Le M2 BIBS-IA du Master Bioinformatique forme des experts en recherche et développement à l’intersection de la biologie, de l’informatique et des mathématiques. Les étudiants acquièrent des compétences recherchées en intelligence artificielle, gestion et analyse de données et modélisation dans divers domaines de la bioinformatique - génomique, biologie structurale, biologie évolutive, santé numérique. Ces connaissances sont appliquées en sciences du vivant, médecine, environnement et agronomie.
Le M2 BIBS-IA est construit dans la continuité du M1 BIBS-IA. La section “Profil” indique les pré-requis attendus.
Dans le parcours BIBS-IA, l’intelligence artificielle et la science des données sont très présentes et traitées à la fois d’un point de vue fondamental en mathématiques et informatique, et appliqué en lien fort avec les spécificités des données biologiques et biomédicales.
Des projets et hackathons pluridisciplinaires sont dispensés par des experts du milieu académique et des entreprises. Les étudiants accèdent à un vaste panel de modules d’enseignement au choix, leur permettant de se spécialiser (applications de l’Intelligence artificielle en biologie structurale, en génomique, en contexte clinique, en agronomie …).
Un stage obligatoire de 4 à 6 mois assure une future bonne insertion des étudiants dans le monde du travail, en recherche ou en industrie.
Informations
Compétences
Les compétences acquises en fin de M2 BIBS-IA sont reprises de la fiche nationale du Master de Bioinformatique (RNCP 38964).
- Comprendre les enjeux actuels de la complexité et de la diversité en biologie, et sciences du vivant en général et de contribuer activement à la recherche et à l’innovation dans les secteurs académique, pharmaceutique, biotechnologique, agro-industriel et de la santé ;
- Relever les défis résultant de l'évolution et du développement des technologies de production de données à haut débit, issus de sources multiples et hétérogènes ;
- Maîtriser les approches computationnelles et l’intelligence artificielle pour analyser, modéliser et interpréter des données biomédicales à grande échelle.
- Piloter des projets bioinformatiques de manière autonome, en environnement multidisciplinaire, en développant des solutions innovantes avec des outils et langages informatiques adaptés.
- Expérimenter, développer et tester de nouvelles méthodes, pour explorer des hypothèses en sciences du vivant à la frontière entre recherche fondamentale et appliquée.
Objectifs pédagogiques de la formation
Le M2 BIBS-IA est axé sur les besoins en recherche et développement de haut niveau des entreprises et des organismes de recherche en bioinformatique, et biostatistiques.
Cette formation pluridisciplinaire répond à cette demande en formant des spécialistes à l'interface des disciplines : biologie, informatique et mathématiques.
A l'issue du M2 BIBS-IA, les étudiants maîtrisent plusieurs langages de programmation, un grand nombre de méthodes d'intelligence artificielle, d'algorithmique, de statistiques et de sciences des données, pour stocker, modéliser et analyser des masses de données génomiques et biomédicales. Ils approfondissent par ailleurs des domaines de la bioinformatique (biologie des systèmes, biologie structurale, génomique fonctionnelle) et appliquent les méthodes apprises sur des projets variés, portant sur les sciences du vivant et du médical, ainsi que les sciences de l'environnement et l'agronomie.
Les enseignements du M2 BIBS-IA comportent 6 grands blocs de connaissances et compétences.
- Bloc 1 - Gestion de grands volumes de données et optimisation. Ce bloc comprend trois unités d'enseignement relatives à l’optimisation des traitements de données diverses (bases de données relationnelles et données graphe). Un projet portant sur des données réelles massives permet une mise en application des connaissances acquises.
- Bloc 2 - Génomique haut débit. Ce bloc comprend deux unités d’enseignement avec un focus en génomique comparée et un autre en génomique des populations. Un accent important porte sur l’application des méthodes statistiques dans ces domaines.
- Bloc 3 - Analyse de données et IA pour la biologie. Il comprend trois unités d’enseignement depuis l’acquisition de connaissances fondamentales en IA comme les modèles de machine learning jusqu’à des applications de l’IA en biologie intégrative et en analyse d’images.
