LDD1 Informatique, Sciences de la vie

OAV1 : Expliquer la théorie de l’évolution et l’appliquer à l’analyse de la diversité du vivant a- Reformuler l’histoire des grandes idées en évolution b- Générer des arbres phylogénétiques simples à partir de la description de caractères morphologiques ou moléculaires c- Analyser les changements morphologiques ou moléculaires sur un arbre phylogénétique d- Mémoriser les grandes étapes de l’histoire de la vie sur terre

OAV2 : Décrire la structure, le maintien et l’expression du support de l’information génétique a- Décrire les éléments constitutifs des nucléotides et leur organisation en acide nucléique b- Illustrer les différentes étapes de la réplication de l’acide désoxyribonucléique (ADN) c- Décrire la structure d’un gène procaryote et d’un gène eucaryote et les étapes menant à son expression

OAV3 : Identifier les variations de l’information génétique et décrire sa transmission d’une génération à l’autre a- Lister les grandes catégories de mutations et leurs conséquences à l’échelle des molécules et de l’organisme b- Appliquer les lois de génétique mendélienne pour prédire les proportions génotypiques et phénotypiques d’une descendance chez des organismes haploïdes et diploïdes c- Connecter un phénotype mutant avec le résultat d’un crible positif ou négatif

OAV4 : Nommer et classer les grands groupes du vivant à partir de caractères diagnostiques a- Schématiser les composants d’une cellule procaryote et eucaryote ainsi que l’origine des mitochondries et chloroplastes, preuves de l’évolution. b- Identifier des caractères homologues à partir de données morphologiques ou moléculaires c- Citer les grandes catégories de métabolisme énergétique et indiquer les domaines du vivant dans lesquels ils sont observés d- Mémoriser les caractères dérivés partagés des super-groupes eucaryotes e- Mémoriser les arbres simplifiés des Embryophytes, des Eumycètes et des Métazoaires et les caractères dérivés partagés illustrant leur évolution f- Placer les taxons contenant des algues et les espèces observées en TP dans les super-groupes eucaryotes

OAV5 : Analyser les différents cycles de vie en identifiant les grandes étapes et en produire un schéma légendé a- Distinguer méiose et fécondation sur un cycle, en déduire la ploïdie des différentes phases b- Décrire les étapes de la méiose et ses conséquences c- Décrire les étapes de la mitose et la replacer dans le cycle cellulaire d- Décrire les phases sur une courbe de croissance de micro-organisme, et calculer un temps de génération

OAV6 transversal : Réaliser des observations suivant un protocole défini et les communiquer sous la forme d’un compte-rendu a- Définir les objectifs d’un TP et la méthodologie mise en œuvre pour les atteindre b- Traduire ses observations par un graphe, un schéma ou un dessin scientifique légendé, orienté, … c- Évaluer la taille de tout ou partie d’un organisme à partir d’une observation macro ou microscopique et la transcrire par une barre d’échelle d- Interpréter et discuter ces résultats ou observations en s’appuyant sur le cours sur la base d’indications fournies et en tirer des conclusions e- Rédiger un compte-rendu clair et concis en français sur la base d’indications fournies

Programme Classification du monde vivant fondée sur les principes et méthodes de l'analyse phylogénétique. Biodiversité des grands groupes du vivant, description des caractères clé qui les définissent et d'innovations évolutives. Bases de biologie moléculaire et de génétique : structure, expression des gènes ; transmission du matériel génétique : réplication et ségrégation ; notions de polymorphisme et d'adaptation, de clone, de populations expérimentales/naturelles.

