LDD1 Mathématiques, Sciences de la vie

Langue(s) d'enseignement

Français
Responsable(s) de la formation

NATALIA CONDE E SILVA-RIOU

JUDITH LEGRAND

Présentation

Pré-requis, profil d’entrée permettant d'intégrer la formation

Pré-requis recommandés

Cette première année s’adresse à des étudiant(e)s particulièrement motivé(e)s, aimant les mathématiques et la biologie, souhaitant s’engager dans un cursus intensif qui développera leur capacité de raisonnement et leur esprit d’initiative.

Stages et projets encadrés

Stage et projet tutoré

Un projet tutoré de bio-mathématiques au second semestre.

Lieu(x) d'enseignement

Enseignements délocalisés

UFR des Sciences, Campus d'Orsay

Rapport public Parcoursup, session 2022

Rapport-public-Parcoursup-2022-LDD-Mathematiques-Sciences-de-la-vie - ( 13.28 Ko)

Programme

Matières	ECTS	Cours	TD	TP
Biologie 1 : Unité, diversité, évolution du vivant	6.5	26	22.5	16.5
Biologie 1 : Unité, diversité, évolution du vivant Langue d'enseignement : Français ECTS : 6.5 Détail du volume horaire : Cours : 26 Travaux dirigés : 22.5 Travaux pratiques : 16.5 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : SOLANGE BERTRANDY MARIE DUFRESNE FLORENCE MOUGEL-IMBERT Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir Expliquer la théorie de l’évolution et l’appliquer à l’analyse de la diversité du vivant Décrire la structure, le maintien et l’expression du support de l’information génétique Identifier les variations de l’information génétique et décrire sa transmission d’une génération à l’autre Nommer et classer les grands groupes du vivant à partir de caractères diagnostiques Analyser les différents cycles de vie en identifiant les grandes étapes et en produire un schéma légendé OAV transversal : Réaliser des observations suivant un protocole défini et les communiquer sous la forme d’un compte-rendu Enoncer un concept du cours de façon claire et concise Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Chapitre Génétique et Biologie Moléculaire Cours 10h Structure et stabilité de l’ADN : comprendre la stabilité et l’évolution des espèces Divisions cellulaires : cycle cellulaire et mitoses Les mutations et leurs effets – Notion de crible L’expression des gènes : transcription et traduction Génétique TP 4.5h Estimation du titre d’une culture bactérienne Suivi de la croissance de la bactérie Escherichia coli par turbidimétrie, influence de la température et du milieu TD 9h Structure des acides nucléiques Croissance bactérienne et réplication de l’ADN chromosomique Génétique : impact des mutations Transcription-Traduction Les divisions cellulaires : mitose et méiose Génétique : ségrégation des allèles Chapitre Evolution Cours 8.5h Histoire des idées en évolution Principes de base de phylogénie Phylogénies moléculaires Arbre du vivant Histoire de la vie sur terre TP 1.5h Etude du squelette de vertébré : Un exemple d’homologie structurale TD 4.5h Les concepts de base en systématique et principe de construction d’un arbre phylogénétique Application des concepts et des méthodes de construction à l’aide de feuilles d’exercice WIMS Phylogénie des Métazoaires Chapitre Diversité Cours 7.5h Présentation des eucaryotes Diversité des eucaryotes photosynthétiques Diversité des Eumycètes Diversité des Embryophytes Diversité des métazoaires TP 10.5h Diversité du monde microscopique Les algues : diversité des organismes photosynthétiques Les eumycètes Comparaison des plans d’organisation d’un métazoaire diblastique et d’un métazoaire triblastique TD 6h Caractérisation des grands groupes d’eucaryotes Les endosymbioses Cycles de vie chez les Embryophytes Diversité - Etude paléontologique et évolution des arthropodes Accompagnement personnalisé : Deux séances de 1h30 chacune sont prévues pour corriger avec les étudiants les devoirs sur table. Pré-requis : Pré-requis obligatoires Définir le vocabulaire de base en biologie : atome, molécule, polymère, ADN, chromosome, cellule Définir les notions d’hérédité, de mutation, d’évolution Différencier les liaisons hydrogènes et covalentes Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre 1 Bibliographie : Bibliographie, lectures recommandées CAMPBELL Neil et REECE Jane. Biologie. 9ème édition. Ed. Pearson Education France, 2012. Elise LELIEVRE, Julie DENOEUD, Jonathan ROQUES, Elise HAMARD-PERON, Mickael AIRAUD. Biologie, Les manuels visuels pour la Licence. Collection Fluoresciences. Ed Dunod, 2018. Francine BRONDEX. Evolution, synthèse des faits et théories. Cours et questions de révision. Ed. Dunod Université, 1999. Luc PERINO. Darwin et les sciences de l’évolution pour les nuls. Ed. First, 2018. LECOINTRE Guillaume et LE GUYADER Hervé. Classification phylogénétique du vivant, volumes 1 et 2, Ed. Belin, 4ème édition 2017. CASANE Didier et LANRENTI Patrick. Penser la biologie dans un cadre phylogénétique. L’exemple de l’évolution des vertébrés. Médecine/Sciences, 2011, 28, 1121-7 Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Les chapitres Evolution et Génétique et biologie moléculaire sont abordés en parallèle et avant le chapitre Diversité. Pour le chapitre Evolution, un des TD consiste en des exercices en ligne sur la plateforme WIMS. L’acquisition des notions sera évaluée par une feuille d’exercices en ligne (tirage aléatoire des exercices du TD mentionné ci-dessus) et la note sera intégrée au contrôle continu. Deux devoirs sur table auront lieu au cours du semestre et feront l’objet de séances de correction en TD sous forme d’accompagnement personnalisé. Un 3ème et dernier devoir sur table de synthèse aura lieu à la fin du semestre. Les étudiants disposeront d’exercices sur la plateforme WIMS organisés en feuilles de révision par partie de cours au sein de chaque chapitre pour s’exercer sur les différentes notions abordées au cours du semestre. Les chapitres Génétique et Biologie Moléculaire et Diversité sont aussi évalués en contrôle continu par des compte-rendus de TPs. Ces derniers sont corrigés par l’enseignant, rendus au TP suivant puis corrigés en salles.
Chimie 1 : De l'atome à la matière	6.5	27	29	9
Chimie 1 : De l'atome à la matière Langue d'enseignement : Français ECTS : 6.5 Détail du volume horaire : Cours : 27 Travaux dirigés : 29 Travaux pratiques : 9 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : LIONEL AMIAUD Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir Lumière: Replacer un rayonnement dans les domaines du spectre électromagnétique. Connaître des sources de rayonnements électromagnétiques Définir un rayonnement mono et polychromatique , connaître les notions de spectre continu et discret Connaître et exploiter la relation entre les grandeurs caractéritiques de l'onde et l'énergie d'un photon: période ou la fréquence, la longueur d’onde et la célérité Atome: Savoir identifier et décrire un nucléide Comprendre la notion de quantification. Prévoir l'énergie et le rayon d'un hydrognénoïde à partir du modèle planétaire de Bohr Savoir lire et se repérer dans la classification Savoir écrire une configuration électronique et représenter les électrons dans un modèle de case quantiques Ecrire la configuration électronique fondamentale d'un atome ou d'un ion à l'aide des 3 règles de construction (Pauli, Klechkowski, et Hund) et en déduire les électrons de valence Déterminer la place dans le tableau périodique d'un élément à partir de son numéro atomique et de sa configuration électronique fondamentale et vice-versa Connaître l'évolution de quelques propriétés des atomes (taille, électronégativité, EI, AE) au sein du tableau périodique Spectroscopie atomique Savoir tracer et remplir un diagramme d’énergie Savoir représenter et traiter des transitions Connaître la définition d’une série d’émission Savoir se servir des séries pour identifier un élément Réaliser un bilan d'énergie résultant de l'interaction entre un photon et un atome Manipuler les transitions entre niveaux d'énergie quantifiés d'un hydrogénoïde sur le modèle basique de l'atome de Bohr Spectroscopie Reconnaître et différencier un spectre de raies en émission, en aborption et un spectre continu. Identifier les é léments d'un instrument de spectroscopie : élement de dispersion, source, fentes, détecteur Utiliser la loi de Beer-Lambert pour retrouver la concentration ou l'absorbance d'un composé