M2 Immunologie

32 heures de cours répartis sur 4 jours à la faculté de médecine de l’hôpital Henri Mondor à Créteil.

•Connaissance des mécanismes du développement des progéniteurs lymphoïdes à partir de la cellule souche hématopoïétique.
•Développement des différentes populations immunitaires et leurs implications dans l'immunité normale et dans certaines situations pathologiques, notamment:
?Lymphocytes B
?Lymphocytes T
?Cellules dendritiques
?Cellules lymphoïdes innées
?Cellules NK-T
•Mécanismes de la mémoire immunitaire
•Développement de l'immunité intestinale.

Master 1 d’Immunologie après un parcours scientifique, médical, pharmaceutique ou vétérinaire.

Bibliographie donnée par chaque enseignant.

Octobre - Novembre.

Université Paris-Est Créteil - Faculté de Médecine Henri Mondor

33H45 réparties sur 5 jours à la faculté de Médecine Paris Sud. Certains cours sont délivrés en anglais.

- Description des bases générales de l’immunologie et organisation du système lymphoide
- Description de l’immunité Innée et des signaux de Danger
- Description des cellules impliquées dans la réponse innée
- Description des mécanismes moléculaires d’acti.

Master 1 avec avec des UE en Immunologie.

Bibliographie fournie par les enseignants.

Novembre.

KREMLIN-BICETRE

22H de cours + 6 heures de travaux dirigés répartis sur 5 jours à la faculté de médecine Paris-Sud du Kremlin Bicêtre.

- Description des principales voies de l’inflammation et des mécanismes de l’auto-immunité
- Description des cibles thérapeutiques intéressantes dans le traitement des maladies inflammatoires et auto-immunes
- Description des outils moléculaires et cellul.

Master 1 d’Immunologie après un parcours scientifique, médical, pharmaceutique ou vétérinaire.

Bibliographie donnée par chaque enseignant.

Novembre.

KREMLIN-BICETRE

Les avancées technologiques récentes dans les domaines de la biologie systémique, de la cytométrie et de l’imagerie ainsi que leurs applications pour la recherche en Immunologie seront présentées dans le cadre de séminaires illustrés par des données concrètes. Les nouvelles méthodes permettant de créer des modèles d’études (édition des génomes, souris humanisées) et leur importance en Immunologie seront également décrites. Les différents séminaires présenteront les approches méthodologiques, leurs avantages et inconvénients ainsi que des exemples d’applications à des cas concrets. L’évaluation se fera sous forme d’un examen terminal qui combinera des questions relatives aux méthodologies et techniques présentées lors des séminaires avec des analyses de résultats obtenus avec ces mêmes techniques, issus d’articles scientifiques.

Cette unité d’enseignement (UE) présente les méthodes d’investigation innovantes dont bénéficie la recherche en Immunologie, qui découlent des avancées scientifiques et technologiques récentes en biologie, et notamment de l’utilisation d’approches quantitatives à haut débit. Des exemples de mise en œuvre de ces méthodes et de leur analyse et visualisation par des approches spécifiques et dédiées sont également explicités.
A l’issue de cet enseignement, il est attendu que l’étudiant puisse:
-Expliquer de façon synthétique, juste et précise les méthodes présentées lors des séminaires et leur analyse.
-Identifier les avantages, inconvénients et complémentarité des différentes méthodes et/ou stratégies d’analyse présentées lors des séminaires.
-Proposer des expériences/méthodologies en lien avec les méthodes présentées et qui pourraient être employées pour répondre à une question scientifique en immunologie.
-Décrire et interpréter méthodiquement des résultats expérimentaux issus de publications scientifiques en faisant appel aux connaissances présentées lors des séminaires.
-Etre critique sur la pertinence de ces résultats selon le design expérimental en lien avec le cours.

Suivre cette UE suppose d’avoir assimilé les notions fondamentales en génétique/génomique, biologie cellulaire et Immunologie (validation de l’UE Immunologie Moléculaire et Cellulaire par exemple).

Octobre - Novembre.

KREMLIN-BICETRE

L’évaluation se fera sur le niveau d’anglais produit dans le document écrit, lors de la présentation orale et au cours de la réponse aux questions.

Cette UE donne à l'étudiant l'occasion de réaliser une communication scientifique en anglais devant un jury. Pour cela, la présentation du travail réalisé dans le cadre de l’UE Projet du M2 est réalisée en anglais. Une préparation à cet oral est proposée à l’étudiant, sous forme de cours et d’enseignement dirigé en petit groupe.

