M1 Biologie-Santé - Plateforme Biochimie et biotechnologies-Site Orsay

Candidater à la formation
  • Capacité d'accueil
    10
  • Langue(s) d'enseignement
    Français, Anglais
  • Établissement référent
    Université Paris-Saclay
Année dans le diplôme
Master 1
Objectifs pédagogiques de la formation

La Plateforme Biochimie et Biotechnologies a pour objectifs de:
1) Former les étudiants aux méthodes d'analyse biochimique et structurale des macromolécules biologiques. Développer leurs capacités d’analyse des processus biologiques sous un angle moléculaire.
2) Introduire les outils biotechnologiques et nano technologiques
3) Initier les étudiants aux techniques de la biologie in silico pour l’analyse des données structurales, génomiques et protéomiques
4) Une priorité est donnée à l’apprentissage pratique sous forme de TPs et de TDs participatifs.
5) Apprendre à concevoir et réaliser des procédures expérimentales puis à en traiter et à en analyser les résultats

Lieu(x) d'enseignement
ORSAY
Pré-requis, profil d’entrée permettant d'intégrer la formation
Etre titulaire du Diplôme national de Licence en Sciences de la vie, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Posséder des bases solides dans les fondamentaux de la biologie: Biologie moléculaire, biologie cellulaire, biochimie, génétique. Avoir validé des UE de L2/L3 en adéquation avec les thématiques de la plateforme. Pour les étudiants internationaux francophones: Etre titulaire d'un diplôme équivalent à la licence de Sciences de la vie, garantissant les mêmes pré-requis, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Si votre formation inititale est très spécialisée, il est conseillé de postuler d'abord pour un L3 en Licence Sciences de la vie (Diplôme national). For English-speaking international students: You may apply on the International track if you graduated with a Bachelor degree, major in Biology, or if you will graduate before Sept 1st of the academic year for which you apply.
Profil de sortie des étudiants ayant suivi la formation

Lorsqu’elle est prise comme plateforme majeure, la plateforme Biochimie et biotechnologies prépare l'étudiant à intégrer:
- M2 Ingénierie et Chimie des Biomolécules (ICBM)
- M2 Systems and Synthetic Biology (SSB)
- Formation à l’enseignement supérieur (FESup): Agrégation SV-STU
- Formation à l’enseignement supérieur (FESup): Agrégation Biochimie et Génie Biologique (BGB)

Débouchés de la formation

Former des étudiants à la fonction de chercheur ou d’ingénieurs de recherche dans les organismes publics et privés (grands groupes et start-ups), pour tout projet reposant sur une compréhension moléculaire et une utilisation des systèmes vivants.

Permettre aux étudiants d'acquérir le langage, la culture scientifique, et un niveau de réflexion requis pour conduire et intervenir dans des projets pluridisciplinaires et innovants incluant une dimension de biologie moléculaire et biochimie

Laboratoire(s) partenaire(s) de la formation

" I-Stem, INSERM- UEVE UMR 861
Apports de l’imagerie à l’étude de la dynamique des microtubules - Châtenay Malabry, UPRES EA4530
Biomarqueurs en Cancérologie et Onco-Hématologie (BCOH) EA4340 UVSQ
Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR 1181 B2PHI
Cellules souches et radiations - Fontenay-aux-Roses, INSERM UMR 967 -
Centre de recherche en Immunologie des Infections virales et des maladies auto-immunes - Faculté de médecine Paris Sud - Bicêtre, INSERM UMR 1184
Différenciation des cellules lymphoïdes et hémopathies malignes, UMR_S 1126
Epigénétique et cancer - Gif sur Yvette, INSERM CNRS - FRE3377 CNRS/CEA -
Gamète, Implantation, Grossesse, EA 7404
Genethon -1 bis, rue de l'internationale-BP 60-91002 Evry cedex

Genoscope, CEA/DSV/IG
Handicap neuromusculaire, UMR 1179
Hémostase Inflammation Thrombose - Bicêtre, INSERM UMR-S 1176
Hypertension artérielle pulmonaire, physiopathologie et innovation thérapeutique - Clamart, INSERM UMR 999
Identification de nouvelles cibles thérapeutiques en cancérologie - Villejuif, INSERM UMR 981 -
Imagerie Moléculaire In Vivo (IMIV) UMR1023 Inserm/CEA/Université Paris Sud et ERL 9218 CNRS
Imagerie par Résonance Magnétique Médicale et Multi-Modalités (IR4M), UMR8081
Infection et Inflammation, INSERM UMR 1173, UVSQ
Infectious Disease Models and Innovative Therapies (IDMIT)
Inflammation, chimiokines et immunopathologie - Hôpital A. Béclère - Clamart, INSERM UMR-S 996
Institut Curie - Centre de recherche Université Paris-sud
Institut de Biochimie et Biophysique Moléculaire et Cellulaire - Orsay, INSERM UMR 8619
Institut de Biologie François Jacob - MIRCen, Fontenay aux Roses
Institut de Biologie Intégrative de la cellule, Gif-sur-Yvette
Institut de Biologie Systémique et Synthétique -Genopole Campus 1,
Institut des Neurosciences Paris Saclay - Gif-sur-Yvette, CNRS UMR 9197
Institut des Neurosciences Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette & Orsay
Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 - Institute Plant Sciences Paris Saclay
Institut des sciences du vivant Frédéric Jolliot (CEA)
Institut Gustave Roussy, Villejuif
Institut Microbiologie de l'alimentation au service de la santé (Micalis) UMR AgroParisTech INRA
INTEGRARE UMR 951 GENETHON-INSERM UEVE