en solution Dualité onde-corpuscule Savoir qu'une particule peut être caractérisée par une énergie mais aussi par une fonction d'onde Avoir une notion du concept d’Orbitale Atomique Structure de Lewis: Décrire la répartition des électrons de valence d'une molécule (formule de Lewis), en utilisant la règle de l'octet (et en en connaissant les limites) Appliquer la théorie VSEPR pour déterminer la géométrie d'un édifice moléculaire Déterminer la polarité d'une molécule à partir de sa géométrie Déterminer les nombres d'oxydation à partir des structures de Lewis des molécules organiques. Nomenclature: Déterminer le nom en nomenclature IUPAC des molécules polyfonctionnelles. Ecrire une structure développée, semi-développée et topologique de toutes molécules organiques. Identifier les fonctions ou groupements fonctionnels (acide carboxylique, alcool, ester, amine, aldéhyde, cétone, amide, thiol, éther oxyde,insaturations...) et déterminer la fonction principale. Classer les groupements fonctionnels par priorité décroissante Employer les préfixes et suffixes associées aux fonctions, substituants et insaturation Assembler les différents éléments (suffixe, préfixe, numérotation, insaturation, chaine carbonée) afin de déterminer le nom des molécules polyfonctionnelle en nomenclature IUPAC? Prédire l’état d’hybridation des atomes et représenter les formes limites Déterminer l'hybridation des atomes de C, O et N dans des molécules simples et déterminer l’orbitale dans laquelle se trouve le doublet non liant de l’azote. Décrire les effets électroniques de groupements dans moléc ules organiques Identifier les systèmes conjugués et aromatiques et représenter ses formes mésomères éventuelles. Différents types de liaison de covalente à ionique - Cohésion de la matière / Forces intermoléculaires Connaître les différents types de liaisons (physiques et chimiques) pouvant exister entre atomes et molécules et leurs caractéristiques principales Prédire la formule chimique d'un solide ionique Expliquer les différences de température de transition de phase de composés proches en relation avec les forces intermoléculaires en présence Identifier les composés susceptibles de participer à des liaisons hydrogène Introduction à la structure macroscopique de la matière Décrire l'architecture de la matière à différentes échelles (du moléculaire au solide) Décrire les empilements d'atome dans un solide cristallin Production d'écrit Rédiger un compte-rendu de travaux pratiques en chimie Mesures Effectuer les opérations courantes dans un laboratoire de chimie en sécurité Estimer quantitativement les erreurs associées aux opérations courantes de laboratoire en chimie. Mettre en oeuvre une mesure par spectrophotométrie de l'absorbance d'un composé en solution. Réaliser une gamme étalon et s'y référer pour doser une concentration inconnue. Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Cet enseignement apporte les bases en chimie générale en partant de la structure des atomes pour construire la structure et les propriétés des molécules organiques, inorganiques et des solides: Généralités et Spectroscopie Atomistique: Rappel des constituants de l'atome, et définition d'un élément et de ses isotopes. Notion de masse atomique Lumière: Description ondulatoire et corpusculaire de la lumière Spectroscopie: Définition de l'analyse spectrale, des domaines du spectre électromagnétique et des type de spectres (de raies ou continu). Processus d'émission et d'absorpption représentés dans un diagramme d'énergie. Présentation des séries de l'atome d'hydrogène, travaux pratiques de spectroscopie d'émission des atomes H et O dans le visible. Hydrogénoïdes: Formules de Bohr et étude du diagramme d'un hydrogénoïde. Processus d'ionisation Configuration électronique- Description Quantique et Classification Elements de Mécanique Quantique : Principe d'Heisenberg, notion de fonction d'onde et équation de Schrödinger Orbitales Atomiques (OA) d'un hydrogénoïde: Description qualitative des OA d'un hydrogénoïde, des nombres quantiques et des représentations usuelles associés Atome poly-electronique : Principes directeurs de la structure électronique: Critère de stabilité, exclusion de Pauli, structure énergétique (approximation monoélectronique et appariement). Règles empiriques de Klechkowski et de Hund. Détermination de la couche de valence Tableau Periodique: structuration en blocs et évolution des propriétés atomiques dans le tableau (électronégativité, énergie d'ionisation,...) Structure et géométrie des molécules Prévisio n de structures stable: Modèle de Lewis et règle de l'octet. Notion de valence, d'hypervalence et écriture de charges formelles Prévision de la géométrie: Principes de la méthode VSEPR (Valence Shell Electron Paire Repulsion) Polarité des molécules: Notions de charges partielles sur une liaison et détermination de la polarité de molécules simples. Molécules organiques Nomencalture: Nomenclature chimique IUPAC (différentes écritures, fonctions chimiques et groupements fonctionnels, ordre de priorité, règle de détermination du nom de composés polyfonctionnelles et écriture des structures chimiques à partir du nom d ’ un composé) Géométrie des molécules organiques et hybridation: redéfinition de liaison covalente et des limitation du modèle de Lewis et de la théorie VSEPR. Formation de liaison sigma et pi, hybridation des orbitales atomiques et géométrie des atomes dans les molécules organiques, localisation des doublets non liants. Systèmes électroniques délocalisés : systèmes conjugués et mésomérie, coplanéarité et aromaticité, effets inductifs et effet mésomères Cohésion de la matière Les différents types de liaison - liaisons fortes: liaisons covalentes, iono-covalentes, metalliques, liaisons de coordination dans les complexes Les différents types de liaison - liaisons faibles: les forces de Van der Waals (London, Keesom et Debye). La liaison hydrogène et illustration dans les molécules biologiques. Solvatation. Etats de la matière: liquide, solide, gaz Structures des solides Propriétés structurales des solides (état amorphe ou cristallin, notion d'ordre à courte ou longue distance et de périodi cité) Structure des solides cristallins : maille, réseau et motif. Introduction aux empilements de sphères et aux structures simples Pratique de laboratoire: Spectroscopie : transition atomique et diagramme des niveaux d'énergie Verrerie standard en chimie, évaluation des incertitudes de mesure et rédaction d'un compte-rendu de travaux pratiques Dosage par spectrophotométrie et réaction de complexation. Pré-requis : Pré-requis obligatoires Chimie: Composition élémentaire de l’atome et notion d’isotopes, composition atomique des molécules, quantités de matière et concentrations, équilibrage de réactions chimiques (conservation du nombre d'atomes et de la charge), tableaux d'avancement pour des réactions totales, notions de chaleur et de transferts d'énergie, terminologie de la verrerie « standard » (béchers, éprouvettes, pipettes,…) Physique: Conversion d'unités et analyse dimensionnelle, force et travail d'une force, lois de Newton, interaction coulombienne, énergies (mécanique, potentielle, et cinétique Mathématiques: Géométrie : vecteurs et combinaison de vecteurs, géométrie 3D (polyèdres réguliers simples), trigonométrie Algèbre : puissances de 10, fractions, résolution d'équations du premier et second degré Analyse : fonction d'une variable : variations, dérivée, intégrale, représentation graphique, détermination d’équations de droites (pente, ordonnée à l’origine), fonctions logarithme et exponentielle Non disciplinaires: Expression écrite et orale adaptée à une situation d’enseignement, Compréhension et synthèse d’un document simple, Utilisation élémentaire de l’outil informatique (recherches sur Internet, communication par mail, traitement de texte) Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre 1 Bibliographie : Bibliographie, lectures recommandées Livres de cours : Chimie - Cours, exercices et méthodes. Stéphane Perrio (Auteur), Béatrice Roy (Auteur), Jean-Yves Winum (Auteur) Editions DUNOD Chimie 3- Introduction à la chimie inorganique, organique et à la chimie physique. A. Burrows, J. Holman, A. Parsons, G. Pilling, G. Price (Auteurs), Trad: F. Mammeri, B. Piro, S. Reisberg