[{"command":"insert","method":null,"selector":".course-modal-ajax-placeholder-956894","data":"\u003Cdiv class=\u0022container content-rte\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022row\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6 bg-primary text-white\u0022\u003E\n \u003Ch2 class=\u0022h1 text-left\u0022\u003E Bioinformatique structurale 2\n\u003C\/h2\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EECTS :\n 3\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ESemestre calendaire :\n Semestre 2\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ED\u00e9tail du volume horaire\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ECours magistraux :\u003C\/span\u003E\n \u003Cspan\u003E10\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ETravaux pratiques :\u003C\/span\u003E\n \u003Cspan\u003E11\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ELangue d\u0026#039;enseignement\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003EFran\u00e7ais\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EEnseignement \u00e0 distance\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003Enon\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EPr\u00e9requis\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003E\u003Cul\u003E\n\u003Cli\u003Ebases de la biologie structurale (structure 2D et 3D des prot\u00e9ines)\u003C\/li\u003E\n\u003Cli\u003Ebases de la bioinformatique structurale (en termes de m\u00e9thodes\/outils : pr\u00e9diction de structure secondaire, utilisation de pymol, blast, alignements multiples de s\u00e9quences, en termes\u003C\/li\u003E\n\u003C\/ul\u003E\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EProgramme \/ plan \/ contenus\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003EDans cette UE nous verrons les approches de bioinformatique structurale et de mod\u00e9lisation mol\u00e9culaire pour la mod\u00e9lisation des structures 3D des prot\u00e9ines et de leurs assemblages. Nous pr\u00e9senterons les m\u00e9thodes de mod\u00e9lisation par homologie, de docking mol\u00e9culaire (template-based et ab initio) puis quelques applications du docking mol\u00e9culaire en biologie. Une partie th\u00e9orique (CM) pr\u00e9sentera les concepts et les m\u00e9thodes et une partie pratique (TP) permettra aux \u00e9tudiants de s\u0027approprier les outils existants, analyser les r\u00e9sultats avec leurs propres outils (d\u00e9velopp\u00e9s dans l\u0027UE de programmation python) puis les interpr\u00e9ter. Nous aborderons en fin de programme, comment s\u0027articulent les \u00e9chelles atomiques et syst\u00e9miques sur un exemple concret : \u00e9tude des contraintes exerc\u00e9es par la concentration cellulaire sur les propri\u00e9t\u00e9s de surface du prot\u00e9ome.\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EObjectifs d\u0026#039;apprentissage\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003ESavoir construire un mod\u00e8le 3D de prot\u00e9ine par homologie.\u003Cbr\u003E\nR\u00e9aliser un docking prot\u00e9ine-prot\u00e9ine et analyser les r\u00e9sultats.\u003Cbr\u003E\nSavoir manipuler et analyser les propri\u00e9t\u00e9s des interfaces et surfaces prot\u00e9iques en utilisant ses propres outils et en identifiant les autres outils disponibles.\u003Cbr\u003E\nConna\u00eetre les d\u00e9terminants mol\u00e9culaires de la sp\u00e9cificit\u00e9 des interactions prot\u00e9ine-prot\u00e9ine et prot\u00e9ine-acide nucl\u00e9ique.\u003Cbr\u003E\nComprendre les relations\/l\u0027articulation entre deux \u00e9chelles diff\u00e9rentes (atomique et syst\u00e9mique) dans l\u0027\u00e9volution des structures des prot\u00e9ines et de leurs assemblages.\u003Cbr\u003E\nApprendre \u00e0 chercher l\u0027information dans les bases de donn\u00e9es puis \u00e0 la traiter avec ses propres outils.\u003Cbr\u003E\nApprendre \u00e0 synth\u00e9tiser et pr\u00e9senter ses r\u00e9sultats\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ENature de l\u0026#039;\u00e9valuation\u003C\/div\u003E\n \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n \u003Cspan\u003EEvaluation Continue non Int\u00e9grale\u003C\/span\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n \u003C\/div\u003E\n\u003C\/div\u003E\n","settings":null}]