Interactions cellules souches-niches : physiologie, tumeurs et réparation tissulaire, INSERM 972

Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement, UMR CNRS 8587 - UEVE

LABORATOIRE DE BIOLOGIE ET PHARMACOLOGIE APPLIQUÉE - ENS Paris-Saclay, CNRS INSERM UMR 8113 LBPA
Laboratoire de biologie et pharmacologie appliquée (LBPA) UMR CNRS 8113 -ENS PS
Laboratoire de génétique et biologie cellulaire (LGBC) EA4589 , UVSQ
Laboratoire de recherche européen pour la polyarthrite rhumatoïde - GenHotel, UEVE, Genopole campus 2
Laboratoire de recherche sur les mécanismes moléculaires et pharmacologiques de l’obstruction bronchique (LOBIP) EA220 UVSQ
Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution, Orsay
Laboratoire Evolution, Génomes, Comportement et Ecologie, Gif-sur Yvette
Laboratoire Génétique Quantitative et Évolution, Le Moulon
Laboratoire Genome et Informatique - IBGBI - UEVE
laboratoire IBISC - FRE 3190 CNRS - UEVE - Equipe DYNAMIC-IBGBI
Laboratoire Interactions Cellulaires et Physiologie Hépatique, Orsay
Laboratoire Physico-Chimie des Systèmes Polyphasés - Châtenay Malabry, CNRS UMR 8612,
Laboratoire Structure-Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques - INSERM U829 - EA3637 - UEVE
Lipides, Systèmes analytiques et Biologiques - Chatenay Malabry, EA 7357
LIST Systèmes inteligents, CEA Tech
Modèles de cellules souches malignes et thérapeutiques - Villejuif, INSERM UMR 935
MOLECULAR IMAGING RESEARCH CENTER (MIRCEN), Institut de biologie François Jacob CEA INSERM
Neurobiologie de l'olfaction, INRA
Neurobiologie de l'olfaction, UR1197, INRA Jouy en Josas
Neurobiologie de l’apprentissage, de la mémoire et de la communication - Orsay,INSERM UMR 8620
Petites molécules de neuroprotection, neurogénération et remyélinisation - Bicêtre, INSERM UMR 1195
Physiopathologie et traitement des maladies du foie - Villejuif, INSERM UMR 1193
Qualité des Gamètes et Implantation -A Béclère, EA3538 -
RA CNRS-CEA 2210 Service MIRCen - Fontenay-aux-Roses
Radiothérapie moléculaire - Villejuif, INSERM UMR 1030
réponses cellulaires au microenvironnement et cancer - Villejuif, Inserm UMR-S 1004
Signalisation et physiopathologie cardiovasculaire - Châtenay Malabry, INSERM UMR 1180
Signalisation Hormonale, physiopathologie endocrinienne et métabolique - Bicêtre, INSERM UMR 1185
Stabilité génétique et oncogenèse - IGR - Villejuif, CNRS UMR 8200
Thérapie Génique, Génétique, Epigénétique en neurologie, Endocrinologie et Développement de l'enfant - Bicêtre, INSERM UMR 1169
Unité Imagerie et Modélisation en Neurobiologie et Cancérologie, Orsay".

Le parcours de M1 se construit sur une année. Chaque semestre calendaire peut contenir de 25 à 35 ECTS, mais l'ensemble doit totaliser 60 ECTS sur une année. Les plateformes définissent des ensembles d'UE pédagogiquement cohérents qui se distribuent sur une année universitaire.
La seule UE obligatoire est le "Socle scientifique et méthodologique au premier semestre.
Tous les autres choix d'UE sont libres tant qu'ils respectent les règles suivantes à l'année:
- la majorité des vos ECTS (de 20 à 35) sont choisis dans votre plateforme majeure
- Des UE d'ouverture sont choisies dans les autres plateformes (hors plateforme majeure) pour 15 à 25 ECTS.
- Si vous le souhaitez, des UE supplémentaires (ne comptant pas dans la moyenne) peuvent être ajoutées à votre contrat dans une limite de 5 ECTS par semestre).
Les règles précises sur la construction du parcours individuel sont accessibles via un outil dédié: http://parcours-biologie-sante-paris-saclay.ens-cachan.frfr.

