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M2 Evolution des Génomes, des Populations et des Espèces : Données et Modèles (EvoGEM)

Candidater à la formation
  • Capacité d'accueil
    20
  • Langue(s) d'enseignement
    Français
  • Régime(s) d'inscription
    Formation initiale
Présentation
Objectifs pédagogiques de la formation

L’approche génomique a révolutionné presque tous les domaines des sciences du vivant avec des applications en médecine, en épidémiologie, en écologie, en microbiologie, en sélection variétale, en biologie de la conservation. Plus que jamais, les recherches dans ces domaines s’appuient sur les sciences de l’évolution et nécessitent des développements théoriques et méthodologiques conséquents. Ces développements sont indispensables pour intégrer la complexité et l’hétérogénéité des données, et pour affiner notre compréhension des mécanismes de l’évolution à l’échelle des populations, des espèces et des écosystèmes.

Le M2 EvoGEM a pour objectif d’acquérir une expertise solide en génétique de l’évolution, avec une spécialisation sur la modélisation, les mathématiques, la bioinformatique, et la génomique. EvoGEM est construit en collaboration avec quatre autres établissements franciliens. L’implication de chercheurs dans la formation permet de renforcer le continuum formation-recherche.

Pré-requis, profil d’entrée permettant d'intégrer la formation

Cette formation s'adresse aux étudiants français et étrangers des universités et des écoles d'ingénieur des filières mathématiques, informatique ou biologie, ayant démontré un intérêt selon leur origine soit pour la biologie, soit pour la modélisation et le traitement des données.

Il faut donc :

- Être titulaire d’un M1 en sciences de la vie ou équivalent et avoir de bonnes aptitudes en mathématiques et informatique (programmation et utilisation de logiciels)

ou

- Être titulaire d’un M1 en mathématiques / physique / informatique avec un goût prononcé pour les problématiques biologiques.

Modalités pédagogiques particulières
Informations complémentaires

Lieux d’enseignement

Orsay

Palaiseau

Paris Sciences et Lettres (Ecole Normale Supérieure)

Sorbonne Université

Université Paris-Cité

Muséum National d’Histoire Naturelle

Compétences
  • Une solide culture générale en évolution 

  • Des compétences en analyses de données génomiques 

  • Une expertise en modélisation, mathématiques appliquées à la génétique et la génomique de l’évolution 

  • Une expertise en génétique des caractères complexes et biologie prédictive

Débouchés de la formation

Cette formation sera une porte d’entrée soit vers une thèse de science, début d’une carrière académique en évolution, écologie, épidémiologie, santé, cancérologie, génétique ou microbiologie, soit vers le secteur privé comme "bioanalyste" dans les domaines de la biotechnologie, de la santé, de l’environnement, de l’alimentation ou plus largement dans tout type d’entreprise travaillant sur des données complexes.

Collaboration(s)
Laboratoire(s) partenaire(s) de la formation

Dans le périmètre Paris-Saclay :

Génétique Quantitative et Evolution (GQE, IDEEV)

Evolution, Génomes, Comportement, Ecologie (EGCE, IDEEV)

Ecologie Systématique et Evolution (ESE, IDEEV)

Laboratoire Interdisciplinaire des Sciences du Numérique (LISN)

 

En Ile-de-France :

Laboratoires de Paris intra-muros à l’Institut de Biologie Physico-Chimique, du Collège de France (CIRB), de l’ENS-PSL (IBENS), du campus Jussieu (IEES, IMPMC, LBCQ), du MNHN (ISYEB), de l’Institut Jacques Monod, de l’Institut Pasteur, du Musée de l’Homme et de l’Hôpital Cochin.

Programme
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Inférence statistique et théorie de l’apprentissage 9 72
Biologie (Bio 0) 0 27 3
Informatique (Info 0) 0 10 20
Mathématiques (Maths 0) 0 15 15
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Bases de la mécanique des milieux continus 3 24
Approches comparatives phylogénétiques (ACP) 6 18 9 27
Génétique des populations (GPOP) 6 36 18
Génétique quantitative (GQ) 6 18 9 27
Modèles aléatoires en écologie et évolution (MAEE) 3 15 15
Modélisation mathématique avancée pour la génétique évolutive (MMAGE) 3 15 15
Projet transversal (Projet) 3 72
Théorie, modèle et explication scientifique en sciences de l’évolution (EVO) 3 15 15
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Mécanique analytique 3 24
Stage 30

Semestre 1

 

UC à choix de remise à niveau :

 

des modules de remise à niveau en biologie, mathématiques, informatique sont recommandés selon le cursus initial de l’étudiant. Pas d’ECTS.

 

BIO 0 : Compléments en Biologie (SU)

INFO 0 : Compléments en Informatique (SU)

MATHS 0 : Compléments en Mathématiques (SU)

UC obligatoires :

ces UC sont obligatoires si l’étudiant suit le parcours EvoGEM.

EVO : Théorie, modèle et explication scientifique en sciences de l’évolution (MNHN) – 3 ECTS

MATHS 1 : Modèles et outils mathématiques en biologie évolutive (AgroPT) – 3 ECTS

GPOP : Génétique des populations (ENS-PSL) – 6 ECTS

GQ : Générique quantitative (UPSaclay) – 6 ECTS

MATHS 2 : Connaissance approfondie des modèles (ENS-PSL) – 3 ECTS

ACP : Approches comparatives phylogénétiques (MNHN) – 6 ECTS

Projet : Projet transversal (Rendu UPC) – 3 ECTS

 

Semestre 2

Le second semestre est composé d’un stage obligatoire en laboratoire de recherche de 6 mois.

Stage – 30 ECTS

Modalités de candidatures
Période(s) de candidatures
Du 01/05/2022 au 15/07/2022
Pièces justificatives obligatoires
  • Lettre de motivation.

  • Curriculum Vitae.

  • Tous les relevés de notes des années/semestres validés depuis le BAC à la date de la candidature.

  • Descriptif détaillé et volume horaire des enseignements suivis depuis le début du cursus universitaire.

Pièces justificatives complémentaires

Vous devez Impérativement déposer votre candidature sur le site Internet de l'Université Paris-Saclay : www.universite-paris-saday.fr/formation/master

+ choisir Graduate School : « Biosphera »

+ choisir la mention « Biodiversité, Ecologie et Evolution » puis le M2 concerné pour candidater en ligne

Période de candidatures :

Du 1er mai au 15 juillet

Contact(s)
Responsable(s) de la formation
Secrétariat pédagogique