A l’issue de cet enseignement, il est attendu que l’étudiant puisse:
-Préparer un support de présentation en anglais, présentant son projet de stage.
-Présenter son projet de stage à l’oral, en anglais, sans lire son texte ni le réciter.
-Répondre en anglais aux questions posées à l’issue de la présentation en utilisant un vocabulaire et une syntaxe conformes au niveau B2.

Les pré-requis pour cet enseignement sont d’avoir atteint un niveau B1+/B2 en anglais et d’avoir mené à bien le travail demandé dans le cadre de l’UE Projet du M2 Biologie Santé Parcours Immunologie.

Octobre - Novembre - Décembre - Janvier - Février.

KREMLIN-BICETRE

Le projet, présenté par l’étudiant lors d’une présentation orale en anglais, est évalué par un jury composé de membres de l’équipe pédagogique et d’un professeur d’anglais. Les critères d’évaluation comprennent la qualité du support projeté, de la présentation orale et de la discussion. La rigueur de la démarche scientifique ainsi que le réalisme des objectifs proposés sont également pris en compte.

Cette UE correspond à la phase préparatoire du stage de recherche du M2. Cette préparation consiste en un travail de bibliographie, de réflexion et de discussion avec l’encadrant de stage, destiné à préciser les objectifs du stage, les modèles expérimentaux choisis et les expériences qui seront menées pour répondre aux questions posées. Les connaissances essentielles à la réalisation d’un projet de recherche (analyse statistique & aspects règlementaires et éthiques) sont présentées dans le cadre de séminaires.
A l’issue de cet enseignement, il est attendu que l’étudiant puisse:
-Réaliser une synthèse bibliographique sur une thématique identifiée.
-Dégager une problématique scientifique et identifier les objectifs à atteindre dans le cadre d’un stage en laboratoire
-Proposer des expériences pour répondre à une question scientifique, en tenant compte des données de la littérature, des aspects règlementaires et des contraintes statistiques.
-Présenter un projet scientifique de façon structurée, en mettant en évidence le contexte scientifique, l'état des connaissances, les objectifs et les résultats attendus.
-Discuter de son projet avec son encadrant et le jury.

Octobre - Novembre - Décembre - Janvier - Février.

KREMLIN-BICETRE

Pierre Bobé et Olivier Dellis.

Les lymphocytes T CD4+ et T CD8+ sont les sous-populations cellulaires dans lesquelles seront analysées, par cytométrie en flux, les voies de signalisation induites par l’activation du P2X7 ou du TCR. Par exemple, pour l’étude de la voie de signalisation P2X7/ATP, des suspensions de cellules spléniques provenant de souris C57BL/6 seront stimulées ex vivo par de l’ATP puis marquées avec des sondes et des anticorps monoclonaux fluorescents spécifiques de cette voie ainsi que par des anticorps monoclonaux fluorescents permettant de caractériser le phénotype des cellules. Après marquage, les cellules seront analysées par cytométrie en flux afin de quantifier dans les lymphocytes T certaines étapes clés de la signalisation de P2X7.

L’objectif de cette UE est de familiariser les étudiants aux méthodologies de l’analyse multiparamétrique, par cytométrie en flux, des cascades de transduction du signal sur cellule unique. Les voies de signalisation étudiées sont celles du récepteur purinergique P2X7 et du récepteur d’antigène des lymphocytes T (TCR). L’activation du TCR et du P2X7 par leurs ligands respectifs sera évaluée en mesurant: (1) l’influx calcique, (2) la cinétique de phosphorylation des MAP kinases ERK1/2, (3) le clivage protéolytique de la molécule de homing CD62L, (4) l’ouverture du pore P2X7, (5) l’externalisation des phosphatidylsérines. Ces mesures d’activation du P2X7 et du TCR seront réalisées sur des lignées de cellules immunitaires humaines et murines (leucémies T) et sur les différentes sous-populations lymphocytaires présentes dans des suspensions cellulaires hétérogènes préparées à partir de ganglions lymphatiques ou de rates de souris normal ou déficiente pour P2X7. Deux groupes de 6 étudiants (3 binômes) se formeront, en parallèle, aux méthodes d'analyse du rôle du Ca2+ dans les voies de signalisation et à l'analyse multiparamétrique des voies de signalisation par cytométrie en flux.

Aucun pré-requis n’est demandé puisque l’objectif de ce cours pratique de 25 heures est de former les étudiants aux méthodes d'analyse du rôle du Ca2+ dans les voies de signalisation et à l'analyse multiparamétrique des voies de signalisation par cytométrie en flux.

La bibliographie requise pour cette UE sera fournie lors des cours.

Novembre.

ORSAY

Synthèse, présentation orale et discussion critique d’articles scientifiques récents sur l’Immunologie anti-virale au cours d’une séance de 4 heures.

