M1 Boris Ephrussi-ENS course

Le niveau de License en Sciences Générales de la Vie, avec une spécialisation en microbiologie. L'étudiant doit avoir en particulier les connaissances de base dans les domaines suivants :

• les structures des bactéries et des virus
• la croissance bactérienne
• le principe de la multiplication virale
• la classification des bactéries et des virus. Des notions sur les mécanismes de virulence des micro-organismes d'intérêt médical et sur les anti-infectieux sont un plus, mais ne sont pas indispensables.

Connaissances en biologie cellulaire et moléculaire.

Les notions de base en Microbiologie : Structures cellulaires et fonctions chez les microorganismes, Microbiologie Générale. Microbiologie appliquée à l'Environnement. Biochimie du métabolisme. La cellule, Unité structurale et fonctionnelle du vivant Biologie cellulaire et moléculaire. Organisation fonctionnelle de la cellule, Démarches et pratiques expérimentales Notions de bio-informatique (facultatif)

notions de base en microbiologie et phylogénie acquises en licence.

• avoir suivi une UE théorique de microbiologie de niveau au moins L3
• avoir des connaissances pratiques et théoriques en biologie cellulaire (notamment données concernant le cytosquelette des cellules eucaryotes animales).

Biologie Cellulaire, Régulation de l'expression des gènes. Techniques de biologie moléculaire et génie génétique

Bases en biologie moléculaire, biochimie et biologie cellulaire.

Pas de pré-requis.

Cet enseignement, consacré à un micro-organisme rarement abordé dans les années universitaires précédentes, constituera avant tout une ouverture sur un système modèle original. Il s'appuie donc essentiellement sur des pré-requis de Licence Générale en Sciences de la Vie : connaissances théoriques en biologie cellulaire (structures des cellules, fonction des organites et cytosquelette) et en génétique, maitrise des techniques expérimentales de base en biologie moléculaire (transformation de plasmides, PCR).

Knowledge base in General Microbiology, Genetics, Molecular and Cell Biology, Biochemistry Open for Paris-Saclay International track

Notions de microbiologie (niveau licence)

Socle de connaissances en biochimie, biologie cellulaire et moléculaire

L'étudiant devra maitriser

• les grandes notions généralistes en physiologie cardiovasculaire (contrôle du débit cardiaque, pression artérielle, système nerveux autonome).
• les grandes notions généralistes en physiologie respiratoire (mécanique ventilatoire, échange gazeux). La connaissance de l'anglais médicale est la bienvenue.

niveau licence en physiologie générale, microbiologie, biologie cellulaire

Il est souhaité de posséder quelques bases sur le rôle du système immunitaire.

Si l'effectif le permet, les étudiants devront manipuler individuellement afin de s'approprier de manière plus efficace les techniques et méthodes abordées dans ce TP. Cela requiert donc une aisance en expérimentation.

none

none

Conseillé mais pas indispensable : avoir des notions de neurobiologie cellulaire et de neurobiologie du comportement.

none

Upstream of this course, students should have acquired the basic bases of Immunology, in particular by having followed the unit "Physiology of the Immune System" (UEVE) or another unit of fundamental immunology (M1 and/or Licence-Bachelor). In particular, students should be able to identify the main cells and molecules involved in immune responses. They should also be able to describe the main physiological mechanisms of innate and adaptive immunity.

En amont de cet enseignement, les étudiants devront avoir acquis en Licence les principales bases fondamentales de l'immunologie. Notamment les étudiants devront être capables d'identifier les cellules sanguines impliquées dans les réponses immunitaires, l'action des molécules telles que les cytokines, la structure histologique des organes lymphoïdes et la coopération cellulaire.

Cette UE aborde des aspects très larges de la biologie allant d'interaction protéique, de signalisation cellulaire, de fonctionnement des neurones jusqu'à la fonction ventilatoire en explorant les interactions entre virus et animal.

Il n'y a donc pas de prérequis particulier, juste d'avoir de bonnes bases dans les différentes disciplines de la biologie.

Architecture fonctionnelle et anatomique du neurone, structure de la membrane plasmique.

Les étudiants devront maîtriser les principes de base de biologie moléculaire et cellulaire, de biochimie, d'enzymologie et de physiologie (vaisseaux, coeur, poumons, cerveau).