- Bloc 4 - Intégrité scientifique et reproductibilité. Il comprend deux unités d’enseignement de préprofessionnalisation sous la forme d’un projet de reprohackathon et d’une unité d’aide à l’insertion professionnelle. Les étudiants acquièrent dans ce bloc l’ensemble des bonnes pratiques attendues et relatives à la science ouverte, l’intégrité scientifique, l’éthique et la sobriété énergétique (impact écologique des pratiques du numérique et notamment de l’Intelligence Artificielle).
- Bloc 5 - Applications Avancées de l'Intelligence Artificielle. Les étudiants font un choix de 4 unités dans le bloc 5. Ce bloc comprend six unités d’enseignement propres au parcours M2 BIBS-IA et dédiées à diverses applications de l’IA. Elles incluent par exemple un “data camp”, hackathon de machine learning sur données réelles (enseignement commun avec l’école polytechnique et Télécom Paris) ou encore, de la fouille de données en agronomie (commun avec AgroParisTech). A ces unités s’ajoutent des unités libres, notamment issues d’autres parcours de Master (Informatique, biologie-santé…).
Débouchés
Professionnels
Après Master + Doctorat : chercheur ou enseignant-chercheur
Ingénieur Bioinformaticien (Recherche et Développement)
Expert en gestion de données
data scientist
Expert science des données
Poursuite d’études
Doctorat en Bioinformatique
Chercheur/chercheuse en R&D ou expert·e en modélisation et analyse de données dans des entreprises ou laboratoires de pointe.
Data Scientist, Data Analyst, Ingénieur·e en Machine Learning dans des secteurs innovants (tech, finance, santé, énergie, etc.) ;
Tarifs et bourses
Les montants peuvent varier selon les formations et votre situation.
Capacité d’accueil
Places
Public visé et prérequis
Most courses in the M2 BIBS-IA program are taught in French, therefore proficiency in the French language is required.
The M2 BIBS-IA is designed as a continuation of the M1 BIBS-IA and brings together three student profiles:
- Students who have successfully completed the M1 BIBS-IA, all of whom are admitted into the M2 BIBS-IA;
- Students from AgroParisTech enrolled in the IODAA track (From Information to Decision through Analysis and Learning), all of whom complete a double degree year with the M2 BIBS-IA;
- (Subject to availability) Students who have completed an M1 equivalent to the M1 BIBS-IA, i.e., who have acquired equivalent knowledge and skills in biology, mathematics, and computer science (see the M1 BIBS-IA program for further details).
Students who already hold a Master’s degree in Bioinformatics are not eligible. Students holding a Master’s degree in a field other than bioinformatics (biology, computer science, or mathematics) may apply for entry into the M1. However, their applications will be considered less of a priority than those from students applying directly after a Bachelor’s degree.
Période(s) de candidature
Du 04/05/2026 au 13/07/2026
Pièces justificatives
Obligatoires
Lettre de motivation.
Tous les relevés de notes des années/semestres validés depuis le BAC à la date de la candidature.
Curriculum Vitae.
Facultatives
Attestation de français (obligatoire pour les non francophones).
Attestation de niveau d'anglais (obligatoire pour les non anglophones) ou Résultats test GMAT/GRE.
Descriptif détaillé et volume horaire des enseignements suivis depuis le début du cursus universitaire.
Dossier VAPP (obligatoire pour toutes les personnes demandant une validation des acquis pour accéder à la formation) https://www.universite-paris-saclay.fr/formation/formation-continue/validation-des-acquis-de-lexperience.
Fiche de choix de M2 (obligatoire pour les candidats inscrits en M1 à l'Université Paris-Saclay) à télécharger sur https://urlz.fr/i3Lo.
Document justificatif des candidats exilés ayant un statut de réfugié, protection subsidiaire ou protection temporaire en France ou à l’étranger (facultatif mais recommandé, un seul document à fournir) :
- Carte de séjour mention réfugié du pays du premier asile
- OU récépissé mention réfugié du pays du premier asile
- OU document du Haut Commissariat des Nations unies pour les réfugiés reconnaissant le statut de réfugié
- OU récépissé mention réfugié délivré en France
- OU carte de séjour avec mention réfugié délivré en France
- OU document faisant état du statut de bénéficiaire de la protection subsidiaire en France ou à l’étranger.