Infections virales. Grands enjeux actuels.
Mécanismes de la réponse immune anti-virale, Persistance virale. Vaccination, Cibles d’immunothérapies. Effecteurs primaires, clairance ou persistance lors d’infections aigues. Génération, maintenance et réactivation des réponses mémoires. Infections chroniques. Stratégies d’échappement viral. Epuisement/anergie des réponses mémoires, restauration immune.
Infection par le VIH. Entrée cellulaire et réplication du VIH. Réponses immunes anti-VIH. VIH et muqueuse digestive. Limites des antirétroviraux, réplication résiduelle et réservoirs latents. Infections opportunistes virales et restauration immune. Approches vaccinales et d’immunothérapie.
Virus oncogènes. Syndromes lymphoprolifératifs viro-induits. Réponses anti-EBV et HHV8. Papillomavirus humains, réponse immune et vaccins.
Foie et Virus. Hépatites virales aigues et chroniques. Réponses immunes et vaccins
Infections virales émergentes. Fièvres hémorragiques. Virus du Chikugunya. Thérapies et Biothérapies immunosuppressives et réactivations virales: virus JC et leucoencéphalite multifocale progressive, néphropathies à BK virus. Biomarqueurs prédictifs.

Master 1 d’Immunologie.

Chaque enseignant fournit la bibliographie correspondant à son cours. Par ailleurs, une liste d’articles est fournie aux étudiants pour la préparation de la partie présentation d’articles.

Novembre - Décembre.

KREMLIN-BICETRE

L'enseignement se déroule sur 3-4 jours et comprend 22 h de cours littéral. Il est suivi de 4 h d'examen (2 h pour répondre à deux questions de cours, et deux heures pour lecture d'un article scientifique en anglais et rédaction de questions autour de la problématique et des réponses proposées par les auteurs, conduisant à 2 notes sur 20, rédaction en français ou anglais). Cet enseignement est interactif, dispensé par des Professeurs d'Université, ou de Médecine ou des post-doctorants ayant soutenu un brillant PhD in situ. La plupart des professeurs ont une renommée internationale dans leur domaine (provenant d'horizons divers, comme Singapore, Italie ou US) et sont membres de la European Academy of Tumor Immunology. Il est généralement adossé à une conférence gratuite (patronnée par Miltenyi Biotec Conference, et les fondateurs de la European Academy of Tumor Immunology) début Juillet (ayant lieu aux Centre de recherche des Cordeliers ou Cité Universitaire) chaque année.

L'enseignement traite de l'immunologie des tumeurs et l'immunothérapie des cancers, illustrant les notions d'immunité innée et acquise dans le cadre des tumeurs murines et humaines. Seront abordés :
-Le concept d'immunosurveillance antitumorale (3E de Schreiber, immune atlas et immunoscore de Galon et Fridman), la biologie des cellules dendritiques, des cellules NK, la dynamique des lymphocytes (migration), les régulateurs de l'immunité (Treg, Breg, cytokines immunosuppressives, exosomes), la présentation antigénique et les facteurs d'immunosuppression.
-La vaccination prophylactique et thérapeutique, les cytokines systémiques, les anticorps monoclonaux, les inhibiteurs des points de contrôle du système immunitaire, les virus oncolytiques, la thérapie adoptive lymphocytaire (CAR-T, T) et les combinaisons actuelles (locales, systémiques).
-Les approches d'immuno-monitoring actuelles et en développement (e.g. single cell RNA Seq) avec leurs limitations.
-L'introduction du microbiote en immunité antitumorale, des alicaments (prébiotiques, probiotiques, caloric restriction mimetics) et des techniques pour les évaluer.
Une critique du champ d'application sera proposée au fil des cours.

Les étudiants (masters 2, médecins, pharmaciens, vétérinaires, biologistes, autres) doivent être titulaires d'un master 1, être inscrits à l'enseignement de master 2 "Biologie Santé Immunologie Paris-Sud / Paris-Saclay" ou équivalent d'appartenance universitaire et avoir la maîtrise de la langue française ou anglaise.

Deux ouvrages sont conseillés pour obtenir la plupart des notions dispensées, l'un en français et l'autre en langue anglosaxonne. Immunothérapie des cancers au troisième millénaire Broché – 18 juin 2015 de Laurence Zitvogel (Auteur), Dalil Hannani (Auteur), François Martin (Auteur), & 2 plus Oncoimmunology: A Practical Guide for Cancer Immunotherapy (English Edition) 1st ed. 2018 Edition, Format Kindle de Laurence Zitvogel (Sous la direction de), Guido Kroemer (Sous la direction de).

Décembre.

