[{"command":"insert","method":null,"selector":".course-modal-ajax-placeholder-976670","data":"\u003Cdiv class=\u0022container content-rte\u0022\u003E\n  \u003Cdiv class=\u0022row\u0022\u003E\n    \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6 bg-primary text-white\u0022\u003E\n      \u003Ch2 class=\u0022h1 text-left\u0022\u003E  Les sciences -omiques : applications en biologie et biotechnologies\n\u003C\/h2\u003E\n                  \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EECTS :\n          6\n        \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n                  \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ESemestre calendaire :\n          Semestre 1\n        \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n            \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ED\u00e9tail du volume horaire\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ECours magistraux :\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E10\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ETravaux pratiques :\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E18\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ETravaux dirig\u00e9s :\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E6\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003EProjet tutor\u00e9\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E6\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                              \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003EApprentissage autonome :\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E10\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ELangue d\u0026#039;enseignement\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003EFran\u00e7ais\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EEnseignement \u00e0 distance\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003Enon\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n    \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6\u0022\u003E\n            \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EPr\u00e9requis\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003ELes \u00e9tudiants doivent poss\u00e9der des bases solides en biologie mol\u00e9culaire et cellulaire, en g\u00e9n\u00e9tique et microbiologie, ainsi que des connaissances de bases en bio-informatique (notions de s\u00e9quences et base de donn\u00e9es)\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EProgramme \/ plan \/ contenus\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003ELe programme abordera\u0026nbsp;:\u003C\/p\u003E\n\u003Cul\u003E\n\u003Cli\u003Eun panorama des sciences \u00ab\u0026nbsp;-omiques\u0026nbsp;\u00bb (g\u00e9nomique et post-g\u00e9nomiques) \u00e0 diff\u00e9rentes \u00e9chelles, du g\u00e9notype au ph\u00e9notype, incluant les interactions et les r\u00e9seaux m\u00e9taboliques\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003Eles diff\u00e9rentes technologies de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut-d\u00e9bit, et la production de donn\u00e9es massives\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003Eles outils d\u2019analyses de g\u00e9nomique comparative et fonctionnelle illustr\u00e9s par des applications concr\u00e8tes issues de travaux de recherche\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003El\u2019int\u00e9gration des donn\u00e9es multi-omiques pour \u00e9tudier les syst\u00e8mes biologiques et d\u00e9velopper des applications biotechnologiques innovantes dans les domaines de la sant\u00e9, de l\u2019environnement et de l\u2019industrie\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003C\/ul\u003E\n\u003Cp\u003EL\u2019\u00e9valuation se fera par une restitution orale en bin\u00f4me ou trin\u00f4me sur une synth\u00e8se critique d\u2019articles scientifiques en lien avec des applications biotechnologies en sant\u00e9 ou en environnement et un compte-rendu individuel du mini projet bio-informatique.