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M1 Biologie-Santé - Plateforme Microbiologie -Site Orsay

Candidater à la formation
  • Capacité d'accueil
    15
  • Langue(s) d'enseignement
    Anglais
    Français
Présentation
Objectifs pédagogiques de la formation

La plateforme Microbiologie du master Biologie Santé offre de nombreuses unités d’enseignement qui couvrent des aspects variés de la microbiologie autant fondamentale qu’appliquée. La plateforme propose des unités d’enseignements (UE) théoriques apportant une vision intégrée du monde microbien relative aux aspects biodiversité, évolution, caractéristiques génétiques, physiologiques et métaboliques des microorganismes ainsi que des interactions entre ceux-ci. D’autres UE dédiées plus spécifiquement à la bactériologie, virologie, ou parasitologie permettent de traiter des aspects liés aux pathogènes microbiens (phytopathogènes, thérapeutiques anti-infectieuses, réponse immunitaire) ou encore de s’initier à l’étude des microorganismes d’intérêt industriel (biotechnologie microbienne). La plateforme offre également un éventail d’UE pratiques permettant aux étudiants de travailler sur des questions microbiologiques à l’aide de techniques variées (microbiologie, biochimie, biologie moléculaire, RNA interférence, génie génétique) sur différents modèles d’étude (bactéries, levure, protistes, virus). Les étudiants qui s’intéressent à la microbiologie industrielle ont accès à une UE expérimentale de bio-ingénierie.

Lieu(x) d'enseignement
ORSAY
Pré-requis, profil d’entrée permettant d'intégrer la formation
Etre titulaire du Diplôme national de Licence en Sciences de la vie, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Posséder des bases solides dans les fondamentaux de la biologie: Biologie moléculaire, biologie cellulaire, biochimie, génétique. Avoir validé des UE de L2/L3 en adéquation avec les thématiques de la plateforme. Pour les étudiants internationaux francophones: Etre titulaire d'un diplôme équivalent à la licence de Sciences de la vie, garantissant les mêmes pré-requis, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Si votre formation inititale est très spécialisée, il est conseillé de postuler d'abord pour un L3 en Licence Sciences de la vie (Diplôme national). For English-speaking international students: You may apply on the International track if you graduated with a Bachelor degree, major in Biology, or if you will graduate before Sept 1st of the academic year for which you apply.
Profil de sortie des étudiants ayant suivi la formation

Lorsqu’elle est prise comme plateforme principale, la plateforme de microbiologie permet aux étudiants l’accès aux 4 parcours de M2 de microbiologie du master BS :
- Agents infectieux - interaction avec leurs hôtes et l'environnement (A2I) UVSQ
- Microbiologie & génie biologique (MGB) UPsud - Orsay
- Microbiologie - microbiote, agents pathogènes et thérapeutiques anti infectieuses (MBVP) UPsud – Chatenay
- M2 Microbiologie Fondamentale (MF)
Mais aussi :
- M2 Génétique, Génome et Evolution (GGE)
- M2 Sciences du Végétal (SV)
- M2 Systems and Synthetic Biology (SSB)
- Formation à l’enseignement supérieur (FESup): Agrégation SV-STU
- Formation à l’enseignement supérieur (FESup): Agrégation Biochimie et Génie Biologique (BGB)

Débouchés de la formation

Les secteurs d’activité couverts par la microbiologie sont : Santé - pharmacie, Cosmétique, Alimentation – Restauration collective - Grande distribution, Microbiologie de l’environnement, Microbiologie marine, Biotechnologie industrielle (production de molécules) et secteur agroalimentaire ainsi que la recherche en microbiologie.

Avec un master de microbiologie (Bac +5) le niveau de qualification est :
- Ingénieur d’études, de production ou de contrôle,
- Chargé de projet ou de validation de méthodes,
- Responsable Contrôle & Diagnostic microbiologique,
- Responsable Qualité,
- Responsable Qualité Hygiène Sécurité Environnement.

