelle des organismes entiers.

Maîtriser les outils permettant l'étude de l'expression des gènes et l'expression stable ou transitoire de gènes d'intérêts dans des cellules cibles, aussi bien dans des cellules eucaryotes et procaryotes. Le contenu est entièrement enseigné sous forme de travaux pratiques et de travaux bibliographiques.  Les résultats sont intégrés à l'échelle de l'organisme.

Une semaine de travaux pratiques sur des systèmes cellulaires animaux et une semaine de travaux pratiques sur des systèmes plantes et microorganismes. Apprentissage de manipulations expérimentales, analyse de résultats expérimentaux sur deux mini projets d'une semaine chacun.

Les étudiants et étudiantes compareront leurs résultats à la littérature puis les commenteront en groupe.

expérimentation en biologie moléculaire, analyse de données

Aucun prérequis

Il a pour objectif d’initier les étudiants aux enjeux, méthodes et outils de la médiation scientifique. Il vise à leur faire comprendre l’importance du lien entre la science et la société et à les former au partage des savoirs scientifiques, mais aussi des activités de recherche et plus généralement du milieu de la recherche vers des publics non spécialisés. À travers des apports théoriques et une mise en pratique, les étudiants développeront leur capacité à vulgariser des contenus scientifiques, à adapter leur discours et à échanger de manière claire en fonction des publics cibles (principalement scolaires, mais aussi grand public et acteurs socio-professionnels) et à produire et utiliser des supports variés.

• Comprendre les enjeux et les finalités de la médiation scientifique dans le contexte actuel de la relation science-société et prendre conscience du rôle social du chercheur et de la responsabilité éthique liée à la diffusion des savoirs.
• Identifier les différents publics de la médiation (jeunes, grand public, professionnels, etc.) et leurs attentes.
• S’approprier une question scientifique et appréhender les enjeux associés
• Comprendre comment adapter un discours scientifique à un public non spécialiste, en respectant les principes de la vulgarisation (et de l’accessibilité).
• Concevoir une action de médiation simple (intervention ponctuelle), c’est-à-dire réfléchir et proposer : une présentation orale, une éventuelle animation ou atelier associé, un support visuel ou numérique pertinent, le tout adapté au public cible.
• Mettre en oeuvre une action de médiation simple (mise en situation) et auto-évaluer leur propre travail et évaluer celui de leurs collègues
• Travailler en groupe et développer des compétences transversales en communication, pédagogie et gestion de projet.

Pas de pré-requis

Montrer comment l'action de l'Homme sur l'animal à travers la domestication a pu modifier les populations animales (réduction du nombre et de la diversité des espèces et des races exploitées).
- Montrer comment l'Homme peut gérer ces évolutions (gestion et préservation de la faune sauvage et des ressources génétiques, apparition de nouvelles espèces en élevage).
- Aider les étudiants à réfléchir à leur perception de l'animal sauvage et domestique et à la place de l'animal dans les sociétés humaines.

L’enseignement est dispensé sous forme de conférences (25h) et de visites (4 demi-journées - par exemple : élevage de cerfs, élevage de faisans, zoo, parc naturel, MNHN...).

Aucun prerequis

1. Concepts et mécanismes de base en génétique quantitative
   • Décomposition de la variance génétique
   • Ressemblance entre apparentés
2. Le progrès génétique et la mise en œuvre des programmes de sélection
   • Organisation de la sélection, objectifs de sélection, Critères, sources d’information
   • Évaluation génétique, progrès génétique, mise en œuvre des programmes d'amélioration
   • Les apports de la sélection génomique
3. Le croisement : principes et applications en élevage
4. Maîtrise de la reproduction des animaux domestiques

L'objectif de ce module est d'introduire les concepts et les notions sur lesquels se fondent l'amélioration génétique animale au sein des filières d'élevage en France.
Dans la continuité des cours suivis lors du tronc commun du M1 BIP Animal, nous aborderons les concepts clés de la génétique quantitative ainsi que leur application pour la définition et la conception de programmes de sélection. Par ailleurs, les méthodes et outils permettant la diffusion du progrès génétique seront également détaillés.

Descriptif : La pédagogie associera cours magistraux et TD d'application. Une des séances de TD se déroulera sur la ferme expérimentale de l'école, à Grignon.

aucun pre-requis

Initier à la compréhension des systèmes complexes régulés que constituent les organismes animaux. Initier à l’approche de modélisation pour appréhender les articulations entre les différents niveaux d'organisation des systèmes vivants et leur contrôle.
Cette U.E. inclut une dimension quantitative aux connaissances de physiologie animale, en privilégiant l’animal d’élevage. La nutrition animale sera notamment abordée dans l’optique de l'approche dynamique des lois de réponse multiples de l'animal aux variations du régime alimentaire. Le volet modélisation, au sens statistique comme au sens prédictif du comportement d’un système sera abordé sous un aspect pratique et utilitaire dans le cadre de son application à la physiologie de la nutrition.

Association de cours theoriques (metaanalyses, modélisation mecaniste des organismes vivants) et de travaux pratiques (cas concrets).

Les objectifs pédagogiques sont :

• Comprendre les grands enjeux de santé animale dans un contexte de transition agroécologique et de sécurité alimentaire.
• Aborder les interactions complexes entre microbiotes intestinal et santé animale.
• Identifier les principaux agents pathogènes (bactéries, virus, parasites) affectant les animaux d’élevage et leurs impacts sur la filière.
• Évaluer les enjeux de l’antibiorésistance et les alternatives aux antibiotiques, comme les modulateurs du microbiote intestinal.
• Définir la démarche "One Health", en abordant la santé animale comme partie prenante d’un système global incluant la santé humaine et environnementale.
• Développer des compétences de recherche et de communication scientifique, à travers la conception et la présentation d’un poster.

Ce module a pour objectif d'apporter aux étudiants une compréhension globale des enjeux liés à la santé et au bien-être animal, en lien avec les pratiques d’élevage, la santé publique et les attentes sociétales. L’enseignement combine cours magistraux, interventions de chercheurs et études de cas en travail de groupe. L’évaluation se fait à travers la réalisation d’un poster scientifique sur des sujets concrètes tels que le CAEV chez la chèvre, Campylobacter chez le poulet, E. coli chez les bovins.

Cours / TP / TD