Les étudiants devront avoir acquis, en amont de cet enseignement, les bases fondamentales de l'immunologie, notamment en ayant suivi l'UE de "Physiologie du système immunitaire" (UEVE) ou une UE d'immunologie fondamentale dispensée dans d'autres universités en M1 et/ou en Licence. Notamment les étudiants devront être capables de décrire les phénomènes fondamentaux de l'immunologie cellulaire et moléculaire.

Given that the teaching unit is entirely in English, students are required to attest to a B2 level to participate. Placement tests will be conducted by the language department in early September.

Avoir validé une UE de type Biologie Animale et/ou Physiologie animale de niveau licence

Avoir des pré-requis solides en immunologie fondamentale niveau licence ou acquises au travers des UEs d'Immunologie Fondamentale de la première année de master. Savoir utiliser les ressources bibliographiques. Avoir la capacité de faire la synthèse d'un article scientifique. Maîtriser l'anglais scientifique.

Ribas A & Wolchok JD Cancer immunotherapy using checkpoint blockade. Science 359, 1350-55, (2018) Demaria et al. Harnessing innate immunity in cancer therapy Nature 574, 45–56, (2019) Wu et al. Remote control of therapeutic T cells through a small molecule–gated chimeric receptor Science 350, aab4077, (2015) Eil et al Ionic immune suppression within the tumour microenvironment limits T cell effector function Nature 537, 539–543, (2016) Kroemer G & Zitvogel L Cancer immunotherapy in 2017: The breakthrough of the microbiota. Nat Rev Immunol 18, 87-88, (2018)

Students are expected to have a strong background in molecular biology and physiology, including animal reproduction, cell and organ functions, molecular signaling, RNA, DNA and protein structure and functions… notions of microbiology, vegetal biology and organic chemistry will be required too.

Titulaire d'un L3 biologie ou étudiant en médecine admis au cursus biologie-santé.

L'étudiant devra être titulaire d'une Licence générale en Biologie ou équivalence

L'étudiant devra avoir des connaissances en biologie cellulaire et moléculaire et/ou en physiologie.

L'étudiant devra maitriser

• les grandes notions généralistes en physiologie cardiovasculaire (contrôle du débit cardiaque, pression artérielle, système nerveux autonome).
• les grandes notions généralistes en physiologie respiratoire (mécanique ventilatoire, échange gazeux). La connaissance de l'anglais médicale est la bienvenue.

Cette UE s'adresse à des étudiants ayant quelques notions de base en physiologie et anatomie humaine, mais également en biologie cellulaire et en biochimie : les cours sont intégratifs et utilisent des notions de biochimie ou de biologie cellulaire pour expliquer le fonctionnement des systèmes physiologiques.

Les pré-requis correspondent à un bon niveau de Licence générale en Sciences de la vie.

L'admission au sein de l'UE est soumise à une sélection sur dossier.

bases de la physiologie, biologie cellulaire et moléculaire, niveau licence.

Connaissances de base en génétique et en neurobiologie (Suivi de modules de génétique et de neurobiologie en licence).

Pour saisir la globalité de cette UE, il serait préférable que l'étudiant ait des connaissances en Neurobiologie cellulaire et Neuroanatomie qui relèvent d'un niveau de la 3ième année de Licence.

Connaissances de neurobiologie cellulaire et de neuroanatomie fonctionnelle niveau licence 3ième année (voir bibliographie)

En amont de cet enseignement, les étudiants devront avoir acquis les bases fondamentales de l'Immunologie, notamment en ayant suivi l'UE de "Physiologie du Système Immunitaire" (UEVE) ou une autre UE d'immunologie fondamentale de M1 et/ou de Licence. Notamment les étudiants devront être capables d'identifier les principales cellules et molécules impliquées dans les réponses immunitaires. Ils devront aussi être en mesure de décrire succinct ment les principaux mécanismes physiologiques de l'immunité inné et adaptative.

AUCUN

un cycle de conférences et des ateliers/TD à l’attention des étudiants autour du thème du développement durable en lien étroit avec les disciplines de ces deux GS (ex., bilan carbone du développement d’un médicament, de la médecine de précision, d’un plan expérimental et/ou d’un institut de Recherche ; Gestion des épidémies ; Conceptions de systèmes biologiques permettant de fermer les cycles du carbone et de l’azote ; Ecotoxicologie ; Pollution génétique ; Conception de schémas expérimentaux plus « green » ; Gestion

Les objectifs d’apprentissage visés portent à la fois sur 1- le savoir à travers l’élaboration d’une vision intégrée du développement soutenable dans les champs disciplinaires spécifiques des GS (leviers à activer pour limiter l’impact écologique ; gestion des problèmes ; conception de nouvelles solutions pour accompagner la transition), 2- le savoir-faire (élaboration d’un bilan carbone, conception d’un projet), 3- le savoir-être (travail en équipe, adaptabilité, créativité).