Thématiques : Biologie et physiologie animale, Biologie moléculaire | Génétique Génomique, Biologie évolutive | Biologie quantitative | Génétique des populations | Modélisation, Biologie et physiologie végétale

OAV1 : Citer les grands évènements ayant conduit à la formation de la matière dans l’univers et expliquer les différentes hypothèses actuelles ou passées concernant l’émergence de la vie sur terre. - Identifier les grandes caractéristiques de la vie. - Décrire les hypothèses passées et actuelles concernant comment et où la vie sur terre a pu émerger, en citant les arguments en faveur ou en défaveur de ces hypothèses. - Enumérer les différentes étapes de la nucléosynthèse et préciser l’importance des énergies de liaison dans la formation et la stabilité des noyaux, ou des molécules. - Discuter des hypothèses permettant d’expliquer pourquoi la vie sur terre est basée sur le carbone. OAV2 : Caractériser une réaction chimique du point de vue énergétique ou redox, et établir si celle-ci est réalisable dans les conditions données. - Déterminer le nombre d’oxydation d’un atome engagé dans une molécule par la méthode des électronégativités, en déduire si l’atome subit une réduction ou une oxydation. Ecrire une demi équation redox. Identifier le sens de la réaction redox thermodynamiquement favorable grâce à une échelle de potentiel. - Calculer la variation d’énergie au cours d’une réaction en décrivant précisément la méthode. Illustrer les variations d’énergies au cours d’une réaction chimique par un diagramme d’énergie légendé. Déduire si la réaction est thermodynamiquement favorisée ou non. - Définir la notion de catalyse et activation. Identifier si une réaction est cinétiquement favorable. - Identifier et justifier des solutions permettant de rendre favorable une réaction parmi les différentes stratégies décrites. OAV3 : Décrire la structure et les propriétés des briques de la vie et identifier les réactions de synthèse et de polymérisation de ces molécules - Schématiser la formule générale d’un acide aminé, et l’organisation d’un ribonucléotide. - Définir la notion de chiralité. Identifier si une molécule est chirale ou non. Prédire le nombre de stéréoisomères. Expliquer les conséquences de la chiralité dans une réaction chimique ou biochimique. Illustrer la notion de stéréospécificité et la mettre en rapport avec l’homochiralité du monde vivant. - Décrire une liaison peptidique. - Identifier une réaction de polymérisation. - Identifier les réactions de synthèse des sucres, des acides gras et des acides aminés qui auraient pu avoir lieu en conditions prébiotiques. - Identifier si une réaction ou une suite de réaction est autocatalytique ou non. - Expliquer l’importance de l’autocatalyse dans la production de molécules organiques simples (sucres) ou de biopolymères (acides nucléiques) OAV4 : Citer les forces intermoléculaires et leurs conséquences sur le comportement des molécules amphiphiles en lien avec l’assemblage de compartiment. - Énumérer et discuter les différentes forces intermoléculaires intervenant entre un soluté et un solvant. Identifier les parties polaires ou apolaires d’une molécule. - Prédire si un soluté est soluble/miscible dans un solvant donné - Décrire et représenter/schématiser la structure d’une molécule amphiphile et en déduire ses propriétés et son comportement en milieu aqueux, en fonction de sa concentration, et de la présence d’autres molécules amphiphiles. - Définir la concentration micellaire critique (CMC) d’un détergent. OAV5 : Illustrer l’importance du stockage d’information dans l’évolution biologique et dans la multiplication et le bon fonctionnement de protocellules - Démontrer que l’émergence du vivant ayant conduit à la diversité actuelle nécessite le stockage d’une information, mais que cette information, tout en étant reproductible, doit pouvoir évoluer. - Décrire des expériences et discuter les résultats présentés puis en extraire les éléments justifiant une évolution de l’information dans l’émergence du vivant. - Représenter une cellule minimale et décrire son fonctionnement. - Catégoriser des études et des expériences selon l’approche utilisée (reconstructive, simplificatrice), la méthode (expérimentale, théorique, bio-informatique), et la sous-discipline (biologie synthétique, génomique comparative, etc…). Discuter de leur intérêt respectif pour la problématique de l’origine du vivant OAV6 (pratique) : Estimer la capacité de liposomes à encapsuler une molécule, au moyen de la mesure indirecte d’une réaction enzymatique au spectrophotomètre. - Mettre en œuvre un protocole expérimental simple - Nommer le matériel et appareillage mis à disposition. - Décrire le principe et l’objectif des expériences réalisées - Employer correctement du matériel et des équipements de laboratoire en (pipetman, spectrophotomètres…) - Calculer des grandeurs caractéristiques théoriques ou expérimentales, et les comparer - Schématiser les phénomènes observés expérimentalement

