Metagenopolis (MGP)

Présentation du laboratoire

Le centre MetaGenoPolis (MGP) étudie l'impact de l'alimentation sur le microbiote intestinal (humain et animal), et l'impact de ce dernier sur la santé et la maladie. Il met à disposition de la communauté médicale, de la recherche et de l'industrie les dernières avancées sur la connaissance de ce microbiote grâce à sa grande expertise en métagénomique quantitative et fonctionnelle. MGP a développé de nombreuses autres expertises notamment dans la standardisation des procedures certifiée par un label ISO9001. Cette approche intégrée est construite sur les connaissances établies par le projet Européen MetaHIT, publiées notamment dans le journal Nature (establishment of a broad gene catalogue of the human intestinal metagenome et discovery of the three human enterotypes), ainsi que la caractérisation du microbiote intestinal pour deux maladies chroniques (obésité et maladie inflammatoire des intestins) et les premiers criblages haut-débit de banques métagénomiques en vue d'une analyse fonctionnelle. Les principaux domaines de recherche de MetaGenoPolis sont la nutrition et le domaine médical. Actuellement, MGP travaille sur 16 projets : 12 projets industriels et 4 projets européens.

Les 20 dernières publications

Titre Auteurs Date de publication Source
In vitro modelling of oral microbial invasion in the human colon Victoria Meslier, Aymeric David, Sarah Jegou, Christian Morabito, Benoit Quinquis, Florence Thirion, Florian Plaza Oñate, Emmanuelle Le Chatelier, Stanislav D. Ehrlich, Mathieu Almeida 01/03/2023 Microbiology spectrum
Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies Joël Doré 26/01/2023 Nature
Both Disease Activity and HLA–B27 Status Are Associated With Gut Microbiome Dysbiosis in Spondyloarthritis Patients Maxime Breban 01/01/2023 Arthritis and Rheumatology
Oral and periodontal assessment at the first trimester of pregnancy: The PERISCOPE longitudinal study Camille Champion 01/01/2023 Acta Obstetricia et Gynecologica Scandinavica
Single-Donor and Pooling Strategies for Fecal Microbiota Transfer Product Preparation in Ulcerative Colitis: Systematic Review and Meta-Analysis Joël Doré 01/01/2023 Clinical and Translational Gastroenterology
Benchmarking second and third-generation sequencing platforms for microbial metagenomics Victoria Meslier, Benoit Quinquis, Kévin Da Silva, Florian Plaza Oñate, Nicolas Pons, Hugo Roume, Mathieu Almeida 01/12/2022 Scientific data
Adaptation of the gut pathobiont Enterococcus faecalis to deoxycholate and taurocholate bile acids Benoit Quinquis 01/12/2022 Scientific Reports
Long-term diosmectite use does not alter the gut microbiota in adults with chronic diarrhea Kévin Da Silva, Susie Guilly, Florence Thirion, Emmanuelle Le Chatelier, Nicolas Pons, Hugo Roume, Benoit Quinquis, Stanislav D. Ehrlich, Joël Doré 01/12/2022 BMC Microbiology
Roseburia, a decreased bacterial taxon in the gut microbiota of patients suffering from anorexia nervosa Joël Doré, Hervé M. Blottière 01/10/2022 European Journal of Clinical Nutrition
Neonatal Programming of Microbiota Composition: A Plausible Idea That Is Not Supported by the Evidence Hervé M. Blottière 17/06/2022 Frontiers in Microbiology
Diet Supplementation with NUTRIOSE, a Resistant Dextrin, Increases the Abundance of Parabacteroides distasonis in the Human Gut Florence Thirion, Kévin Da Silva, Florian Plaza Oñate, Anne Sophie Alvarez, Nicolas Pons, Magali Berland, Emmanuelle Le Chatelier, Nathalie Galleron, Florence Levenez, Joël Doré, Stanislav D. Ehrlich 01/06/2022 Molecular Nutrition and Food Research
A Natural Polyphenol Exerts Antitumor Activity and Circumvents Anti–PD-1 Resistance through Effects on the Gut Microbiota Florian Plaza Oñate, Oscar Gitton-Quent, Emmanuelle Le Chatelier 01/04/2022 Cancer Discovery
Modern Metaproteomics: A Unique Tool to Characterize the Active Microbiome in Health and Diseases, and Pave the Road towards New Biomarkers—Example of Crohn’s Disease and Ulcerative Colitis Flare-Ups Ariane Bassignani, Magali Berland 01/04/2022 Cells
Rifaximin-α reduces gut-derived inflammation and mucin degradation in cirrhosis and encephalopathy: RIFSYS randomised controlled trial Kévin Da Silva, Susie Guilly, Nicolas Pons, Nathalie Galleron, Emmanuelle Le Chatelier, Stanislav D. Ehrlich 01/02/2022 Journal of Hepatology
Intestinal Akkermansia muciniphila predicts clinical response to PD-1 blockade in patients with advanced non-small-cell lung cancer Laurie Alla, Nicolas Pons, Emmanuelle Le Chatelier, Nathalie Galleron, Hugo Roume 01/02/2022 Nature Medicine
Microbiome and metabolome features of the cardiometabolic disease spectrum Sebastien Fromentin, Pilar Galan, Nathalie Galleron, Emmanuelle Le Chatelier, Hanna Julienne, Nicolas Pons, Benoit Quinquis, Hugo Roume, Stanislav D. Ehrlich 01/02/2022 Nature Medicine
Increasing the diversity of dietary fibers in a daily-consumed bread modifies gut microbiota and metabolic profile in subjects at cardiometabolic risk Florence Thirion, Susie Guilly, Hugo Roume, Nathalie Galleron, Nicolas Pons, Emmanuelle Le Chatelier, Joël Doré 01/01/2022 Gut Microbes
Impairment of gut microbial biotin metabolism and host biotin status in severe obesity: Effect of biotin and prebiotic supplementation on improved metabolism Nathalie Galleron, Emmanuelle Le Chatelier, Nicolas Pons, Benoit Quinquis, Hugo Roume, Stanislav D. Ehrlich 01/01/2022 Gut
Changes in Gut Microbiota of Patients with Atopic Dermatitis During Balneotherapy Florence Thirion, Susie Guilly, Sebastien Fromentin, Florian Plaza Oñate, Anne Sophie Alvarez, Emmanuelle Le Chatelier, Nicolas Pons, Florence Levenez, Benoit Quinquis, Stanislav D. Ehrlich, Joel Doré 01/01/2022 Clinical, Cosmetic and Investigational Dermatology
Synergistic effects of Lacticaseibacillus rhamnosus GG, glutamine, and curcumin on chronic unpredictable mild stress-induced depression in a mouse model Joël Doré 01/01/2022 Beneficial microbes

Nombre de publications du laboratoire par domaine scientifique (2016-2021)

Chaque publication du laboratoire peut être rangée dans une ou plusieurs disciplines scientifiques : la figure ci-dessus présente le nombre de publications du laboratoire pour chaque discipline de la classification ASJC (Elsevier)