Conférences, CM, Ateliers/TD, projet

None

A series of lectures and workshops/DDs for students on the theme of sustainable development, closely linked to the disciplines of these two GS (e.g., carbon assessment of drug development, precision medicine, experimental design and/or research institutes; epidemic management; biological system design to close carbon and nitrogen cycles; ecotoxicology; genetic pollution; design of "greener" experimental schemes; management; etc.).

Learning objectives cover: 1- knowledge, through the development of an integrated vision of sustainable development in specific GS subject areas (levers to be activated to limit ecological impact; problem management; design of new solutions to support the transition), 2- know-how (drawing up a carbon balance sheet, designing a project), 3- interpersonal skills (teamwork, adaptability, creativity).

Conferences, Lectures, Workshops/Tutoring sessions, project

Several first semester optional modules are highly recommended: Systems Biology I Systems Biology II

Aucun pré-requis en bioinformatique, Bonnes connaissances de biologie cellulaire et biologie moléculaire.

Maîtrise de techniques de base en biologie moléculaire (PCR, électrophorèse sur gel d'agarose) et en biochimie (western blot). Bases en outils bioinformatiques pour collecter des informations sur un gène à partir de son numéro d'accession.

The ability to use Matlab will be an asset but is not a prerequisite

aucun

Notions de probabilité, statistique descriptive, échantillonnage et tests d'hypothèses

Connaissances de base des grandes fonctions métaboliques de plantes (métabolismes primaires : photosynthèse, respiration, photorespiration, assimilation de l'azote, etc). Notions de bonnes pratiques de laboratoire (TPs).

En amont de cet enseignement, les étudiants devront avoir acquis en Licence (L1, L2, L3), les bases fondamentales de biologie cellulaire, physiologie, biochimie et/ou bio-informatique.

Aucun

Bases de connaissances niveau Licence en Sciences de la vie sur la biologie des microorganismes (champignons, bactéries, virus) et des plantes, ainsi qu'en biologie moléculaire et génétique.

Aucun pré requis n'est demandé

aucun

Il n'y a pas de pré-requis, cet enseignement s'adresse à tous les étudiants de biologie, indépendamment de la mention de master à laquelle ils appartiennent. Bien évidemment, cela inclus également les étudiants qui se trouvent à l'interface entre la biologie et d'autres disciplines telles que la physique, la chimie, les mathématiques et l'informatique.

Several first semester optional modules are highly recommended: Systems Biology I Systems Biology II Cellular Economics

Maîtrise des outils de bureautique classiques, aucun prérequis en programmation informatique.

La motivation

être inscrit en M1 ou équivalent UE ouverte aux biologistes, médecins, physiciens

This course is intended for all students in Biology, regardless their master's speciality, as well as for students who are at the interface between Biology and other disciplines such as Physics, Chemistry, Mathematics, Physics and Computer Sciences. The goal is to provide all Master-1 students with a general culture in Evolution. This course will also be available to PhD students depending on available places.

Connaissance des outils bureautiques.

• Niveau B1+ ou B2 du CECRL (Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues).
• Etre familiarisé avec l'anglais scientifique

Students are expected to have a strong background in molecular biology and physiology, including animal reproduction, cell and organ functions, molecular signaling, RNA, DNA and protein structure and functions… notions of microbiology, vegetal biology and organic chemistry will be required too.

Génétique et Biologie Moléculaire niveau L3

Avoir acquis les bases de biochimie et de biologie cellulaire des membranes enseignées en L3 : organisation générale des membranes, notions sur les différents types de protéines membranaires présents au sein des membranes et sur leurs fonctions. Capacité à travailler en groupe.

Les étudiants doivent avoir suivi des enseignements de biologie cellulaire et connaitre le fonctionnement général d'une cellule eucaryote et de ses organites. Ils doivent aussi connaitre les techniques permettant d'étudier le fonctionnement cellulaire telles que par exemple la microscopie, le fractionnement cellulaire, le Western-Blot, etc…

Licence générale en Sciences de la vie

avoir fait un L3 biologie santé

Connaissance de niveau licence en biologie du développement, en biologie moléculaire et cellulaire et en génétique.

background in formal genetics

Requires initial training in Immunology and cell biology

Bases de la génétique formelle et bases de la biologie moléculaire

En amont de cet enseignement, les étudiants devront avoir acquis en Licence (L1, L2, L3), les bases fondamentales de biologie cellulaire, physiologie et biochimie.