Biologie et chimie : Origine de la vie (S1) Cet enseignement bi-disciplinaire (chimie et biologie) s'appuie sur la question de l'origine de la vie pour présenter les lois physiques et chimiques qui régissent la nature, les propriétés et la formation des molécules du vivant, ainsi que les propriétés des systèmes vivants. Le cadre thématique de l’origine de la vie sera pris en exemple et permettra d’illustrer les différentes approches d’une démarche scientifique, et l’importance de l’interdisciplinarite´ dans la résolution d’une question scientifique. Thématiques : Biochimie | Biologie structurale | Métabolisme | Biophysique, Biologie évolutive | Biologie quantitative | Génétique des populations | Modélisation

Biologie 2 : De la molécule à l'organisme (S2)

Il a pour vocation de présenter, à différentes échelles (molécules, cellules, tissus, organes, appareils), l’organisation et le fonctionnement général d’un organisme pluricellulaire animal ou végétal au cours de son cycle de vie (reproduction, développement, croissance)

Thématiques : Biochimie | Biologie structurale | Métabolisme | Biophysique, Biologie et physiologie animale, Biologie cellulaire | Immunologie | Cancérologie | Biologie du développement, Biologie et physiologie végétale

Partie du programme 1 : Principes de base de Biochimie : les constituants moléculaires fondamentaux du vivant

Introduction à la Bioinformatique : ISV10 (S1)

• Objectifs: Le but de cet enseignement est d’introduire les principes rencontrés en bioinformatique et la biologie computationnelle des systèmes.

• Public concerné : Elle concerne tous les étudiants de la licence L1 SDV de l’UEVE (module obligatoire).

• Organisation

Semestre de l’EC proposé : S2 Nombre d’ECTS : 2,5 ISV10 est un enseignement obligatoire Volume horaire : 10,5h de cours, 15h de TD

• Programme : L’apprentissage comprend les cours magistraux et les travaux dirigés. Le module se découpe en 4 thématiques :

• Thème 1 : Des génomes et des protéines
• Thème 2 : Comparaison de séquences 2 à 2
• Thème 3 : Phylogénie et biodiversité
• Thème 4 : Biologie des systèmes et modélisation

• Organisation pédagogique: Pour chaque thématique des TD classiques et des TD en salle informatique sont dispensés.

• Modalités du contrôle de connaissances : Deux sessions de contrôle des connaissances et aptitudes sont organisées dans l’année universitaire : une session initiale et une session de rattrapage.

OAV1 : Identifier les différentes échelles moléculaires correspondant aux concepts de gènes, de protéines, de génome, de chromosome, d’espèce.

OAV2 : Collecter dans les bases de données généralistes les informations concernant les gènes et les protéines. Identifier et reconnaître les différents formats de stockage des séquences (EMBL, Genbank, Fasta). Identifier les bases de données généralistes en biologie moléculaire.

OAV3 : Décrire et formaliser les concepts de base utilisés en analyse de séquence. Décrire une séquence protéique et une séquence nucléique. Définir ce qu’est le pourcentage d’identité et la similarité entre 2 séquences. Interpréter un dot plot. Définir ce qu’est un alignement entre 2 séquences. Calculer le score d’un alignement en fonction d’un système de scores. Comparer les scores d’alignements et les interpréter.

