M2 Microbiologie fondamentale

• Maîtriser les connaissances fondamentales concernant la diversité du monde microbien et les domaines de la génétique, génomique avec un focus plus particulier sur la biologie de la cellule microbienne pour le cursus « Molecular and Cellular Microbiology » et davantage tourné vers la compréhension des cycles viraux des cellules eucaryotes et procaryotes pour le cursus « Virology », les deux cursus incluant une vision intégrée des mécanismes moléculaires aux interactions cellulaires.
• Développer un savoir-faire expérimental et une maîtrise des approches ciblées et globales dans le domaine de la Microbiologie (design expérimental, clonage, culture microbienne ou analyse des cycles viraux, extraction et analyses quantitatives d’acides nucléiques ou de protéines, analyse et représentation de jeux de données, notamment).
• Développer un savoir-faire dans le domaine de l’exploration et de la représentation de données (niveau : initiation à l’utilisation de R).
• Communiquer en anglais dans le contexte scientifique (comprendre des séminaires, recevoir des instructions, présenter le contexte scientifique et des résultats expérimentaux, poser des questions et répondre à des questions en anglais).
• Mener en toute autonomie un projet scientifique, et pouvoir communiquer une analyse critique des résultats, à l’oral et l’écrit, en respectant les standards internationaux dans le domaine de la Microbiologie.
• Développer la capacité à travailler en équipe autour de projets bibliographiques et expérimentaux ayant trait à la Microbiologie.

Le programme est international et met l'accent sur la recherche afin de préparer les étudiants aux défis modernes de la microbiologie. Il couvre une variété de modèles (bactéries, archées, micro-organismes eucaryotes, virus) et plusieurs échelles d'analyse, des molécules aux génomes, cellules et communautés. 

Au cours du premier semestre, les étudiants acquièrent des connaissances en génomique et en ingénierie du vivant grâce au programme de base « Explorer et innover », complété par des cours pratiques et des unités d'enseignement optionnelles dans les domaines de la microbiologie moléculaire et cellulaire, de la virologie eucaryote et procaryote, des interactions microbiennes et de la pensée critique utilisant l'intelligence artificielle, entre autres. 

Pendant le second semestre l'étudiant(e) réalise un stage de M2 en laboratoire qui correspond à une formation qualifiante à travers une activité de recherche de 6 mois dans un domaine ayant trait à la Microbiologie. Il permet de former l'étudiant(e) aux techniques expérimentales mais aussi à la rédaction de projet(s) et à la communication scientifique orale. Le stage peut se dérouler au sein des laboratoires de Paris-Saclay [Institut de Biologie Integrative de la Cellule (I2BC), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé Humaine (MICALIS), L'Institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant (IDEEV), Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliqué (LBPA, ENS Paris-Saclay)], des grands instituts de recherche de Paris centre (Institut Pasteur, Institut Jacques Monod), en région ou à l'étranger.   

Le taux de réussite des étudiants inscrits au M2 Fundamental Microbiology est de 94 % (2015-2025). Le taux de poursuite en thèse des étudiants diplômés s’élève en moyenne à 61 % (2015-2025). Ces thèses sont réalisées à 55 % dans un laboratoire de l’Université Paris-Saclay (UPSaclay), 33 % dans un laboratoire français non UPSaclay et 12 % à l’étranger. Environ 13 % des diplômés s’insèrent dans le monde socio-économique à Bac+5 (emploi d’ingénieur d’études ou d’enseignants agrégés ou de chargé de communication au sein d'un institut de Recherche) et environ 20 % poursuivent leurs études (cursus ENS, filière médicale, attaché.e de recherche clinique, etc.).