Avoir acquis les bases de biologie moléculaire des eucaryotes (ADN, ARN, Protéine, Transcription, Epissage, dégradation des ARN et Traduction).

Connaissances de base en biologie moléculaire et génétique formelle.

Les prérequis sont une connaissance des bases moléculaires du génome humain, de la structure et l'expression des gènes, des bases moléculaires du mode de transmission des maladies génétiques.

L3 levels in cell biology (cellular and nuclear structure), genetics (mendelian inheritance) and molecular biology (gene regulation) are requested. In addition, notions of genomics, high-throughput sequencing methods and epigenetic mechanisms developed in the Master 1 core course should be understood and comprehended.

Prerequisites: No specific prerequisites in developmental Biology are required. Fundamentals of Genetics, Cell Biology, Cell Signaling and Biochemistry acquired during the core courses will be exploited in the context of the developing organism.

Pour bénéficier pleinement des enseignements de cette UE, les étudiants doivent maitriser les bases de:

• la génétique formelle et moléculaire
• la génomique fonctionnelle

aucun en particulier

Bases en biologie moléculaire, biochimie et biologie cellulaire.

Avoir acquis les bases de biochimie et de biologie cellulaire des membranes enseignées en L3 : organisation générale des membranes, notions sur les différents types de protéines membranaires présents au sein des membranes et sur leurs fonctions. Capacité à travailler en groupe.

Les connaissances acquises au cours de l'UE Socle scientifique du Master Biologie-Santé permettent d'avoir les bases nécessaires pour pouvoir suivre cette UE.

Having acquired the basics of biochemistry and cell biology of membranes: general organization membranes, notions on the different types of membrane proteins present in membranes and on their functions. Ability to work in a group.

Des bases solides en génétique sont requises, d'une part pour les aspects mathématiques d'analyse génétiques (statistiques, phylogénie), et d'autre part pour les aspects moléculaires de l'organisation de l'information génétique et de son expression.

L3 Chimie / L3 SDV avec notions de chimie organique + Tronc commun (M1 chimie)

Décrire, nommer, identifier les principaux lipides membranaires et comparer leurs caractéristiques. Reconnaître et représenter la topologie d'une protéine membranaire ; définir les principales caractéristiques structurales des protéines membranaires, illustrer et expliquer les méthodes d'études de base des protéines membranaires.

-Savoir définir les termes de catalyse, enzyme, substrat, produit de réaction, cinétique, inhibiteur compétitif et non compétitif -Savoir écrire les équations régissant les interactions protéine-ligand (hyperbole de saturation, Scatchard) et les appliquer

Les étudiants doivent connaitre -Les propriétés des acides aminés -La structure des protéines

-les étudiants doivent connaître

• les structures et propriétés physico-chimiques des acides aminés et les nucléotides
• l'organisation de la structure covalente et chimique des protéines et acides nucléiques
• les bases de l'organisation de la structure

Savoir définir les principales caractéristiques structurales des protéines. Savoir Illustrer et expliquer les méthodes de base pour l'étude des protéines Savoir décrire les principes de base pour l'expression de protéines recombinantes chez E. coli

-Biochimie des protéines: structure des acides aminés et des protéines, méthodes de purification et d'analyse des protéines, bases de la cinétique enzymatique -Bases de biologie moléculaires, structures et méthode d'études des acides nucléiques, réplicat

-Les bases élémentaires de l'électromagnétisme et avoir quelques notions de physique ondulatoire -Les propriétés des acides aminés et la structure des protéines -Les nombres complexes

Structure des biomolécules

UE du Socle Commun et UE du Tronc Commun Etablissement

UE du Socle Commun et UE du Tronc Commun Etablissement

Le niveau de License en Sciences Générales de la Vie, avec une spécialisation en microbiologie. L'étudiant doit avoir en particulier les connaissances de base dans les domaines suivants :

• les structures des bactéries et des virus
• la croissance bactérienne
• le principe de la multiplication virale
• la classification des bactéries et des virus. Des notions sur les mécanismes de virulence des micro-organismes d'intérêt médical et sur les anti-infectieux sont un plus, mais ne sont pas indispensables.