OAV4 : Définir un système en biologie en utilisant les approches du réseau. Introduire les concepts de biologie des systèmes à apprendre à modéliser des concepts biologiques. Décrire et nommer les différents réseaux biologiques. Distinguer les analyses topologiques et dynamiques. Explorer les sources de données d’interactions pour construire et analyser un réseau biologique.

Introduction à la Bioinformatique : ISV10 (S1)  

• Objectifs: Le but de cet enseignement est d’introduire les principes rencontrés en bioinformatique et la biologie computationnelle des systèmes.

• Public concerné : Elle concerne tous les étudiants de la licence L1 SDV de l’UEVE (module obligatoire).

• Organisation

Semestre de l’EC proposé : S2 Nombre d’ECTS : 2,5 ISV10 est un enseignement obligatoire Volume horaire : 10,5h de cours, 15h de TD  

• Programme : L’apprentissage comprend les cours magistraux et les travaux dirigés. Le module se découpe en 4 thématiques :

• Thème 1 : Des génomes et des protéines
• Thème 2 : Comparaison de séquences 2 à 2
• Thème 3 : Phylogénie et biodiversité
• Thème 4 : Biologie des systèmes et modélisation

• Organisation pédagogique: Pour chaque thématique des TD classiques et des TD en salle informatique sont dispensés.

• Modalités du contrôle de connaissances : Deux sessions de contrôle des connaissances et aptitudes sont organisées dans l’année universitaire : une session initiale et une session de rattrapage.

OAV1 : Identifier les différentes échelles moléculaires correspondant aux concepts de gènes, de protéines, de génome, de chromosome, d’espèce.

OAV2 : Collecter dans les bases de données généralistes les informations concernant les gènes et les protéines. Identifier et reconnaître les différents formats de stockage des séquences (EMBL, Genbank, Fasta). Identifier les bases de données généralistes en biologie moléculaire.

OAV3 : Décrire et formaliser les concepts de base utilisés en analyse de séquence. Décrire une séquence protéique et une séquence nucléique. Définir ce qu’est le pourcentage d’identité et la similarité entre 2 séquences. Interpréter un dot plot. Définir ce qu’est un alignement entre 2 séquences. Calculer le score d’un alignement en fonction d’un système de scores. Comparer les scores d’alignements et les interpréter.

OAV4 : Définir un système en biologie en utilisant les approches du réseau. Introduire les concepts de biologie des systèmes à apprendre à modéliser des concepts biologiques. Décrire et nommer les différents réseaux biologiques. Distinguer les analyses topologiques et dynamiques. Explorer les sources de données d’interactions pour construire et analyser un réseau biologique.

Cours magistraux et TD sur ordinateur

Cet enseignement présente les notions fondamentales d'algorithmique (instruction, variable, séquence, branchement conditionnel, boucle), et explique comment choisir, sur des critères objectifs, les structures de données et construire les algorithmes les mieux adaptés à un problème donné. Ces notions sont mises en application à travers un langage de programmation dont les étudiants apprennent la syntaxe et qu'ils apprennent à utiliser via un environnement de développement.

Cours magistraux et TD sur ordinateur

Ce cours présente les principes de base de l'algorithmique et les applique à la programmation en langage C. On y étudie quelques algorithmes numériques, des algorithmes de recherche et de tris de tableau, ainsi que des algorithmes sur les structures chaînées (listes, piles, files, etc.).

Cours magistraux et TD sur ordinateur

Cours magistraux et TD sur ordinateur

Analyse Réelle 1 (L1-S1) Cours 36 h, TD 36 h

Objectifs : Les fondements de l’analyse réelle a` une variable sont mis en place, en particulier les notions de suites et de fonctions. Il ne s’agit pas d’obtenir une technicité´ sur l’utilisation des ”epsilon”, mais plutôt de maitriser les compétences fondamentales de l’analyse réelle : manipulation des inégalités et des encadrements (majorer, minorer, approcher) et calcul de dérivées et primitives.

