[{"command":"insert","method":null,"selector":".course-modal-ajax-placeholder-955872","data":"\u003Cdiv class=\u0022container content-rte\u0022\u003E\n  \u003Cdiv class=\u0022row\u0022\u003E\n    \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6 bg-primary text-white\u0022\u003E\n      \u003Ch2 class=\u0022h1 text-left\u0022\u003E  Analyse d\u0026#039;Images en Biologie\n\u003C\/h2\u003E\n                  \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EECTS :\n          2\n        \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n                  \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ESemester:\n          Semestre 1\n        \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n            \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ED\u00e9tail du volume horaire\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003ELecture:\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E8\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                          \u003Cspan class=\u0022field__label h4 mt-5 \u0022\u003EPractical study :\u003C\/span\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E12\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                                                                          \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ELangue d\u0026#039;enseignement\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003EFran\u00e7ais\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EEnseignement \u00e0 distance\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003Enon\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n    \u003Cdiv class=\u0022box col-md-6\u0022\u003E\n            \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EPr\u00e9requis\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003EAucun\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EProgramme \/ plan \/ contenus\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003E\u003Cstrong\u003ED\u00e9crire et expliquer les bases th\u00e9oriques de l\u2019image num\u00e9rique et de son interpr\u00e9tation\u003C\/strong\u003E :\u0026nbsp;\u003Cbr\u003E\n1. Byte, bit, pixel, formats d\u2019image, rang dynamique, histogramme, LUTs, op\u00e9rations math\u00e9matiques sur les images.\u003Cbr\u003E\n2. \u00c9chantillonnage\u003Cbr\u003E\n3. Espace de Fourier, op\u00e9rations dans l\u0027espace des fr\u00e9quences.\u003Cbr\u003E\n4. Segmentation, types de bruit et filtres (espace r\u00e9el et Fourier)\u003Cbr\u003E\n5. Projection et r\u00e9troprojection\u003Cbr\u003E\n6. Visualisation 3D, utilisation d\u2019ImageJ (Fiji), utilisation de plug-in, programmation Macro\u003Cbr\u003E\n7. Convolution et corr\u00e9lation\u003Cbr\u003E\n\u003Cstrong\u003EExtraire des donn\u00e9es quantitatives de l\u2019image :\u003C\/strong\u003E\u0026nbsp;\u003Cbr\u003E\n1. Segmentation par seuillage et introduction aux approches d\u0027apprentissage profond pour la segmentation\u003Cbr\u003E\n2. Densitom\u00e9trie\u003Cbr\u003E\n3. Granulom\u00e9trie\u003Cbr\u003E\n\u003Cstrong\u003ETraiter et analyser les signaux :\u003C\/strong\u003E\u003Cbr\u003E\n1. Signaux p\u00e9riodiques (cristaux 2D et\/ou structures empil\u00e9es - h\u00e9lices). Calcul de param\u00e8tres de signaux p\u00e9riodiques\u003Cbr\u003E\n2. Rapport signal sur bruit, contrastes, entropie\u003Cbr\u003E\n3. D\u00e9bruitage\u003Cbr\u003E\n\u003Cstrong\u003ER\u00e9aliser des reconstructions 3D \u00e0 partir de projections :\u003C\/strong\u003E\u003Cbr\u003E\n1. Algorithmes de reconstruction en imagerie : th\u00e9or\u00e8me de la section central, r\u00e9troprojection dans l\u2019espace de Fourier, r\u00e9troprojection pond\u00e9r\u00e9e, techniques de reconstruction alg\u00e9briques.\u003Cbr\u003E\n2. Effets du sous-\u00e9chantillonnage et du manque d\u2019information.\u003Cbr\u003E\n\u003Cstrong\u003EAutomatiser des t\u00e2ches par programmation Macro\u003C\/strong\u003E\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EObjectifs d\u0026#039;apprentissage\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003ELe but g\u00e9n\u00e9ral est de permettre aux \u00e9tudiants de comprendre et d\u2019analyser l\u2019information\u003Cbr\u003E\ncontenue dans des images obtenues par diff\u00e9rentes techniques d\u0027imagerie, utilis\u00e9es en\u003Cbr\u003E\nbiologie (CAT-SCAN, AFM, microscopies photoniques et \u00e9lectroniques, etc.).\u003Cbr\u003E\nLes \u00e9tudiants deviennent familiers de la manipulation d\u0027images num\u00e9riques et des m\u00e9thodes\u003Cbr\u003E\npour leur traitement et leur analyse quantitative. Ils d\u00e9veloppent un esprit critique sur les\u0026nbsp;\u003Cbr\u003E\ninformations qui peuvent \u00eatre obtenues \u00e0 partir des images num\u00e9riques et sur les artefacts\u003Cbr\u003E\nqui peuvent appara\u00eetre pendant leur traitement et leur analyse. Ils pourront ainsi interpr\u00e9ter\u003Cbr\u003E\ncorrectement, extraire et quantifier les informations contenues dans les images biologiques.\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EOrganisation g\u00e9n\u00e9rale et modalit\u00e9s p\u00e9dagogiques\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003EEnseignement fil\u00e9 (1 s\u00e9ance par semaine sur une p\u00e9riode de 6 semaines).\u003Cbr\u003E\nChaque nouveau concept sera imm\u00e9diatement mis en pratique sur des exemples \u00e0 l\u0027aide d\u0027ordinateurs et des logiciels ImageJ et Fiji.\u003Cbr\u003E\nM\u00e9thodologie d\u0027apprentissage actif (Jean Piaget, John Dewey et Kurt Lewin) en combinant des m\u00e9thodes p\u00e9dagogiques ma\u00efeutiques, le d\u00e9bat (Oscar Brenifier) et l\u0027apprentissage en spirale (J.C. Bruner)\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003EBibliographie\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003E\u003Cp\u003EDigital Image Processing, W. Burger and M.J. Burge, Springer (2nd Edition)\u003C\/p\u003E\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n        \u003Cdiv class=\u0022field-spacing\u0022\u003E\n      \u003Cdiv class=\u0022field__label h3 dash\u0022\u003ENature de l\u0026#039;\u00e9valuation\u003C\/div\u003E\n                        \u003Cdiv class=\u0022mt-5 text-justify\u0022\u003E\n                                      \u003Cspan\u003EEvaluation Continue non Int\u00e9grale\u003C\/span\u003E\n                      \u003C\/div\u003E\n                  \u003C\/div\u003E\n      \u003C\/div\u003E\n  \u003C\/div\u003E\n\u003C\/div\u003E\n","settings":null}]