Chimie : Collection Les Manuels Visuels Pour la Licence (Fluoresciences, DUNOD) Chimie : Visa pour la prépa, par Séverine Bagard et Nicolas Simon (Dunod) Chimie générale par René Didier et Pierre Grecias (collection Lavoisier chez Tec&Doc). Cours de Chimie Physique, par Paul Arnaud (Dunod) Structure électronique des molécules, Yves Jean et François Volatron (Edisciences) 1- De l’atome aux molécules simples Livres d’approfondissement : Chimie générale, par Atkins (InterEditions) Chimie générale, par Mc Quarrie/Rock (De Boeck Université) Histoire des sciences L'atomisme antique : Démocrite, Epicure, Lucrèce, par Jean Salem (Livre de Poche). Lire le chapitre 1 – Disponible à la BU. De l'alchimie à la chimie, par Olivier Lafont (Ellipse) – Disponible à la BU. Tout petit livre, très intéressant, à consulter. Les atomes, par Jean Perrin (Livre de poche Flammarion) – Disponible à la BU, à avoir chez soi. Liens externes : http://pac.unisciel.fr/parcours-chimie/ http://winter.group.shef.ac.uk/vsepr/ (Géométries moléculaires) http://winter.group.shef.ac.uk/orbitron (Orbitales atomiques) http://www.orbitals.com/orb/ov.htm (Orbitales atomiques) Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Le programme sera déroulé dans l'ordre des chapitres, avec la répartition suivante en terme de volume horaire (CM, TD). Cette répartition peut être modulée entre chapitres suivant l'avancement, mais en conservant un total de 27 h en CM, 29 h en TD et 9 h en TP. Chapitre 1, 2 et 3: (CM 14h, TD 14h) Chapitre 4, (CM 7h, TD 8 h) Chapitre 5, 6 (CM 3h, 2h TD) Chapitre 7 (CM 3h, TD 5h) 3 séances de travaux pratiques sont prévues: 3h : Spectroscopie de l'atome d'hydrogène et de l'atome d'oxygène. L'évaluation portera sur la qualité des mesures et l'interprétation des résultats. 3h : Travaux pratiques informatisés de visualisation et d'obtention des grandeurs caractéristiques associées aux empilements dans les structures cristallines. 3h: Etablissement d'une gamme étalon et dosage par spectrophotométrie de complexes de cuivre. Une attention particulière sera portée à la réalisation de manipulation élémentaire en chimie de laboratoire comme les pesées, et les dilutions. Un travail préparatoire de rédaction des objectifs et de la méthode d'investigation sera demandé. Un accompagnement différencié sera proposé à travers des séances de retour sur les notions mal acquises après les épreuves. Des travaux personnels d'approfondissement de notions seront proposés aux étudiants ayant acquis un socle de compétences nécessaire. Une séance de TD manipulation de modèles moléculaires est prévue pour aider à la visualisation de la géométrie des molécules si nécessaire. La 3ème séance de TP comportera une partie différenciée suivant l'aptidude des étudiants à réaliser correctement les opérations élémentaires de chimie de laboratoire. Des exercices en ligne (WIMS) notés seront effectuer tout au long du semestre en préparation et en révision des séances de TD.
Biologie 2 : De la molécule à l'organisme	7.5	30	24	21
Biologie 2 : De la molécule à l'organisme Langue d'enseignement : Français ECTS : 7.5 Détail du volume horaire : Cours : 30 Travaux dirigés : 24 Travaux pratiques : 21 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : CAROLINE BORDAY-SOL-CHAVIGNON CÉLINE CHARON BORIS JULIEN Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir Identifier et représenter les constituants moléculaires fondamentaux du vivant (lipides, glucides et protéines), décrire leurs structures, leurs propriétés chimiques, leurs assemblages intra- et inter-moléculaires et leurs fonctions dans la cellule. Identifier et représenter les différents compartiments cellulaires animaux et végétaux, préciser leur composition, décrire leurs fonctions propres et leurs interactions. Décrire et expliquer les différents niveaux de structuration intra-, péri- et inter-cellulaire animale et végétale. Décrire, à différentes échelles, l’organisation d’un amphibien et d’une plante à fleurs (organismes pluricellulaires), l’illustrer à l’aide d’exemples et de schémas et la mettre en relation avec les grandes fonctions physiologiques de l’organisme Décrire le cycle de vie d’un amphibien et d’une plante à fleurs (reproduction, développement embryonnaire et post-embryonnaire) et l’illustrer à l’aide d’exemples et de schémas OAV transversaux Construire une comparaison argumentée pour faire ressortir des points communs et des différences Appliquer un protocole simple pour réaliser, à l’aide d’outils appropriés, des observations, les analyser et en produire un compte-rendu écrit structuré Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Responsables / Contact : CAROLINE BORDAY CELINE CHARON AURELIE HUA-VAN BORIS JULIEN Chapitre Biochimie / Biologie Cellulaire : 37,5h Cours : 14h Cours introductif : de la molécule à la cellule Rappel des structures et propriétés des différentes macromolécules Structure et fonction des macromolécules : la catalyse enzymatique et les modifications conformationnelles Bioénergétique : les principes de couplage réactionnel et de synthèse d’ATP Les membranes biologiques La compartimentation : fonction des différents compartiments, trafic vésiculaire et transport transmembranaire Le cytosquelette La cellule dans son environnement Travail non présentiel : 1h sur e-campus : Prérequis aux cours magistraux et cours préparatoires aux TP Travaux dirigés : 13,5h La cellule et ses constituants moléculaires Transformation de la matière : bioénergétique et introduction à l’enzymologie Lien entre structure et fonction des protéines : influence des modifications post-traductionnelles Lipides et bicouche lipidique Membrane biologique et échanges de matière et d’informations Synthèse des protéines et leur trafic intracellulaire Cytosquelette et mitose Multicellularité : comment les cellules s’organisent et se structurent à plusieurs Synthèse Biochimie / Biologie Cellulaire Travaux Pratiques : 9h Électrophorèse des protéines Étude comparée des compartiments cellulaires animaux et végétaux incluant un travail sur les grandes fonctions de chacun de ces compartiments Chapitre Biologie Animale / Biologie Végétale : 34,5h Cours : 15h Introduction générale Biologie Animale / Biologie Végétale présentant notamment les deux modèles de l’UE : amphibiens et plantes à fleurs La grenouille : appareils, organes et tissus La reproduction chez les amphibiens : gamétogenèse et fécondation Développement embryonnaire précoce du xénope Développement post-embryonnaire des amphibiens : la métamorphose Organisation d’une plante à fleurs et développement primaire Développement végétatif secondaire : La croissance en épaisseur La reproduction chez les plantes à fleurs : formation des gamétophytes, gamétogenèse, fécondation et développement embryonnaire Travaux dirigés : 7,5h Les fonctions vitales chez l’animal Comparaison de la spermatogenèse et de l’ovogenèse chez les Amphibiens La croissance des plantes ligneuses Organisation et fonctionnement des méristèmes primaires Reconnaissance des principaux tissus chez l’animal et le végétal Travaux Pratiques : 12h Anatomie d’une grenouille adulte – Étude des organes composant les différents appareils Développement embryonnaire précoce d’un amphibien Organisation générale d’une plante annuelle : le pois Organisation générale d’une fleur, d’un fruit et d’une graine Accompagnement personnalisé : 3h Une séance de 1,5h : Biochimie / Biologie Cellulaire Une séance de 1,5h : Biologie Animale / Biologie Végétale Ces séances, programmées après les devoirs sur table, sont prévues pour (1) corriger les devoirs avec les étudiants ayant rencontré des difficultés et (2) proposer des exercices d’approfondissement aux étudiants ayant été plus à leur aise. Accompagnement en non présentiel : Exercices WIMs Pré-requis : Pré-requis obligatoires Savoir nommer la valence des atomes de carbone, oxygène, hydrogène et azote Savoir reconnaître les fonctions alcool, acide, amine, cétone, aldéhyde, esters Savoir définir la polarité d’une molécule Lister les propriétés physico-chimiques de l’eau Connaître la composition des acides nucléiques Connaître les trois domaines du vivant Connaître l’organisation générale d’une cellule eucaryote Savoir décrire et schématiser les étapes de la ségrégation des chromosomes lors de la