Programme

Toutes les UE du M1 Biologie-Santé sont regroupées dans des ensembles thématiques appelés “plateformes”.
Un parcours de M1 est constitué obligatoirement d’unités d’enseignement (UE) choisies dans au moins 2 plateformes.
Vous pouvez consulter le programme de chaque UE en cliquant sur les plateformes plus bas sur cette page.

Bloc Majeure
Lors de votre candidature au M1, vous devez choisir une plateforme “Majeure”.
Cette plateforme majeure donne la coloration principale de votre parcours en M1. Elle doit contenir 20 à 30 ECTS hors compétences linguistiques. Elle détermine les M2 qui vous seront accessibles après le M1.
Les UE de la plateforme Majeure ainsi que le stage en laboratoire (optionnel) sont regroupées dans le “bloc Majeure”. Au sein du bloc Majeure, toutes les UE sont optionnelles, et se compensent* entre elles, à l’exception de l’UE Stage.

Bloc Socle
Tous les étudiants du M1 Biologie-Santé suivent un tronc commun scientifique et méthodologique durant la première moitié du premier semestre. Les UE du tronc commun sont regroupées dans le bloc Socle scientifique et méthodologique.
Vous devez obligatoirement choisir une UE d’anglais au premier semestre pour 2.5 ECTS ("Anglais S1" pour UEVE et UVSQ, "English for sciences" pour Orsay) dans la plateforme Interfaces de la Biologie. Cette UE est comptabilisée dans le bloc Socle.
Toutes les UE du bloc Socle sont obligatoires et se compensent* entre elles.

Bloc Mineure
Entre 15 et 25 ECTS doivent être acquis par une combinaison d’UE d’ouverture choisies toutes hors de la plateforme majeure. Si vous choisissez 25 ECTS en UE d’ouverture, ces UE doivent se répartir sur au moins 2 plateformes différentes de la plateforme majeure.
L’ensemble de ces UE constitue le “Bloc Mineure”.
Au sein du bloc Mineure, toutes les UE sont optionnelles, et se compensent* entre elles.

*Le seuil de compensation est à 7/10 pour toutes les UE à l’exception du stage dont le seuil est à 10.

Les compétences linguistiques peuvent être acquises suivant plusieurs modalités en fonction du site/établissement. Il peut s’agir d’une UE d’apprentissage ou de perfectionnement en anglais (« UE de langue »), ou bien d’une UE dispensée en anglais pour pratiquer la langue dans le contexte scientifique (« UE scientifique en anglais »). Le total maximum d'ECTS de la plateforme majeure peut aller jusqu'à 35 si des UE validant les compétences linguistiques sont choisies. Un étudiant peut suivre plusieurs UE en anglais, ou combiner une UE de Langue avec une UE scientifique en anglais.
Les compétences expérimentales peuvent être acquises soit sous forme d’une combinaison d’UE de TP ou d’ateliers en laboratoire (pour un minimum de 10 ECTS), soit sous forme d’un stage de recherche en laboratoire ou en entreprise (10 ECTS), stage généralement associé à une UE Projet scientifique (2,5 ECTS) ou Scientific project (2.5 ECTS) si l’UE valide également la compétence linguistique.

Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Analyse structurale des biomolécules 2.5 16 9
Architecture et fonction des macromolécules 5 32 16
Bioinformatique structurale 5 70
Catalyse enzymatique, mécanismes moléculaires 2.5 16 9
Enzymologie 5 50
La biologie à l'échelle de la molécule unique et de la cellule unique 2.5 16 9
Méthodes d'analyse structurale 5 32 16
Outils biotechnologiques - Protéines 2.5 25 12
Polymères pour la biologie et applications 2.5 16 9
Préparation, purification et caractérisation des protéines recombinantes 2.5 5 20
Protéines membranaires : biochimie et biologie moléculaire 5 70
Protéines recombinantes 5 70 0
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Anglais S1 5 ECTS 5
Anglais S2 2,5 ECTS 2.5 25
Bioinformatique pour la génomique 2.5 10 15
Biostatistiques (Orsay) 5 12 12 26 0 0 0 0 0 0
Biostatistiques (Versailles) 2.5 25
CAPSULE (CAp SUr L'Entreprise) 2.5 25
Cellular economics 4 15 10
Current Questions in Evolution 5 50
Ecologie fonctionnelle 5
Fonctionnement de l'entreprise innovante 5 20 20
Formation expérimentation animale, niveau 2 2.5
Interactions plantes - microorganismes, de la cellule à l'environnement 5 26.5 9.5 9 10
Introduction à l'imagerie médicale 5 50
Introduction aux méthodes d'imagerie 5 26 12 12
Les Mastériales.fr 2.5 2 30
Masteriales 2.5 2 30
Méthodologies d'analyse de séquences 2.5 12 12
Nanosciences pour la biologie 2.5 16 9
Outils Biotechnologiques - Analyse de données multi-omiques 2.5 7 18
Physiologie intégrative végétale 5 20 5 20 5
Planification d'expériences 2.5 6 6 12
Programmation pour la bioinformatique 2.5 10 15
Synthetic Biology 2.5 16 9
Systems Biology I 2.5 16 9
Systems Biology II 2.5 16 9
TP de biologie végétale 5 0 8 42 0 0 0 0 0 10
UE LIBRE 5
Workshop on plant responses to biotic and abiotic stresses 5 8 42 10
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Animal transgenesis 2.5 16 9
Anti-cancereux et mort cellulaire 2.5 2 20
Apoptose et signalisation 5 2 48
Base de la différenciation cellulaire et de l'oncogénèse 2.5 14 10 0 0 0 0 0 0
Biologie cellulaire du cytosquelette 5 27 8 15
Biologie moléculaire chez la levure 5 70
Boîtes à outils moléculaires et cellulaires 5 9 25 7
Cancérologie fondamentale et clinique 5 36 14
Contrôle de l'expression génique 5 12 11 20
Development in questions 5 24 26
Développement en questions 5
Devenir cellulaire normal et pathologique (cursus santé Versailles Saint-Quentin uniquement) 2.5 10 15
Dynamique des génomes 2.5 20 5
Dynamique membranaire et signalisation 5 14 6 28 2
Epigenetics 2.5 15 10
Etats pathologiques de la cellule 2.5 16 4
Functional genomics and precision medicine 2.5 16 9
Génétique et génomique des populations 2.5 25 8
Génétique humaine 5 36 0 0 0 0 0 0 0
Génétique humaine et stabilité des génomes 5 26 24 0 0 0 0 0 0 0
Génétique moléculaire et cellulaire du développement et de la différenciation 5 30 20
Génomique et pathologies 2.5 12 7 6
Génomique fonctionnelle et médecine de précision 2.5 16 9
Introduction aux Biothérapies 2.5 8 5 12
Introduction to biotherapies 2.5 8 5 12
Introduction to human genetics 2.5 12 13
Lipids and membranes in patho-physiology 2.5 15 10
Oncogenèse, signalisation, Cellules souches 5 14 14 22
Outils Biotechnologiques - Génomique fonctionnelle 2.5 25
Physiopathologie de la signalisation 5 33 17 0 0 0 0 0 0 0
Points de contrôle du cycle cellulaire et réparation de l'ADN 5
Régulation de l'expression génique 2.5 16 9
Signalisation et communication cellulaire 2.5 16 9
Trafic intracellulaire 2.5 14 11
Virologie fondamentale (VFO) 5 35 8
Voies de transduction du signal 5 50