Contenu de la formation :

• Ensemble des nombres réels : inégalités, majorations et minorations.
• Ensemble des nombres complexes : forme algébrique et forme trigonométrique. Racine n-ie`me d’un nombre complexe. Résolution d’équations a` variable complexe.
• Suites numériques (on admet que toute suite majorée et croissante est convergente). Suites arithmétiques, géométriques, récurrentes linéaires d’ordre 2.
• Fonctions de R dans R : limites, continuité´, dérivabilité´ (théorème des accroissements finis), traces de courbes, croissance comparée.
• Fonctions usuelles : valeur absolue, partie entière, fonctions trigonométriques, logarithme, exponentielle, fonctions hyperboliques.
• Intégration : primitives et intégrales, notion intuitive d’aire délimitée par une courbe, relation de Chasles, linéarité´, positivité´, théorème de la moyenne (ces propriétés peuvent entre admises).
• Calculs d’intégrales : intégration par parties, changements de variables usuels.
• Réduction de fractions rationnelles en éléments simples (les résultats théoriques seront admis).

Compétences a` acquérir :

• Savoir manipuler des égalités et inégalités entre nombres réels.
• Savoir étudiera une suite (monotonie, limite).
• Savoir étudier une fonction de R dans R (limites, continuité, dérivée, monotonie) et connaitre les résultats portant sur les fonctions usuelles.
• Savoir calculer une intégrale par les méthodes usuelles : primitives de fonctions usuelles ; intégration par parties, changements de variables et réduction en éléments simples de fraction rationnelles.

Analyse Réelle 1 (L1-S1) Cours 36 h, TD 36 h

Objectifs : Les fondements de l’analyse réelle a` une variable sont mis en place, en particulier les notions de suites et de fonctions. Il ne s’agit pas d’obtenir une technicité´ sur l’utilisation des ”epsilon”, mais plutôt de maitriser les compétences fondamentales de l’analyse réelle : manipulation des inégalités et des encadrements (majorer, minorer, approcher) et calcul de dérivées et primitives.

Contenu de la formation :

• Ensemble des nombres réels : inégalités, majorations et minorations.
• Ensemble des nombres complexes : forme algébrique et forme trigonométrique. Racine n-ie`me d’un nombre complexe. Résolution d’équations a` variable complexe.
• Suites numériques (on admet que toute suite majorée et croissante est convergente). Suites arithmétiques, géométriques, récurrentes linéaires d’ordre 2.
• Fonctions de R dans R : limites, continuité´, dérivabilité´ (théorème des accroissements finis), traces de courbes, croissance comparée.
• Fonctions usuelles : valeur absolue, partie entière, fonctions trigonométriques, logarithme, exponentielle, fonctions hyperboliques.
• Intégration : primitives et intégrales, notion intuitive d’aire délimitée par une courbe, relation de Chasles, linéarité´, positivité´, théorème de la moyenne (ces propriétés peuvent entre admises).
• Calculs d’intégrales : intégration par parties, changements de variables usuels.
• Réduction de fractions rationnelles en éléments simples (les résultats théoriques seront admis).

Compétences a` acquérir :

• Savoir manipuler des égalités et inégalités entre nombres réels.
• Savoir étudiera une suite (monotonie, limite).
• Savoir étudier une fonction de R dans R (limites, continuité, dérivée, monotonie) et connaitre les résultats portant sur les fonctions usuelles.
• Savoir calculer une intégrale par les méthodes usuelles : primitives de fonctions usuelles ; intégration par parties, changements de variables et réduction en éléments simples de fraction rationnelles.

Algèbre linéaire et géométrie (L1-S2) Cours 36 h, TD 30 h

Objectifs :

• Initiation a` l’algèbre linéaire.
• Acquisition de la méthode du pivot de Gauss.
• Mise en évidence de la structure vectorielle de R^n.
• Ope´rations sur les matrices et problèmes de changement de bases.
• Etude d’applications linéaires, lien avec le calcul matriciel.
• Produit scalaire usuel dans R^n.
• Mise en place du vocabulaire de la géométrie affine et euclidienne dans le plan et l’espace de dimension 3: droites et plans, calcul barycentrique, cercles, sphères.