mitose et de la méiose Savoir schématiser et décrire un cycle de reproduction sexuée-type chez un eucaryote pluricellulaire Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre 2 Bibliographie : Bibliographie, lectures recommandées 1. Biologie Cellulaire. Des molécules aux organismes. CALLEN JC. Ed. Dunod (2e edition, 2005) 2. Biologie Moléculaire de la Cellule. ALBERTS B. Ed. Médecine science publication/Lavoisier (5e édition 2011) 3. Introduction à la Botanique. DUCREUX G. Ed. Belin (2002) 4. Biologie végétale. RAVEN, EVERT, EICHHORN. Ed. de Boeck (2007) 5. Développement. BEAUMONT A., HOURDRY J., VERNIER JM. et WEGNEZ M. ,Ed. Dunod (1994) 6. Biologie du développement. Le modèle Amphibien. DARRIBERE T. Ed. Diderot, Arts et Sciences, Collection Pavages (1997) Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Les chapitres Biochimie/Biologie Cellulaire et Biologie Animale/Biologie Végétale seront abordés en parallèle. Deux devoirs sur table auront lieu au cours du semestre et feront l’objet de séances de correction en TD sous forme d’accompagnement personnalisé. Le premier devoir sur table portera sur le chapitre Biochimie/Biologie Cellulaire, le deuxième portera sur le chapitre Biologie Animale/Biologie Végétale. Les étudiants disposeront d’exercices sur la plateforme WIMS organisés en feuilles de révision par partie de cours au sein de chaque chapitre pour s’exercer sur les différentes notions abordées au cours du semestre. L’acquisition des notions sera évaluée par feuilles d’exercices en ligne (tirage aléatoire des exercices) et les notes seront intégrées au contrôle continu. Les différents chapitres seront aussi évalués en contrôle continu par des compte-rendus de TPs. A la fin du semestre aura lieu un dernier devoir sur table de synthèse.
Chimie 2 : Transformations et propriétés de la matière	7.5	25	42	8
Chimie 2 : Transformations et propriétés de la matière Langue d'enseignement : Français ECTS : 7.5 Détail du volume horaire : Cours : 25 Travaux dirigés : 42 Travaux pratiques : 8 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : CHLOEE BOURNAUD Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir OAV 1 : Acquisition des compétences de base nécessaires à l’étude des réactions chimiques en solution OAV 2 : Énumérer, expliquer les trois principes de la thermodynamique OAV 3 : Appliquer les trois principes de la thermodynamique OAV 4 : Différencier les différents stéroisomères et déterminer leurs configurations OAV 5 : Identifier les catégories de réaction chimiques et prédire les propriétés acido-basiques de molécules organiques simples OAV 6 : Trouver une structure de molécules organique simple à partir de données spectroscopiques IR et RMN. OAV 7 : Réaliser une synthèse simple et une purification en suivant un protocole expérimental. Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Première partie : Acquisition des compétences de base nécessaire à l’étude des réactions chimiques en solution - Formation d’une solution (définition de solution, propriétés physico-chimique du solvant eau, dissolution et solubilité, électro-neutralité des solutions ioniques, unités de concentration) - Equation-bilan d’une réaction chimique (écrire, équilibrer et tableau d’avancement) - Calcul d’une quantité de matière, réactif limitant et rendement Seconde partie : Les principes de la thermodynamique - Énoncé du premier principe et définir l’enthalpie. Chaleur et calorimétrie (changement d’état). - Introduction qualitative de l’entropie en la reliant au désordre - Énoncé du 2nd principe en introduisant simplement la notion de création d’entropie. On se focalisera sur des transformations réversibles, on précisera que dans les cas réversibles l’entropie créée est nulle. - Calcul des variations d’entropie pour des transformations réversibles et en particulier à pression constante sous l’effet d’une variation de température. - Troisième principe de la thermodynamique et variations qualitatives de l’entropie (influence de l’état physique, du numéro atomique, du nombre d’atomes, de la structure…) Troisième partie : Applications des principes aux réactions chimiques - Introduction des grandeurs de réaction - Lien entre chaleur de réaction et fonctions d’état - Réalisation d’un bilan énergétique d’une réaction chimique - Définition des réactions conventionnelles notamment réactions de formation et réactions de combustion - Calcul enthalpie / entropie de formation, de réaction et de combustion – Variation avec la température – Notion de cycle de Hess sans changement d’état. Quatrième partie : Différencier les différents stéroisomères et déterminer leurs configurations - Distinguer les isomères plans des stéréoisomères. - Ecrire une représentation tridimensionnelle (Cram, Newman, équilibre chaise-chaise, Fischer) de molécules organiques. - Différencier les stéréoisomères de conformation des stéréoisomères de configuration et déterminer précisément le type de stéréoisomérie (conformère, énantiomère, diastéréoisomère). - Déterminer si une molécule est chirale. - Identifier le conformère le plus stable. - Déterminer les descripteurs des centres stéréogènes et des doubles liaisons sur des molécules simples. Cinquième partie : Identifier les catégories de réaction chimiques et prédire les propriétés acido-basiques de molécules organiques simples - Classer des espèces (oxydant/réducteur, acide/base, nucléophile/électrophile) - Utiliser le formalisme d’écriture de chimie organique - Identifier les catégories de réactions chimiques - Comparer la stabilité de composés organiques. - Identifier les fonctions acides et basiques sur des composés organiques. - Classer des molécules organiques selon leur force acide ou basique. Sixième partie : Trouver une structure de molécules organique simple à partir de données spectroscopiques IR et RMN - Extraire du spectre spectre infra-rouge les nombres d’onde des absorbance et en déduire les fonctions présentes sur une molécule organique simple - Décrire un spectre RMN (déplacement chimique, multiplicité, constante de couplage, intégration) - Différencier les atomes d’hydrogène équivalents. Traduire la multiplicité d’un signal en motif. - Proposer une structure de molécules correspondant à un spectre proton assez simple. Septième partie : Réaliser une synthèse simple et une purification en suivant un protocole expériment al. - Choisir la verrerie adaptée à la manipulation et suivre un protocole - Réaliser une extraction liquide-liquide à l’aide d’une ampoule à décanter - Séparer des composés par chromatographie sur couche mince - Déterminer un point de fusion - Mettre en place un protocole de purification chimique (recristallisation et/ou distillation) Pré-requis : Pré-requis obligatoires Mathématiques lycée : -algèbre élémentaires -Calculs de dérivées -Fonction exponentielle -Fonction logarithme népérien -Intégration Mathématiques du S1 BCST Chimie du S1 BCST Physique-chimie lycée : -Constitution de la matière à l’échelle macroscopique (corps pur et mélanges au quotidien et les solutions aqueuses) -Modélisation des transformations de la matière et transfert d’énergie (transformation physique et transformation chimique) - Représentation spatiale des molécules - Du macroscopique au microscopique - Transferts d’énergie entre systèmes macroscopiques - Acide et Base de Bronsted Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre 2 Bibliographie : Bibliographie, lectures recommandées « Toute la chimie pour bien commencer sa licence » , V. Alezra, de Boeck Supérieur ; « Principes de chimie » , P. W. Atkins, L. Jones, L. Lavermann, de Boeck Supérieur ; « Thermodynamique » , Richard Taillet, deboeck superieur « Fluoresciences Les manuels visuels pour la science - Chimie » , Stéphane Perrio, Béatrice Roy et Jean-Yves Winum, DUNOD « Traité de Chimie Organique », Vollhardt et Schore, Ed. De Boeck Université « Chimie Organique : Tout le cours en fiches », J. Madaluno, I Chataigner, F ; Couty, L. Garcia, A. Harrison-Marchand, M.-C. Lasne, J. Rouden, Dunod. Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Enseignement avec cours magistraux, travaux dirigés, travaux pratiques et mise à disposition d’éléments pédagogiques numériques (documents de cours et TD, annales et corrigés, tests sur e-campus). QCM, interrogation orale et écrite en TD