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Approfondissement en immunologie : du fondamental à l'appliqué 2.5 16 10.5
Atelier organismes modèles (S1) 5 4 46
Atelier organismes modèles (S2) 5
Biologie cellulaire des interactions hôte-bactéries invasives 5 24 7 15 3
Biologie de la reproduction 5
Biologie du comportement animal 5 43 7
Biologie moléculaire et cellulaire appliquées à des modèles viraux 5 5 4 46
Biosignaling 5 24 16 10
Biotechnologies applications exemples 5 5 15 70
Communautés microbiennes 2.5 15 10
Endocrinologie moléculaire et cellulaire 5 42 8
Evolution et biodiversité des microorganismes 5 42 8
Formation pratique en immunologie 5 15 8 29 3
Génétique des pathologies complexes : outils méthodologiques 2.5 16 9
Génétique des pathologies complexes : pratiques expérimentales 2.5 25
Génétique et physiologie bactériennes 5 24 18
Immunologie approfondie et immunotechnologies 2.5 16 9
Immunologie moléculaire et cellulaire 5 35 15
Immunopathologie Clinique et Immunothérapie 5
Immuno-pathophysiology 2.5 16 9
Immunophysiopathologie 2.5 16 9
Initiation à la biologie vasculaire 2.5 22 3
Initiation aux neurosciences 5 30 10
Integrative microbiology 2.5 10 10 9 9
La paramécie, nouveau modèle d'étude des ciliopathies humaines par ARN interférence 5 10 40
Les bases de l'immunologie 5 25 25
Longévité et vieillissement 5 25 25
Mécanismes de la différenciation et de la prolifération cellulaire, oncogenèse et stratégies anti-tumorales 5 40 0 0 0 0 0 0 0
Microbiologie appliquée 5 30 3
Microbiologie industrielle et alimentaire 5 50
Microbiologie médicale : thérapeutiques anti-infectieuses et biotechnologies 5 14 12 12 10
Neurobiologie cellulaire et moléculaire 2.5 18 7
Neurobiology of Integrated Systems 5 40 10
Neuropharmacologie approfondie 2.5 18 7
Neurophysiopathologies 5 40 20
Nutrition et prévention des grandes pathologies 2.5 23
Nutrition et sécurité sanitaire 2.5 20 5 0 0
Parasitologie (études des interactions durables) 2.5 5 20
Phylogénie et diversité du métabolisme microbien 2.5 25 9
Physiologie des interactions hôtes pathogènes (approches expérimentales) 5 10 5 30
Physiologie des régulations 5 33 15 0 0 0 0 0 0 0
Physiologie du système immunitaire 2.5 16 9
Physiologie et biologie intégrées du système cardio-respiratoire 5 35
Physiopathologie de la reproduction et du déterminisme du sexe 5 24 13.5 7.5
Physiopathologie endocrinienne 2.5 21 4
Réponse immunitaire et stratégie défensive 5 35 15
Technologie des neurosciences 5 10 40
Toxicologie-pharmacologie 2.5 24 2 0
Transgénèse animale 2.5 16 9 0 0 0 0 0 0 0
Virologie fondamentale (VFV) 5 35 8
Virologie moléculaire 2.5 16 9
Virus et génie génétique 5 20 10 25
Workshop on model organisms 5 4 48
Workshop on model organisms (AOM) 2.5 2 23
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Anglais S1 2,5 ECTS 2.5 25
Core courses : Genes, proteins and cells 10 56.5 28.5 25 15
Core courses : Transdisciplinary project 2.5
Formation préparatoire au tronc commun du master BS (FACULTATIVE) 0
Socle scientifique et méthodologique - Fondamentaux 10 53 57 15
Socle scientifique et méthodologique - Projet Transdisciplinaire 2.5
Matières ECTS Cours TD TP Cours-TD Cours-TP TD-TP A distance Projet Tutorat
Internship 10 4 60
Projet scientifique 5 4 450
Scientific project 5 4 60
Stage 10 4 450
Stage expérimental (cursus Santé KB) 2.5 2 4
Stage expérimental (cursus Santé UVSQ) 5 2 2
Stage facultatif 0
Modalités de candidatures
Période(s) de candidatures
Du 15/03/2022 au 04/06/2022
Pièces justificatives obligatoires
Pièces justificatives complémentaires
Contact(s)
Responsable(s) de la formation
Secrétariat pédagogique