Algèbre linéaire et géométrie (L1-S2) Cours 36 h, TD 30 h

Objectifs :

• Initiation a` l’algèbre linéaire.
• Acquisition de la méthode du pivot de Gauss.
• Mise en évidence de la structure vectorielle de R^n.
• Ope´rations sur les matrices et problèmes de changement de bases.
• Etude d’applications linéaires, lien avec le calcul matriciel.
• Produit scalaire usuel dans R^n.
• Mise en place du vocabulaire de la géométrie affine et euclidienne dans le plan et l’espace de dimension 3: droites et plans, calcul barycentrique, cercles, sphères.

Contenu de la formation :

• Systèmes linéaires
• Méthode du pivot de Gauss : échelonnement et algorithme du pivot de Gauss-Jordan
• Calcul matriciel : Somme, produit, trace, inversion, rang, transposition, opérations élémentaires
• Déterminants : calcul pratique des déterminants 2x2 et 3x3 (règle de Sarrus). Développement suivant une ligne, une colonne
• Notions d’application, d’injection, surjection et bijection. Introduction des relations d’ordre et d’équivalence. Classes d’équivalence
• Espaces vectoriels de dimension finie : vecteurs, combinaisons linéaires, bases. Sous-espaces vectoriels. Théorème de la base incomplète et applications, supplémentaires
• Applications linéaires de R^n dans R^m. Représentation matricielle. Projecteurs et symétries. Changement de bases
• Produit scalaire usuel dans R^n. Orthogonalité´. Transformations orthogonales (cas de R^2 et R^3)
• Produit vectoriel, vecteur normal. Notions d’aire et de volume algébriques
• Géométrie affine dans R^2 et R^3, droites et plans affines (repères et équations cartésiennes, parallélisme). Applications affines et changement de repères, calcul barycentrique.

Compétences a` acquérir :

• Savoir résoudre de systèmes linéaires avec la méthode du pivot de Gauss, interpréter l’ensemble de solutions pour répondre a` différentes questions d’algèbre linéaire (montrer que des vecteurs sont linéairement indépendants, déterminer les coordonnées d’un vecteur dans un base, inverser une matrice carrée, déterminer une base du noyau d’un endomorphisme).
• Pratique du calcul matriciel, utilisation pour l’étude des applications linéaires.
• Savoir passer d’une famille de vecteurs qui engendrent un sous-espace de Rn a` un système d’équations de ce sous-espace et réciproquement (prolongement du passage d’une représentation paramétrique a` des équations cartésiennes d’un plan ou d’une droite dans l’espace et réciproquement).
• Utilisation du produit scalaire usuel pour résoudre des questions de géométrie.

Reconnaître des procédés argumentatifs récurrents, contribuant à la diffusion en sociétés de thèses non recevables au regard des connaissances établies.

Connaître certains outils, procédés et démarches permettant de caractériser scientifiquement des différences et identifier les interférences possibles entre l’élaboration des tels savoirs scientifiques et des constructions sociales.

Identifier les conditions auxquelles une observation scientifique est jugée crédible par la communauté scientifique

A propos d’une controverse socioscientifique, repérer et dissocier différents registres de discours concurrents (par exemple économique, éthique, scientifique)

Dépasser le registre binaire (V vs F) pour appréhender la complexité des controverses socioscientifiques