Matières	ECTS	Cours	TD
Calculus DD	6	24	30
Calculus DD Langue d'enseignement : Français ECTS : 6 Détail du volume horaire : Cours : 24 Travaux dirigés : 30 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :
Algébre et géométrie DD	6	24	30
Algébre et géométrie DD Langue d'enseignement : Français ECTS : 6 Détail du volume horaire : Cours : 24 Travaux dirigés : 30 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :
Calcul intégral DD	6	24	30
Calcul intégral DD Langue d'enseignement : Français ECTS : 6 Détail du volume horaire : Cours : 24 Travaux dirigés : 30 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :
Algèbre linéaire DD	6	24	30
Algèbre linéaire DD Langue d'enseignement : Français ECTS : 6 Détail du volume horaire : Cours : 24 Travaux dirigés : 30 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :

Matières	ECTS	Cours	TD
PPEI - Explorer un Environnement Professionnel	2.5	2	15.5
PPEI - Explorer un Environnement Professionnel Langue d'enseignement : Français ECTS : 2.5 Détail du volume horaire : Cours : 2 Travaux dirigés : 15.5 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : MICHEL MENOU Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences préprofessionnelles : Connaître le métier, les perspectives d’insertion, les entreprises ou organisations Travailler en équipe : s’intégrer, se positionner, collaborer, communiquer et rendre compte Savoir se présenter et présenter sa démarche Compétences transférables S’organiser, gérer son temps et ses priorités Faire preuve d’initiative Mobiliser les informations pertinentes et les mettre en forme Construire et développer une argumentation Faire preuve d’esprit critique Respecter la syntaxe et l’orthographe Construire un exposé adapté à l’objet et au public Prendre la parole Organisation Programme/plan/contenus : L’Unité d’Enseignement « Explorer son Environnement Professionnel » a pour objectif d'aider l'étudiant à mettre en place les aspects principaux de son avenir professionnel en l'incitant à devenir acteur de son orientation. Cet enseignement s’inscrit dans l’une des 6 missions du service public de l’enseignement supérieur « L’orientation et l’insertion professionnelle ». La démarche proposée incite l'étudiant de première année à : (1) explorer son futur environnement professionnel ; (2) à définir et/ou préciser son projet en termes d'activité professionnelle, en le confrontant aux réalités de terrain. Il analyse ainsi les aptitudes et connaissances requises pour exercer le métier choisi, qu'il sera à même de développer par le choix de stages, d’options et d’activités dans le cadre intra et extra-universitaire. La méthodologie suivie est semblable à celle d'une recherche universitaire dans les étapes successives qui mènent du choix du thème à la production du travail final. A l'issue de la présentation générale du contenu et des objectifs du module en amphithéâtre, chaque étudiant choisit un thème qui constitue son "projet professionnel". Il doit ensuite (ce travail se fait en équipe de 3 à 6 étudiants) : - effectuer une recherche documentaire approfondie et pertinente, - réaliser des interviews de professionnels, - rédiger individuellement un document de synthèse, - faire une présentation orale à l'aide d'un poster. Le travail est évalué à partir de la participation au travail de l’équipe au cours de l'avancement du projet, du dossier écrit, de la soutenance orale et du poster de l'équipe. Bibliographie : Gilles D., Millaud C., Saulnier-Cazals J., Vuillermet-Cortot M.J. : Projet professionnel de l’étudiant : les nouvelles donnes le livre « Passeurs de futurs » + CD-Rom, Ed. ONISEP (Paris) collection Références, 2002. Gilles D., Saulnier-Cazals J., Vuillermet-Cortot M.J. : SOCRATE, le retour... Pour accompagner la réussite universitaire et professionnelle des étudiants, Ed. Septembre (Québec), 1994. Modalités pédagogiques particulières L'UE comprend : - 8 séances de TD de 2h, - des interviews de professionnels, - une séance de présentation orale du projet.
Anglais	2.5		18
Anglais Langue d'enseignement : Anglais ECTS : 2.5 Détail du volume horaire : Travaux dirigés : 18 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés : Programme/plan/contenus : ANGLAIS GÉNÉRAL. Cette UE s'inscrit dans une approche actionnelle dans les 5 compétences (compréhension orale et écrite, expression écrite, expression orale en continu et en interaction) avec un travail sur la prononciation des sons voyelles. L'interaction se fait à travers des documents écrits et/ou audiovisuels centrés sur la problématique de l'environnement et du développement durable et un scénario de communication dans le cadre d'un projet tout au long du semestre. La communication interculturelle pourra être abordée dans le cadre du projet. Le travail se fera par groupes de niveau. Compétences à acquérir [habilitation] : Attendus de l'UE Langue-Anglais1 : Niveau B1 minimum dans les 5 compétences linguistiques
Méthodologie en Biologie et Mathématiques	3		25
Méthodologie en Biologie et Mathématiques Langue d'enseignement : Français ECTS : 3 Détail du volume horaire : Travaux dirigés : 25 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : ALAIN VIROULEAU NATALIA CONDE E SILVA-RIOU Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir Identifier et traduire les hypothèses et le but d'un raisonnement mathématique. Choisir un type de raisonnement mathématique adapté à la situation et exécuter ses différentes étapes. Manipuler les notations ensemblistes. Sélectionner les informations pertinentes à partir de différents documents et les synthétiser dans un texte court. Manipuler des données brutes pour construire une figure scientifique. Décrire et interpréter une figure scientifique. Identifier les différentes parties d'article scientifique pour concevoir une présentation orale accompagnée d’un support visuel. Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Les étudiants mettront en place des méthodes (nouvelles ou enrichies) pour analyser, présenter des données en biologie. Ils pourront également mettre en place des approches systématiques pour aborder des questions mathématiques. Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre S1. UFR des Sciences. Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi L'UE est organisée sous forme de TD.
UE libre (0 ECTS)
UE libre (0 ECTS) Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :

Matières	ECTS	Cours	TD	TP
Chimie-Biologie : Aux origines de la vie	2	6	9.5	4.5
Chimie-Biologie : Aux origines de la vie Langue d'enseignement : Français ECTS : 2 Détail du volume horaire : Cours : 6 Travaux dirigés : 9.5 Travaux pratiques : 4.5 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : ANTOINE PALLANDRE AURELIE HUA-VAN Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir OAV1 : Décrire les hypothèses actuelles concernant l’émergence de la vie sur terre (Scénarios et théories). Citer les grandes caractéristiques de la vie. Connaître les deux grandes écoles de pensée concernant l’émergence du vivant et les théories qui y sont associées. Décrire les hypothèses actuelles concernant les lieux où les premiers processus ayant conduit à l’émergence de la vie ont pu se mettre en place. Enumérer les arguments en faveur ou en défaveur de ces hypothèses. Connaître la formule chimique des gaz atmosphériques et des premières molécules organiques formées. OAV2 : Caractériser une réaction chimique du point de vue énergétique et en termes de transfert de protons et d’électrons. Comparer deux liaisons covalentes en termes de stabilité et de réactivité, d’après les énergies de liaisons. Définir le pH. Connaître les transferts de protons associés aux réactions acide-bases pour définir les espèces ioniques à l’origine des interactions faibles nécessaires à la réactivité et associations biomoléculaires. Reconnaître un acide et une base de Brönsted. Ecrire une réaction acido-basique. Définir le pKa d’un couple acido-basique et établir un diagramme de prédominance en fonction du pH. Connaître la notion de force d’un acide ou d’une base dans l’eau. Définir ce qu’est un réducteur ou un oxydant. Déterminer le nombre d’oxydation d’un atome engagé dans une molécule par la méthode des électronégativités, en déduire si, lors d’une réaction, cet atome subit une réduction ou une oxydation. Ecrire une demi équation redox. Identifier le sens de la réaction redox thermodynamiquement favorable grâce à une échelle de potentiels standards de couples oxydo-réducteur. A partir des énergies de liaisons, calculer la variation d’énergie au cours d’une réaction en décrivant précisément la méthode. Illustrer les variations d’énergies au cours d’une réaction chimique par un diagramme d’énergie légendé. Identifier les composantes, cinétiques et thermodynamiques, d’une réaction. D’après un diagramme énergétique, une variation d’énergie ou un profil de concentration, déduire si la réaction est thermodynamiquement favorisée ou non, cinétiquement favorisée ou non. Définir les notions de catalyse et d’activation. Identifier et justifier des solutions permettant de rendre favorable une réaction et savoir modifier en conséquence le diagramme énergétique de cette réaction. Citer les trois principaux types de catalyse : homoge`ne, he´te´roge`ne et enzymatique. Evaluer des cine´tiques de re´actions chimiques associe´es a` l’origine du vivant au travers de calculs de constantes de vitesse et des temps de demi-re´actions. Reconnaitre une (suite de) re´action(s) catalytique, et citer ses proprie´te´s. OAV3 : De´crire la structure et les proprie´te´s des briques de la vie et identifier les re´actions de synthe`se et de polyme´risation de ces mole´cules. Connaître les fonctions chimiques présentes dans les sucres, les acides aminés, les nucléotides, les acides gras, ainsi que les liaisons amide et ester. Schématiser la formule générale d’un acide aminé, et l’organisation d’un nucléotide ou d’un acide gras. Déterminer l’état d’ionisation de ces molécules en fonction du pH à partir des valeurs des pKa (diagramme de prédominance). Définir la notion de chiralité. Identifier si une molécule est chirale ou non. Savoir illustrer la différence entre deux énantiomères. Expliquer les conséquences de la chiralité dans une réaction chimique ou biochimique. Illustrer la notion de stéréospécificité et la mettre en rapport avec l’homochiralité du monde vivant. Décrire la formation d’un e liaison peptidique et identifier une réaction de polymérisation. Identifier les réactions de synthèse des sucres, des acides gras et des acides aminés qui auraient pu avoir lieu en conditions prébiotiques. Identifier si une réaction ou une suite de réaction est autocatalytique ou non. Expliquer l’importance de l’autocatalyse dans la production de molécules organiques simples (sucres) ou de biopolymères (acides nucléiques) OAV4 : Citer les forces intermole´culaires et leurs conse´quences sur le comportement des mole´cules amphiphiles en lien avec l’assemblage de compartiment. Lister les propriétés physicochimiques de l’eau. Enumérer et discuter les différentes forces intermoléculaires intervenant entre un soluté et un solvant. Identifier les parties polaires ou apolaires d’une molécule. Prédire si un soluté est soluble/miscible dans un solvant donné. Décrire et représenter/schématiser la structure d’une molécule amphiphile et en déduire ses propriétés et son comportement en milieu aqueux, en fonction de sa concentration, et de la présence d’autres molécules amphiphiles. Définir la concentration micellaire critique (CMC) d’un détergent. OAV5 : Illustrer l’importance du stockage d’information dans l’e´volution biologique et dans la multiplication et le bon fonctionnement de protocellules. Expliquer pourquoi les systèmes vivant doivent pouvoir stocker et transmettre des informations. Citer les propriétés de l’ARN qui ont conduit à la théorie du monde ARN. Citer les limites de cette théorie. Illustrer comment la sélection darwinienne et l’évolution peuvent s’appliquer à une population d’acides nucléiques, et pourquoi le taux de mutation ne doit être ni trop faible ni trop élevé. Représenter une cellule minimale et décrire son fonctionnement, identifier pourquoi un système peut correspondre ou non à une protocellule viable. OAV6 (Transversal) : Appliquer un protocole expérimental simple pour réaliser, à l’aide d’outils appropriés, des observations, les analyser et en produire un compte-rendu écrit structuré. Mettre en œuvre un protocole expérimental simple Nommer le matériel et appareillage mis à disposition. Employer correctement du matériel et des équipements de laboratoire en (micropipette, spectrophotomètre…) en respectant les consignes, et les règles de sécurité. Calculer des grandeurs caractéristiques théoriques ou expérimentales, et les comparer Au travers d’un compte-rendu structuré, décrire le principe et l’objectif des expériences réalisées, schématiser les phénomènes observés expérimentalement, et justifier les conclusions de manière logique. Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement Cet enseignement bi-disciplinaire (chimie et biologie) s'appuie sur la question de l'origine de la vie pour présenter les lois physiques et chimiques qui régissent la nature, les propriétés et la formation des molécules du vivant, ainsi que les propriétés minimales communes à tout système vivant. Il présente les hypothèses concernant comment ont pu se former les molécules simples et les structures moléculaires plus complexes dans les conditions du milieu environnant (terre primitive), et comment ces structures ont pu se combiner pour permettre l’émergence de la vie, son maintien et son évolution sur plusieurs milliards d’années. Le cadre thématique de l’origine de la vie, pris en exemple, permettra d’illustrer les différentes approches d’une démarche scientifique, et l’importance de l’interdisciplinarité dans la résolution d’une question scientifique. Contenu des cours magistraux (6h: 4 x 1h30) Introduction, définition du vivant, hypothèses actuelles sur l’émergence de la vie, hypothèses sur les lieux d’émergence de la vie terrestre, arguments et contre-arguments. Structure et propriétés des briques de la vie (fonctions chimiques, interactions, chiralité, polymérisation) Energie de liaison (entre particules, et entre atomes) et énergie échangée au cours d’une réaction. Echanges de protons et d’électrons (réactions acide-base et réactions d’oxydo-réduction) Réactions chimiques : Energie d’activation et énergie libre de Gibbs Réactions chimiques : Optimisation via la catalyse, l’activation de molécules, et le couplage de réactions. Autocatalyse Notion de compartimentation : structure et propriétés de l’eau, comportement des molécules amphiphiles en milieu aqueux. Propriétés d’auto-asssemblage. Stockage et transmission d’information : structure et propriété des acides nucléiques – le monde ARN, arguments et contre-arguments Vers la première protocellule : Etudes de différents modèles de protocellules Contenu des TD (9.5h) TD (1h30): Energie de liaisons. Réactions Redox TD (1h30): structure et propriétés des briques du vivants. Réactions acide-bases. Chiralité du monde vivant TD (2h): Réactions chimiques en phase aqueuse. Aspect cinétique et thermodynamique, optimisation des réactions TD (1h30): Liaisons intermoléculaires, assemblage d’amphiphiles TD (1h30): Monde ARN : transmission d’information et évolution. Protocellules : les différents modèles TD Accompagnement personnalisé (1h30): soutien ou renforcement Contenu des TP (4h30) Illustration de la compartimentation: Formation de liposomes, et propriétés d’encapsulation Pré-requis : Pré-requis obligatoires Savoir nommer la valence des atomes de carbone, oxyge`ne, hydroge`ne et azote Connai^tre la structure e´lectronique des atomes et la formation des liaisons covalentes a` l’origine des mole´cules. Connai^tre les diffe´rents types de liaisons (faibles et fortes) inter et intramole´culaires. Citer les grandes cate´gories de mole´cules qui composent le vivant. Connai^tre les macromole´cules du vivant et leur ro^le dans la cellule. Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre 1 Bibliographie : Bibliographie, lectures recommandées 1- Muriel Gargaud, Herve´ Martin, Purificacion Lopez-Garcia, Thierry Montmerle, Robert Pascal –Le Soleil, la Terre... la Vie, la que^te des origines (Belin – Pour la science). 2009. 2- Andre´ Brack et Franc¸ois Raulin-L’e´volution chimique et les origines de la vie (Masson) - 1997. 3- Marie-Christine Maurel –La naissance de la vie (Dunod) – 2003. 4- Pratt et Cornely – Biochimie (De Boeck)- 2012 5- Drew Myers-Surfaces, Interfaces, and Colloids: Principles and Applications-Wiley-VCH-1999 6- Franc¸oise Brochard-Wyart-Chimie Ge´ne´rale-Dunod-2016 Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Cours Magistraux (CM): 4 x 1h30, qui poseront les connaissances à acquérir TD : 5 TD d' 1h30 et 1 TD de 2h00, qui illustreront certaines notions décrites en cours, et permettront l'acquisition des compétences à acquérir Les deux premiers TD illustreront les deux premiers cours. Les deux dernier TD et le TP illustreront les notions abordées au cours des deux derniers cours. Un contrôle continu (CC1) en salle d'examen permettra d'évaluer les connaissances et compétence acquise à l'issue de ces deux premier CM et TD. A l'issue du CC1, un TD d'1h30 d'accompagnement personnalisé sera réalisé dans des buts de soutien ou de renforcement. Les deux TD suivants et les deux derniers cours feront l'objet d'un contrôle continu en salle de TD. Un examen terminal de synthèse portera sur l'ensemble des enseignements (CM, TD,TP)
PPEI - Comprendre l'Entreprise - 1ère partie	2.5	12
PPEI - Comprendre l'Entreprise - 1ère partie Langue d'enseignement : Français ECTS : 2.5 Détail du volume horaire : Cours : 12 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : JEAN-MARC SENG Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Définir les différents types d'entreprises. Préciser le vocabulaire de l'entreprise. Discriminer chiffre d'affaire et bénéfices. Discuter autour des principes de base de l'économie générale et de l'entreprise. Prendre la parole en public : transmettre sa pensée, gérer son stress et prendre confiance soi. Programme/plan/contenus : L’objectif du module CLE1 est double : (1) rendre le monde de l’entreprise accessible à des étudiants qui suivent un parcours scientifique en leur expliquant les fondamentaux de façon originale et pédagogique ; (2) donner les bases fondamentales d’Economie générale. L'UE comprend également une journée de rencontres et d'échanges avec des acteurs de l'environnement socio-professionnel, ainsi que des ateliers de travail de la posture et de l'éloquence pour apprendre à mieux se valoriser. Cette UE s’adosse à l’Unité d’Enseignement « Explorer son Environnement Professionnel » (EEP) de façon à permettre aux étudiants de mieux préciser leur projet professionnel. Module 1. Les Fondamentaux de l’Entreprise - 6h La multinationale et la start up : what else ? Le Point Mort de l’entreprise est d’abord un Point de Vie ! Ne pas confondre : Chiffres d’Affaires et Bénéfices Du marché tu t’approcheras, des sirènes de l’Etat tu t’éloigneras… La rentabilité à tout prix ? Développement durable et Développement soutenable Module 2. Economie générale - 6h Fonctionnement du marché (ajustement de l’offre et de la demande) Coûts de production et recherche de profit (économie d’échelle et d’envergure) Concurrence et stratégies des firmes (stratégie tarifaire, différenciation, innovation) Module 3. Journée des Métiers et des Formations - 6h Module 4. Lab'Oratoire, posture et savoir-être - 6h Ce module propose à l'étudiant d’engager une réflexion personnelle sur lui et sur ce qui l'anime dans sa vie, et de l'aider à développer une meilleure connaissance de lui-même et à cultiver sa confiance en lui. Il l'invite à observer sa place dans le monde d’aujourd’hui, à réfléchir sur ses choix passés ou à venir et à repenser son rapport aux autres. Ce travail de reconnaissance de soi a son importance à l’heure d’aujourd’hui pour aider l'étudiant à faire des choix qui lui ressemblent et à mieux se projeter vers son avenir. Ce module lui offre ainsi