KREMLIN-BICETRE

Cette UE se déroule sur une semaine. Des cours sont dispensés du lundi au jeudi, matin et après-midi par des intervenants français spécialistes de domaines liés à l’immunité innée anti-infectieuse. Différents types d’infection sont envisagés, ainsi que les principaux mécanismes cellulaires. Les intervenants sont des cliniciens, des chercheurs, des biologistes, immunologistes ou microbiologistes. Il existe donc un des enseignements de biologie fondamentale mais aussi translationnelle. Des applications thérapeutiques innovantes sont évoquées. Deux semaines environ avant le début des cours, des articles de haut niveau international sont proposés aux étudiants. Ils doivent en choisir un qu’ils exposeront en binôme à l’oral le dernier jour au cours de deux sessions parallèles en plus petit groupe. Cet exposé constituera la partie contrôle continu de leur note d’examen. L’autre partie sera un examen écrit anonyme, comprenant en général une analyse d’article et des questions de cours.

Cette UE de Master2 est à la frontière de l'immunologie et de la microbiologie. Elle est dédiée à la compréhension des mécanismes de l'immunité innée en réponse à une agression microbienne (bactérie, virus, parasite, champignon, bactériophage…) de l'hôte. L'accent est mis sur le rôle des cellules phagocytaires, en particulier les polynucléaires neutrophiles et leurs grandes fonctions (expression des récepteurs de type TLR et NLR, migration, explosion oxydative, dégranulation et synthèse de médiateurs, nétose, apoptose ...). Les mécanismes d'autophagie sont aussi exposés. Des exemples d'organes-cibles de cette réponse innée sont donnés, comme le poumon, le tube digestif ou les articulations. Les pistes thérapeutiques innovantes visant à moduler cette réponse innée dans le cadre d’infections sévères sont évaluées et discutées.
Les intervenants sont immunologistes ou microbiologistes, chercheurs ou cliniciens, afin d'assurer une formation translationnelle.
Une analyse critique d'article avec présentation orale permet à chaque étudiant de faire une synthèse de l'enseignement.

Connaissances solides en immunologie et microbiologie. Master1 ou équivalence validée.

Synergy between the Host Immune System and Bacteriophage Is Essential for Successful Phage Therapy against an Acute Respiratory Pathogen. Roach DR, Leung CY and Debarbieux L. Cell Host Microbe. 2017 Jul 12;22(1):38-47. SAPHO, autophagy, IL-1, FoxO1, and Propionibacterium (Cutibacterium) acnes. Berthelot JM, and Hayem G. Joint Bone Spine. 2018 Mar;85(2):171-176. Neutrophil Extracellular Traps Are Elevated in Patients with Pneumonia-related Acute Respiratory Distress Syndrome. Bendib I, de Chaisemartin L, Granger V, Chollet-Martin S, and de Prost N. Anesthesiology. 2019 Apr;130(4):581-591.

Novembre.

CHATENAY

L'étudiant trouve un stage parmi les offres de stage proposées dans le cadre de la formation ou en contactant les équipes de recherche de son choix et fait valider son choix de stage par les responsables du Master 2. Le stage de recherche dure 6 mois au cours desquels l’étudiant réalise une série d’expériences pour répondre à une question scientifique précise et définie. Le travail est évalué sur la base d’un rapport écrit, de la présentation orale des résultats et de leur interprétation et de la discussion des travaux avec les membres du jury.

Cette UE correspond à la partie pratique du M2 Biologie Santé Parcours Immunologie. L'étudiant se voit confier un projet par le chercheur qui l'encadre. Il participe à la conception des expériences qui répondront à la question posée et les réalise. Il analyse et interprète les résultats obtenus à l'issue de son travail expérimental et les met en forme pour communication à son encadrant et au jury.

A l’issue de cet enseignement, il est attendu que l’étudiant puisse:
-Conduire une démarche scientifique en élaborant des stratégies permettant de tester une hypothèse dans le cadre d’un projet de recherche en Immunologie, en intégrant les contraintes de temps et de moyens inhérents à son environnement.
-Concevoir et réaliser des expériences en intégrant les contrôles requis pour permettre leur interprétation
-Interpréter les résultats de ses expérimentations et se montrer critique envers les conclusions qui peuvent en être tirées
-Communiquer les résultats de ses travaux scientifiques ainsi que leur interprétation au sein d’une structure de recherche et auprès du jury.

Les pré-requis pour l’UE stage sont d’avoir mené à bien le travail demandé dans le cadre de l’UE Projet du M2 Biologie Santé Parcours Immunologie.

Janvier - Février - Mars - Avril - Mai - Juin - Juillet.

KREMLIN-BICETRE