Le SPOC Sens critique/ sicences en sociétés est un enseignement en ligne destiné à sensibiliser les étudiants aux enjeux des interactions sciences et sociétés en développant leur sens critique. Il est constitué de cinq séances d'exercices ludiques portant sur des ressources audio, video et textuelles. Chaque séance est rattachée d'une part à un thème envisageant un champ spécifique de connaissances scientifiques, d'autre part à un questionnement interrogeant un aspect spécifique des interactions sciences/sociétés. Séance 1 : La terre plate : Quels procédés argumentatifs peuvent contribuer à faire accepter en société des thèses irrecevables eu égard aux connaissances établies ? Séance 2 : Le dimorphisme sexuel du cerveau : Quelle part les savoirs scientifiques peuvent-ils prendre dans les constructions sociales ? Réciproquement, quelle part les constructions sociales peuvent-elles prendre dans l’élaboration des savoirs ? Séance 3 : Les ondes gravitationnelles : A quelles conditions des observations scientifiques sont-elles considérées comme fiables par les communautés de chercheurs ? Séance 4 : Le transhumanisme : A quel imaginaire, à quelle économie, et à quelles pratiques scientifiques institutionnelles le transhumanisme est-il relié ? Séance 5 : Le transhumanisme : Que peuvent modifier sur le plan social, politique, juridique et anthropologique, les évolutions technoscientifiques ?

Enseignement en ligne, suivi sur ecampus, évaluation en ligne, forum, démarrage en janvier 2021. 5 séances, chacune en ligne 2 semaines.

La formation aux compétences numériques a pour objectif de préparer les étudiants à la certification informatique PIX afin qu’ils puissent démontrer leur savoir-faire dans la majorité des 16 compétences du référentiel national. L’apprentissage, réalisé en salle informatique, s’effectue essentiellement à partir de la résolution de cas pratiques après l'introduction des notions théoriques. Le plan du module est le suivant: A/ Communiquer B/ Environnement numérique C/ Protection et sécurité D/ Création de contenu E/ Informations et données

TD sur ordinateur

Comprendre les mécanismes de transfert et de décodage de l'information héréditaire contenu dans les acides nucléiques vers des structures tridimensionnelles complexes, et en particulier les protéines.

Le but est d’acquérir les connaissances de base de Biologie Cellulaire et Moléculaire. Les enseignements dispensés ont pour but d’étudier les méthodes de base d’analyse et d’observation des cellules et les différents types de cellules (eucaryotes et procaryotes), de faire des rappels sur les structure et fonction des macromolécules biologiques et de décrire les différents compartiments cellulaires. Dans cette UE sont en particulier décris la matrice extra-cellulaire, la composition, la structure et les propriétés des membranes biologiques, les types de transports membranaires, l’organisation du réseau endomembranaire (RE, Golgi, Lysosomes), les mécanismes de sécrétion et d’endocytose, les mitochondries et le métabolisme énergétique, la structure et la fonction du noyau et le cycle cellulaire.

- Principes de bases de l’évolution et de la systématique - Systématique et classification du vivant (3 domaines du Vivant : Bactéries / Archées / Eucaryotes – détails sur certains groupes d’Eucaryotes – phylogénie des Métazoaires – phylogénie des Archaeplastida) - Processus de diversification (spéciation et extinction) - Biogéographie   - Origine de la Vie

Il s’agit de fournir aux étudiants une initiation à la programmation (1) : structures de données et algorithmes de base.

• Introduction
• Opérateurs et conditionnelles
• Boucles
• Tableaux
• Procédures
• Fonctions
• Jeu
• Les tris

Structures de données et algorithmes de base.

Initiation à la programmation (2) : Bibliothèques (usage), SDD (tableau, liste, tuple), Fonctions (définition), Classes et méthodes (définition pour des cas simples), Entrées/sorties (fichier). Outils : Git, chaînes documentaires, convention de codage, shell(fichiers & répertoires).