Matières Ects Cours TD TP
Adaptation des génomes à leur environnement 2
Biologie moléculaire et cellulaire appliquées à des modèles viraux 5 5 4 46
Communautés microbiennes 2 15 10
Evolution et biodiversité des microorganismes 5
Microbiologie médicale : thérapeutiques anti-infectieuses et biotechnologies 5 14 12
Méthodes pour la Phylogénie 3 12 12
Réponse immunitaire et stratégie défensive 5 35 15
Virus et génie génétique 5 20 10 25
Matières Ects Cours TD TP
Analyse structurale des biomolécules 2 16 9
Architecture et fonction des macromolécules 5 32 16
Bioinformatique structurale 5
Enzymologie 5 50
Polymères pour la Biologie et applications 2 16 9
Préparation, purification et caractérisation des protéines recombinantes 2 5 20
Protéines membranaires : biochimie et biologie moléculaire 5 70
Matières Ects Cours TD TP
Anglais S1 2,5 ECTS 2 25
Anglais S1 5 ECTS 5
Bioinformatique pour la génomique 2 10 15
Biostatistiques (Orsay) 5 12 12 26
CAPSULE (CAp SUr L'Entreprise) 2 25
Cellular economics 4 15
Ecologie évolutive
Ecologie fonctionnelle 5
Fonctionnement de l'entreprise innovante 5 20 20
Formation expérimentation animale, niveau 2 2
Interactions plantes - microorganismes, de la cellule à l'environnement 5 26 9 9
Introduction aux méthodes d'imagerie 5 26 12 12
Les Mastériales 2 2 30
Masteriales 2 2 30
Outils de la bioinformatique 3 12 12
Modélisation en biologie des populations et des écosystèmes - Orsay 5
Physiologie intégrative végétale 5 20 5 20
Planification d'expériences 2 6 6
Programmation pour la bioinformatique 2 10 15
Systems Biology I 2 16 9
Systems Biology II 2 16 9
TP de biologie végétale 5 0 8 42
Matières Ects Cours TD TP
Approfondissement en immunologie : du fondamental à l'appliqué 2 16 10
Atelier organismes modèles 5 4 46
Biologie du comportement animal 5 43 7
Biosignaling 5 24 16
Endocrinologie moléculaire et cellulaire 5 42
Génétique des pathologies complexes : outils méthodologiques - UEVE 2 12 12
Génétique des pathologies complexes : pratiques expérimentales 2 25
Immunologie approfondie et immunotechnologies 2 16 9
Immunologie fondamentale 2 17 8
Initiation à la biologie vasculaire 2 22 3
Initiation aux neurosciences 5 30 10
Le sang : des cellules souches à la thérapie cellulaire 2
Les bases de l'immunologie 5 25 25
Mécanismes de la différenciation et de la prolifération cellulaire, oncogenèse et stratégies anti-tumorales 5 40 0 0
Neuropharmacologie fondamentale 2 18 7
Neurophysiopathologies 5 40
Nutrition et sécurité sanitaire 2 20 5 0
Physiologie des interactions hôtes pathogènes (approches expérimentales) 5 10 5 30
Physiologie du système immunitaire 2 16 9
Physiopathologie de la reproduction et du déterminisme du sexe 5 24 13 7
Technologie des neurosciences 5 10 40
Workshop on model organisms 5 4 48
Workshop on model organisms (AOM) 2 2 23
Matières Ects Cours TD TP
Base de la différenciation cellulaire et de l'oncogénèse 2 14 10 0
Biologie cellulaire du cytosquelette 5 27 8 15
Biologie moléculaire chez la levure 5 70
Boîtes à outils moléculaires et cellulaires 5 9 25
Contrôle de l'expression génique 5 12 11 20
Devenir cellulaire normal et pathologique (cursus santé Versailles Saint-Quentin uniquement) 2 10 15
Dynamique membranaire et signalisation 5 14 6 28
Génétique humaine 5 36 0 0
Génétique humaine et stabilité des génomes 5 26 24 0
Oncogenèse, signalisation, Cellules souches 5 14 14 22
Régulation de l'expression génique 2 16 9
Signalisation et communication cellulaire 2 16 9
Voies de transduction du signal 5 50
Matières Ects Cours TD TP
Core courses : Genes, proteins and cells 12 56 28 25
Formation préparatoire au tronc commun du master BS 0
Socle scientifique et méthodologique 12 53 57 15

Au second semestre, un stage de recherche, préparé en amont par un Projet scientifique réalisé en immersion dans un laboratoire sont vivement conseillés pour tout étudiant visant une carrière dans la recherche ou la recherche et développement. Le stage peut être réalisé dans une entreprise du secteur privé.