\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EObjectifs d\u0026#039;apprentissage\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003E:\u0026nbsp;L\u2019av\u00e8nement de la g\u00e9nomique a permis l\u2019\u00e9mergence d\u2019une nouvelle \u00e8re de recherche fond\u00e9e sur les sciences \u00ab omiques \u00bb, qui contribuent actuellement aux avanc\u00e9es consid\u00e9rables men\u00e9es dans la compr\u00e9hension de la structure et du fonctionnement du vivant, dans son ensemble, et ce au niveau de tous les domaines des Sciences de la Vie (sant\u00e9 humaine et animale, sant\u00e9 des plantes, microbiologie, g\u00e9n\u00e9tique et \u00e9cologie\u2026). Les technologies \u00ab omiques \u00bb et l\u2019\u00e9mergence r\u00e9cente des nouvelles m\u00e9thodes de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut d\u00e9bit (NGS), de plus en plus puissantes, permettent de g\u00e9n\u00e9rer des quantit\u00e9s massives de donn\u00e9es (\u00ab big data \u00bb) \u00e0 des niveaux biologiques multiples : du s\u00e9quen\u00e7age des g\u00e8nes \u00e0 l\u2019expression des prot\u00e9ines et des structures m\u00e9taboliques, en allant m\u00eame jusqu\u2019au ph\u00e9notypage. Ces donn\u00e9es qui peuvent couvrir tout le fonctionnement des syst\u00e8mes biologiques visent \u00e0 apporter des connaissances sur la diversit\u00e9, la pr\u00e9sence et le r\u00f4le des organismes dans leur habitat, mais aussi \u00e0 identifier les interactions qu\u2019ils peuvent avoir entre eux et avec leur environnement. L\u2019investigation de ces \u00ab big data \u00bb par des outils bio-informatiques performants s\u2019inscrit aujourd\u2019hui comme de nouveaux outils de diagnostic pour de multiples secteurs de la recherche et de l\u2019industrie. Ils apportent des informations pr\u00e9cieuses et exhaustives, donnant acc\u00e8s \u00e0 de nouvelles ressources d\u2019int\u00e9r\u00eat. Par cons\u00e9quent, les sciences \u00ab omiques \u00bb ouvrent des perspectives strat\u00e9giques d\u2019avenir devenues incontournables en biologie mais aussi dans le d\u00e9veloppement des biotechnologies, notamment en termes d\u2019innovation (ing\u00e9nierie m\u00e9tabolique, strat\u00e9gie de bio-rem\u00e9diation, bio-pr\u00e9servation).\u003C\/p\u003E\n\u003Cp\u003EL\u2019unit\u00e9 vise donc \u00e0 permettre aux \u00e9tudiants de\u0026nbsp;:\u003C\/p\u003E\n\u003Cul\u003E\n\u003Cli\u003Ecomprendre les concepts fondamentaux des technologies \u00ab\u0026nbsp;omiques\u0026nbsp;\u00bb et leur int\u00e9r\u00eat en recherche fondamentale et appliqu\u00e9e\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003E\u0026nbsp;exploiter des donn\u00e9es massives \u00e0 l\u2019aide d\u2019outils bio-informatique et biostatistique\u0026nbsp;;\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003Er\u00e9aliser un mini-projet d\u2019analyse de donn\u00e9es exp\u00e9rimentales et d\u2019interpr\u00e9ter les r\u00e9sultats dans un contexte scientifique et biotechnologique\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003Er\u00e9aliser une analyse critique de publications scientifiques utilisant des donn\u00e9es NGS.\u003C\/li\u003E\n\u003C\/ul\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EOrganisation g\u00e9n\u00e9rale et modalit\u00e9s p\u00e9dagogiques\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003EL\u2019enseignement sera d\u00e9livr\u00e9 principalement sous forme de cours, de conf\u00e9rence et TD\/TP d\u2019application. Pour prendre conscience de l\u2019importance et de l\u2019utilit\u00e9 des analyses \u003Cem\u003Ein silico,\u003C\/em\u003E les \u00e9tudiants seront initi\u00e9s aux outils bio-informatiques (assemblage, annotation, recherche de fonctions, requ\u00eate dans les bases de donn\u00e9es de r\u00e9f\u00e9rence) d\u00e9di\u00e9s \u00e0 l\u2019exploitation des donn\u00e9es g\u00e9nomiques \u00e0 travers d\u2019un mini-projet sur des jeux de donn\u00e9es exp\u00e9rimentaux. Une vision concr\u00e8te des diff\u00e9rentes facettes de la bio-informatique en appui \u00e0 des programmes de recherche fondamentale et appliqu\u00e9e sera illustr\u00e9e par des cas d\u0027\u00e9tudes concrets au travers des projets men\u00e9s par les responsables (RNAseq, donn\u00e9es prot\u00e9omiques). Un assemblage \u003Cem\u003Ede novo\u003C\/em\u003E \u00e0 partir de fragments d\u2019ADN s\u00e9quenc\u00e9s (~250 pb) obtenus par la technologie NGS \u00e0 l\u2019aide d\u2019outils mis \u00e0 disposition sur le portail Galaxy de la plateforme bio-informatique Migale (Jouy-en-Josas), et une analyse comparative de donn\u00e9es g\u00e9nomiques sur des voies m\u00e9taboliques d\u2019int\u00e9r\u00eat biotechnologique \u00e0 l\u2019aide du pipeline d\u2019analyse IMG\/M (Integrated Microbial Genomes and Microbiomes, USA) vous seront demand\u00e9s\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n                                \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ENature de l\u0026#039;\u00e9valuation\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003EEvaluation Continue non Int\u00e9grale\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n  \u003C\/div\u003E\n\u003C\/div\u003E\n","settings":null}]