Présentation de différentes applications de l’informatique par la programmation (programmation web, … ). Codage de l’information, algorithmique du texte, automates cellulaires, robotique

• Équations différentielles

  Primitives Équations différentielles linéaires du premier ordre Exemples d'équations différentielles du premier ordre non-linéaires Équations différentielles linéaires du second ordre à coefficients constants

• Études de suites

  Propriétés sur les limites Suites arithmético-géométriques Raisonnement par récurrence Suites définies par récurrence, convergence vers un point fixe

• Matrices

  Systèmes linéaires Matrices : définition, somme, produit… Inverse d'une matrice Déterminant Diagonalisation pour une matrice carrée de taille 2 ou 3 : polynôme caractéristique, valeurs propres, vecteurs propres Applications : études de suites, systèmes différentiels

Présentation et consolidation des notions essentielles en physique. La démarche pédagogique vise à reprendre des notions de physique abordées au cours du lycée (filière scientifique) sur la mécanique du point et l'optique géométrique, de les approfondir en y ajoutant une formulation mathématique des problèmes.   Partie optique géométrique

• Utiliser les définitions et les propriétés de centre optique, des foyers principaux, de la distance focale, de la vergence.

• Construire l’image (réelle ou virtuelle) d’un objet (réel ou virtuel) situé à une distance finie ou infinie à l’aide de rayons lumineux

• Exploiter les formules de conjugaison et de grandissement transversal pour une ou plusieurs lentilles, accolées ou non.

• Modéliser l’œil comme l’association d’une lentille de vergence variable et d’un capteur.

• Savoir restituer et utiliser les lois de Snell-Descartes (réflexion/réfraction) pour différentes interfaces.

Partie mécanique du point

• Déterminer la vitesse et l'accélération d'un point connaissant sa position, et calculer sa position à partir d'une accélération

• Etablir un bilan des forces sur un système et en rendre compte sur un schéma

• Savoir appliquer le principe fondamental de la dynamique, déterminer les équations du mouvement d'un point matériel et résoudre les problèmes en 1D ou 2D en coordonnées cartésiennes

• Reconnaître le caractère moteur ou résistant d'une force.

• Établir et connaître les expressions des énergies potentielles de pesanteur (champ uniforme), énergie potentielle élastique, énergie électrostatique (champ uniforme et champ créé par une charge ponctuelle)

• Connaitre et appliquer le Théorème Energie Cinétique

• Déduire d’un graphe d’énergie potentielle le comportement qualitatif : trajectoire bornée ou non, mouvement périodique, positions de vitesse nulle.

optique géométrique Formation des images / lentilles sphériques Association de lentilles Optique instrumentale Lois de Descartes - dioptre plan Dioptre et lentille sphériques Mécanique du point Description et paramétrage du mouvement d'un point en 1D et 2D (cartésien) - cinématique Lois de Newton et Bilan des forces dans un référentiel galiléen Travail, énergie et puissance Oscillateur harmonique

• Compréhension écrite et orale de l’anglais scientifique

Communication orale et écrite en anglais

Apprentissage de la méthodologie de travail scientifique appliquée à la Biologie et l'Informatique

Projet Personnel d'Etudes et d'Insertion

Acquérir les connaissances de bases sur la description atomique, les nombres quantiques, la classification et les propriétés des atomes.   Acquérir les connaissances de bases sur les molécules , les différents types de liaison, la géométrie des molécules et les diagrammes d’OM

Présentation et consolidation des notions essentielles de chimie. La démarche pédagogique vise une progression de l’atome à la molécule par l’étude des propriétés de l’atome, du tableau périodique, des divers modes de liaisons et la formation de molécules.

Cet enseignement a pour objectif de poser les bases structurales de la chimie (liaisons chimques, géométrie des molécules, cohésion de la matière) pour être ensuite capable d'appréhender les réactivités de composés chimiques dans les différents domaines de la chimie (réactions acide-base, d'oxydo-réduction, nucléophilie-électrophilie, substitutions nucléophiles, éliminations, etc ...)

Eléments de base de l’analyse et de l’algèbre linéaire: formules de Taylor, intégrale, séries, espaces vectoriels et applications linéaires

Démarche scientifique - Projet