l’opportunité de pouvoir exercer sa liberté à construire un projet de vie personnelle et professionnelle qui lui correspond. Différentes séances pour acquérir la maîtrise de l'éloquence et de sa prestance, pour savoir structurer sa pensée à l'oral, incarner sa posture au service de son propos. - travail sur la voix, la posture et son développement personnel par la confiance en soi et la gestion du stress. - mise en pratique autour d'exercices oratoires, porter son projet à l’oral et l’ancrer. Pré-requis : Aucun pré-requis obligatoire. Semestre calendaire : L'UE CLE 1 se déroule au premier semestre de l'année. Modalités pédagogiques particulières Modules sur les principes fondamentaux de l'entreprise et de l'économie générale : 6 séances de 1h45 et 1 séance de 1h30 de cours et de mise en situation en amphi. Journée des métiers et des formations : échanges avec des acteurs du monde socio-professionnel et témoignages d'anciens étudiants sur leur parcours professionnel. Atelier Lab'Oratoire : 2 séances de 3h ou 3 séances de 2h en groupe de TD.
Calcul scientifique avec Python	4	12		24
Calcul scientifique avec Python Langue d'enseignement : Français ECTS : 4 Détail du volume horaire : Cours : 12 Travaux pratiques : 24 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés :
Programmation impérative	5	10	14	22
Programmation impérative Langue d'enseignement : Français ECTS : 5 Détail du volume horaire : Cours : 10 Travaux dirigés : 14 Travaux pratiques : 22 Modalités d'organisation et de suivi : Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Introduction à la programmation impérative (en C++) Programme/plan/contenus : Le contenu de l'UE se décompose comme suit: - Introduction à la programmation impérative (en C++): variables, types, conditionnelles, boucles, fonctions, tableaux (1D et 2D), chaînes de caractères, fichiers, compilation séparée. - Bonnes pratiques de programmation: tests, documentation, débogage, programmation modulaire. Responsable : Nicolas Thi ér y Pré-requis : Aucun Semestre calendaire : S1 Modalités pédagogiques particulières L’enseignement s’effectue sous la forme d'amphi (~100 étudiants) et de séances de TD+TP (1h45+2h) en petits groupes (~25-35 étudiants). Les premières séances s'appuient sur des feuilles de travail interactives (Jupyter) permettant d'aborder les premières notions dans un environnement web simple. Par la suite est introduite la compilation. Les dernières semaines sont consacrées à un projet de programmation (traitement d'image, analyse de données libres, jeu 2048, ...). Tout du long, les étudiants ont à leur disposition des exercices en ligne (PL) pour s'entraîner et s'auto-évaluer. Ces enseignements sont complétés par une ou deux conférences invitées sur les grands enjeux sociétaux de l'informatique.
Mathématiques, informatique pour la biologie	4.5	10	10	16
Mathématiques, informatique pour la biologie Langue d'enseignement : Français ECTS : 4.5 Détail du volume horaire : Cours : 10 Travaux dirigés : 10 Travaux pratiques : 16 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : BRUNO VALLET NATALIA CONDE E SILVA-RIOU JUDITH LEGRAND Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir - manipuler les outils de mathématiques enseignés (suites logistiques, modèles booléens, systèmes d'équations différentielles) - formaliser un problème biologique - décrire des exemples types de développement et de cycle cellulaire - obtenir des données brutes utilisables pour une modélisation - faire le lien entre une variable/un paramètre biologique et une variable/un paramètre mathématique - utiliser un script informatique déjà programmé sous R Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement L’objectif de cet enseignement est d’aborder pour la première fois l’approche de modélisation mathématique en traçant des ponts entre des problèmes biologiques pratiques, des questions de biologie théorique et des outils mathématiques. Les étudiants aborderont de nouvelles méthodes mathématiques souvent utilisées pour modéliser des systèmes biologiques. Ils seront amenés à mobiliser leurs connaissances en mathématique pour formaliser et modéliser des systèmes biologiques qu’ils auront en parallèle étudié de façon expérimentale. Ils pourront mettre en regard les données biologiques fournies lors des séances de TP et les prédictions des modèles mathématiques. Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre S2. UFR des Sciences (campus Orsay) Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi L’UE comportera : - des cours-TD de mathématiques sur des méthodes utilisées en modélisation mathématique (suites, systèmes d’équations différentielles, réseaux booléens) - des cours et TPs de biologie sur trois thématiques : la phyllotaxie, le développement, le cycle cellulaire - des TPs de modélisation mathématique sur ces mêmes thématiques
Projet tutoré biomathématiques	3		4	8
Projet tutoré biomathématiques Langue d'enseignement : Français ECTS : 3 Détail du volume horaire : Travaux dirigés : 4 Travaux pratiques : 8 Modalités d'organisation et de suivi : Responsable : NATALIA CONDE E SILVA-RIOU JUDITH LEGRAND Objectifs pédagogiques visés : Objectifs d'apprentissage : Compétences à acquérir - travailler en groupe - rédiger un document de synthèse - savoir formaliser et modéliser un problème biologique en mobilisant des connaissances en biologie et en mathématiques - élaborer un algorithme pour effectuer des simulations Programme/plan/contenus : Description du contenu de l'enseignement L’objectif de cet enseignement est de mettre en pratique une approche de modélisation mathématique à travers un travail en groupe. Plusieurs sujets de projet seront proposés sur des thématiques biologiques différentes. Les étudiants seront en groupe 4-5 étudiants pour traiter chaque sujet. Chaque groupe devra comprendre le sujet et son contexte général, associer une question biologique précise. Pour répondre à la question, les étudiants proposeront un modèle mathématique et une démarche théorique ou de simulation la mettront en œuvre. Les groupes devront travailler régulièrement en autonomie entre des séances de suivi encadrées par des tuteurs mathématiciens, biologistes ou bio-mathématiciens. Chaque groupe devra restituer son travail sous-forme d’un document écrit et d’une présentation orale. Semestre calendaire : Pré-requis recommandés Semestre S2. UFR des Sciences (campus d'Orsay). Modalités pédagogiques particulières Modalités d'organisation et de suivi Les étudiants travailleront par groupe 4-5 étudiants sur un projet. Les groupes devront travailler en autonomie entre des séances de suivi encadrées par des tuteurs mathématiciens, biologistes ou bio-mathématiciens.

Admission

Modalités de candidature / d’inscription

Modalités d'inscription

Les candidatures se font par Parcoursup ou via Etudes en France (ou dossier DAP) pour les étudiants internationaux extracommunautaires.