Tous les choix d'UE sont libres tant qu'ils respectent les règles suivantes à l'année:
- la majorité des vos ECTS (de 20 à 35) sont choisis dans votre plateforme majeure
- Des UE d'ouverture sont choisies dans les autres plateformes (hors plateforme majeure) pour 15 à 25 ECTS.
- Si vous le souhaitez, des UE supplémentaires (ne comptant pas dans la moyenne) peuvent être ajoutées à votre contrat dans une limite de 5 ECTS par semestre).
Les règles précises sur la construction du parcours individuel sont accessibles via un outil dédié: http://parcours-biologie-sante-paris-saclay.ens-cachan.fr.

Matières Ects Cours TD TP
Analyse et valorisation de données "omiques" 2 7 18
Anglais S2 2,5 ECTS 2 25
Anglais S2 5 ECTS 5
Biostatistiques (Versailles) 2
Current Questions in Evolution 5 50
Introduction à l'imagerie médicale 5
Nanosciences pour la biologie 2 16 9
Synthetic Biology 2 16 9
Matières Ects Cours TD TP
Animal transgenesis 2 16 9
Apoptose et signalisation 5 2 48
Cancérologie fondamentale et clinique 5 36 14
Development in questions 5 24 26
Développement en questions 5
Dynamique des génomes 2 20 5
Epigenetics 2 15 10
Etats pathologiques de la cellule 2 16 4
Functionnal genomics and precision medicine 2 16 9
Génétique et génomique des populations 2
Génétique moléculaire et cellulaire du développement et de la différenciation 5 30 20
Génomique et pathologies 2 12 7 6
Génomique fonctionnelle 2 25
Génomique fonctionnelle et médecine de précision 2 16 9
Introduction aux Biothérapies 2 8 5 12
Introduction to biotherapies 2 8 5 12
Lipids and membranes in patho-physiology 2 15 10
Physiopathologie de la signalisation 5 33 17 0
Points de contrôle du cycle cellulaire et réparation de l'ADN 5
Trafic intracellulaire 2 14 11
Virologie fondamentale (VFO) 5 35 8
Matières Ects Cours TD TP
Biologie cellulaire des interactions hôte-bactéries invasives 5 24 7 15
Biotechnologies applications exemples 5 5
Génétique et physiologie microbiennes 5 24 18
Integrative microbiology 2 10 10
La paramécie, nouveau modèle d'étude des ciliopathies humaines par ARN interférence 5 10 40
Microbiologie appliquée 5 30
Microbiologie industrielle et alimentaire 5 50
Parasitologie (études des interactions durables) 5 15 35
Virologie fondamentale (VFV) 5 35 8
Virologie moléculaire 2 16 9
Matières Ects Cours TD TP
Biologie de la reproduction 5
Formation pratique en immunologie : immunité acquise 5 15 8 29
Immunologie moléculaire et cellulaire 5 35 15
Immuno-pathophysiology 2 16 9
Immunophysiopathologie 2 16 9
Longévité et vieillissement 5 25 25
Mécanismes en immunopathologie 5
Neuropharmacologie approfondie 2 18 7
Neurosciences intégratives 5 40 10
Nutrition et prévention des grandes pathologies 2 23
Physiologie des régulations 5 33 15 0
Physiologie et biologie intégrées du système cardio-respiratoire 5 35
Physiopathologie endocrinienne 2 21 4
Toxicologie-pharmacologie 2 24 2
Transgénèse animale 2 16 9 0
Matières Ects Cours TD TP
Catalyse enzymatique, mécanismes moléculaires 2 16 9
Internship 10 4
La biologie à l'échelle de la molécule unique et de la cellule unique 2 16 9
Méthodes d'analyse structurale 5 32 16
Outils biotechnologiques 5 38 12
Protéines recombinantes 5 70
Matières Ects Cours TD TP
Projet scientifique / Scientific project 5 4
Scientific project 5 4
Matières Ects Cours TD TP
Stage 10 4
Stage expérimental (cursus Santé KB) 2
Stage expérimental (cursus Santé UVSQ) 5 2
Période(s) de candidatures
Pièces justificatives obligatoires
Pièces justificatives facultatives
  • Dossier VAPP (obligatoire pour toutes les personnes demandant une validation des acquis pour accéder à la formation)

  • Curriculum UE (descriptifs des UE suivies) des deux dernières années

  • Attestation de français (obligatoire pour les non francophones)

Responsable(s) de la formation
HERMAN VAN TILBEURGH - herman.van-tilbeurgh@u-psud.fr
Philippe MINARD - philippe.minard@u-psud.fr